MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c plasmid pXF51

Total Repeats: 704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002490	TAA	2	6	19	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002490	TAA	2	6	70	75	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10956712
3	NC_002490	ACA	2	6	234	239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956712
4	NC_002490	TCC	2	6	289	294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10956712
5	NC_002490	GCC	2	6	310	315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_002490	TCT	2	6	332	337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002490	TTG	2	6	355	360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002490	CAT	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002490	CAC	2	6	422	427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_002490	CGG	2	6	545	550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956713
11	NC_002490	ACA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956713
12	NC_002490	GCT	2	6	723	728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956713
13	NC_002490	GAC	2	6	777	782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956713
14	NC_002490	ACA	2	6	814	819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956713
15	NC_002490	CTT	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10956713
16	NC_002490	CAA	2	6	869	874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956713
17	NC_002490	TGA	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956714
18	NC_002490	TGC	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956714
19	NC_002490	GCA	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956714
20	NC_002490	GCG	2	6	1396	1401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956714
21	NC_002490	TGG	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10956714
22	NC_002490	CTG	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956714
23	NC_002490	GCG	2	6	1604	1609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956714
24	NC_002490	TGC	3	9	1683	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956714
25	NC_002490	GTC	2	6	1714	1719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956714
26	NC_002490	CCG	2	6	1753	1758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956714
27	NC_002490	CAC	2	6	1767	1772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956714
28	NC_002490	CCA	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956714
29	NC_002490	CGC	2	6	1833	1838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956714
30	NC_002490	GGC	2	6	2148	2153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956714
31	NC_002490	CGG	2	6	2163	2168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956714
32	NC_002490	GTC	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956714
33	NC_002490	GAA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956714
34	NC_002490	GCC	2	6	2355	2360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956714
35	NC_002490	GAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956714
36	NC_002490	CGC	2	6	2430	2435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956714
37	NC_002490	CAT	2	6	2436	2441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956714
38	NC_002490	ACA	2	6	2444	2449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956714
39	NC_002490	TTG	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10956714
40	NC_002490	GAA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956714
41	NC_002490	GCG	2	6	2721	2726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956714
42	NC_002490	GGC	2	6	2800	2805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956714
43	NC_002490	AAG	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956714
44	NC_002490	ATT	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10956715
45	NC_002490	AAG	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956715
46	NC_002490	CAC	2	6	3254	3259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956715
47	NC_002490	GCA	2	6	3276	3281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956715
48	NC_002490	GCC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956715
49	NC_002490	CAA	2	6	3419	3424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002490	CCG	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956716
51	NC_002490	GCC	2	6	3497	3502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956716
52	NC_002490	ATC	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956716
53	NC_002490	ATC	3	9	3638	3646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956716
54	NC_002490	CAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956716
55	NC_002490	TCA	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956717
56	NC_002490	CCA	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956717
57	NC_002490	GAA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956718
58	NC_002490	TGT	2	6	4183	4188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10956718
59	NC_002490	GCG	2	6	4235	4240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956718
60	NC_002490	CGG	2	6	4323	4328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956718
61	NC_002490	ACG	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956718
62	NC_002490	GTT	2	6	4469	4474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10956718
63	NC_002490	CAG	2	6	4519	4524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956718
64	NC_002490	CAA	2	6	4544	4549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956718
65	NC_002490	GAA	2	6	4559	4564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956718
66	NC_002490	GTT	2	6	4571	4576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10956718
67	NC_002490	TCA	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956718
68	NC_002490	GCT	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956718
69	NC_002490	TTG	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10956718
70	NC_002490	GGC	2	6	4778	4783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956718
71	NC_002490	GCA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956718
72	NC_002490	TGA	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956718
73	NC_002490	ATG	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956718
74	NC_002490	GAC	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956718
75	NC_002490	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956718
76	NC_002490	GAA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956718
77	NC_002490	ATG	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956718
78	NC_002490	CTG	2	6	5504	5509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956718
79	NC_002490	TAC	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956718
80	NC_002490	TCA	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956718
81	NC_002490	AGC	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956718
82	NC_002490	ACG	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956718
83	NC_002490	CGC	2	6	6053	6058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956718
84	NC_002490	TGA	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956718
85	NC_002490	ATC	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956718
86	NC_002490	GAT	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956718
87	NC_002490	TCG	2	6	6465	6470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956718
88	NC_002490	TGA	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956719
