MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c plasmid pXF51

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002490	GT	3	6	256	261	0 %	50 %	50 %	0 %	10956712
2	NC_002490	GC	3	6	463	468	0 %	0 %	50 %	50 %	10956713
3	NC_002490	CA	3	6	479	484	50 %	0 %	0 %	50 %	10956713
4	NC_002490	GC	3	6	901	906	0 %	0 %	50 %	50 %	10956713
5	NC_002490	CG	3	6	2089	2094	0 %	0 %	50 %	50 %	10956714
6	NC_002490	GC	3	6	2323	2328	0 %	0 %	50 %	50 %	10956714
7	NC_002490	CG	3	6	2564	2569	0 %	0 %	50 %	50 %	10956714
8	NC_002490	CA	3	6	3723	3728	50 %	0 %	0 %	50 %	10956717
9	NC_002490	GT	3	6	3801	3806	0 %	50 %	50 %	0 %	10956717
10	NC_002490	AC	3	6	5928	5933	50 %	0 %	0 %	50 %	10956718
11	NC_002490	GC	3	6	8572	8577	0 %	0 %	50 %	50 %	10956722
12	NC_002490	TC	3	6	9122	9127	0 %	50 %	0 %	50 %	15426424
13	NC_002490	GC	3	6	11629	11634	0 %	0 %	50 %	50 %	10956725
14	NC_002490	CG	3	6	11803	11808	0 %	0 %	50 %	50 %	10956725
15	NC_002490	TC	3	6	11902	11907	0 %	50 %	0 %	50 %	10956725
16	NC_002490	AT	3	6	12217	12222	50 %	50 %	0 %	0 %	10956726
17	NC_002490	GC	3	6	13059	13064	0 %	0 %	50 %	50 %	10956726
18	NC_002490	AT	3	6	13078	13083	50 %	50 %	0 %	0 %	10956726
19	NC_002490	AC	3	6	14080	14085	50 %	0 %	0 %	50 %	10956727
20	NC_002490	GC	3	6	16546	16551	0 %	0 %	50 %	50 %	10956728
21	NC_002490	GC	3	6	16930	16935	0 %	0 %	50 %	50 %	10956728
22	NC_002490	CG	3	6	17003	17008	0 %	0 %	50 %	50 %	10956728
23	NC_002490	AC	3	6	18390	18395	50 %	0 %	0 %	50 %	10956730
24	NC_002490	TG	3	6	19243	19248	0 %	50 %	50 %	0 %	10956731
25	NC_002490	TG	3	6	19261	19266	0 %	50 %	50 %	0 %	10956731
26	NC_002490	CG	3	6	19751	19756	0 %	0 %	50 %	50 %	10956733
27	NC_002490	GC	3	6	19925	19930	0 %	0 %	50 %	50 %	10956734
28	NC_002490	AG	3	6	20630	20635	50 %	0 %	50 %	0 %	10956735
29	NC_002490	GC	3	6	21136	21141	0 %	0 %	50 %	50 %	10956736
30	NC_002490	CA	3	6	21867	21872	50 %	0 %	0 %	50 %	10956737
31	NC_002490	AG	3	6	24499	24504	50 %	0 %	50 %	0 %	10956742
32	NC_002490	AT	3	6	25945	25950	50 %	50 %	0 %	0 %	10956743
33	NC_002490	GA	3	6	27430	27435	50 %	0 %	50 %	0 %	10956747
34	NC_002490	CT	3	6	27878	27883	0 %	50 %	0 %	50 %	10956748
35	NC_002490	CA	3	6	32785	32790	50 %	0 %	0 %	50 %	10956753
36	NC_002490	AG	3	6	33009	33014	50 %	0 %	50 %	0 %	10956753
37	NC_002490	GA	3	6	33186	33191	50 %	0 %	50 %	0 %	10956754
38	NC_002490	AT	3	6	36546	36551	50 %	50 %	0 %	0 %	10956755
39	NC_002490	AT	3	6	36759	36764	50 %	50 %	0 %	0 %	10956756
40	NC_002490	GC	3	6	39258	39263	0 %	0 %	50 %	50 %	10956758
41	NC_002490	GC	3	6	39287	39292	0 %	0 %	50 %	50 %	10956758
42	NC_002490	CG	3	6	39769	39774	0 %	0 %	50 %	50 %	10956759
43	NC_002490	AG	3	6	41470	41475	50 %	0 %	50 %	0 %	10956762
44	NC_002490	TC	3	6	41722	41727	0 %	50 %	0 %	50 %	10956762
45	NC_002490	CA	3	6	41983	41988	50 %	0 %	0 %	50 %	10956763
46	NC_002490	CG	3	6	43708	43713	0 %	0 %	50 %	50 %	10956765
47	NC_002490	TC	3	6	43906	43911	0 %	50 %	0 %	50 %	10956765
48	NC_002490	CT	3	6	43966	43971	0 %	50 %	0 %	50 %	10956765
49	NC_002490	GC	3	6	44966	44971	0 %	0 %	50 %	50 %	10956767
50	NC_002490	CG	3	6	46209	46214	0 %	0 %	50 %	50 %	10956769
51	NC_002490	CG	3	6	47884	47889	0 %	0 %	50 %	50 %	10956771
52	NC_002490	GC	3	6	48002	48007	0 %	0 %	50 %	50 %	10956771
53	NC_002490	GC	3	6	48449	48454	0 %	0 %	50 %	50 %	10956772
54	NC_002490	GC	3	6	48797	48802	0 %	0 %	