89	NC_002490	GAA	2	6	6672	6677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956719
90	NC_002490	CTG	2	6	6773	6778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956719
91	NC_002490	TGC	2	6	6888	6893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956719
92	NC_002490	AAC	2	6	7024	7029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956719
93	NC_002490	TGA	2	6	7085	7090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956719
94	NC_002490	CAA	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956719
95	NC_002490	GTC	2	6	7226	7231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_002490	TGA	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002490	ATG	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002490	GGT	2	6	7493	7498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10956720
99	NC_002490	GTC	2	6	7508	7513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002490	TGA	2	6	7549	7554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956721
101	NC_002490	ATG	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956721
102	NC_002490	GGT	2	6	7767	7772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10956721
103	NC_002490	GTG	2	6	7784	7789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10956721
104	NC_002490	CCG	2	6	7882	7887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956722
105	NC_002490	CAT	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956722
106	NC_002490	ACC	2	6	7920	7925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956722
107	NC_002490	GAT	2	6	7961	7966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10956722
108	NC_002490	GGT	2	6	8118	8123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10956722
109	NC_002490	CTA	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956722
110	NC_002490	GGC	2	6	8270	8275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956722
111	NC_002490	TCA	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956722
112	NC_002490	TTC	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10956722
113	NC_002490	CGG	3	9	8452	8460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10956722
114	NC_002490	GCA	2	6	8677	8682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956722
115	NC_002490	CAA	2	6	8720	8725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956722
116	NC_002490	CAA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956722
117	NC_002490	AAG	2	6	8846	8851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002490	CCT	2	6	8890	8895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_002490	ATA	2	6	8905	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002490	CAG	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15426424
121	NC_002490	ACT	2	6	9184	9189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956723
122	NC_002490	TGG	2	6	9255	9260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10956723
123	NC_002490	AAC	2	6	9360	9365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956723
124	NC_002490	ACG	2	6	9415	9420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956723
125	NC_002490	TAC	2	6	9495	9500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956723
126	NC_002490	ACG	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956723
127	NC_002490	CTG	2	6	9547	9552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956723
128	NC_002490	CGC	2	6	9577	9582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956723
129	NC_002490	AAG	2	6	9672	9677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956723
130	NC_002490	ACA	2	6	9850	9855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10956723
131	NC_002490	CGC	2	6	9868	9873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956723
132	NC_002490	GCC	2	6	9909	9914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956723
133	NC_002490	TCG	2	6	10076	10081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956724
134	NC_002490	ATC	2	6	10217	10222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956724
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138	NC_002490	GCA	2	6	10471	10476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956724
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259	NC_002490	TTA	2	6	18328	18333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_002490	GCT	2	6	18504	18509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956730
261	NC_002490	CGA	2	6	18540	18545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956730
262	NC_002490	AGA	2	6	18588	18593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10956730
263	NC_002490	GTT	2	6	18684	18689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10956730
264	NC_002490	GAC	2	6	18721	18726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956730
265	NC_002490	GCA	2	6	18744	18749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956730
266	NC_002490	CTT	2	6	18814	18819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10956730
267	NC_002490	CAC	2	6	18944	18949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_002490	GCC	2	6	18976	18981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956731
269	NC_002490	TCT	2	6	19005	19010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10956731
270	NC_002490	CCA	2	6	19142	19147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10956731
271	NC_002490	CAG	2	6	19151	19156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956731
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275	NC_002490	ATC	2	6	19351	19356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956732
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282	NC_002490	TCG	2	6	19701	19706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956733
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285	NC_002490	CGC	2	6	19903	19908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10956734
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288	NC_002490	GGC	2	6	20209	20214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_002490	TTA	2	6	20254	20259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_002490	ATA	2	6	20406	20411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_002490	AGC	2	6	20503	20508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10956735
292	NC_002490	GCT	2	6	20526	20531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956735
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297	NC_002490	GAT	2	6	21298	21303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_002490	TTA	2	6	21324	21329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_002490	ATA	2	6	21339	21344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_002490	TGG	2	6	21400	21405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
301	NC_002490	GGT	2	6	21548	21553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
302	NC_002490	TCA	2	6	21589	21594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_002490	TGG	2	6	21613	21618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_002490	TAA	2	6	23580	23585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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368	NC_002490	CAT	2	6	26098	26103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10956744
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381	NC_002490	TTG	2	6	27223	27228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10956747
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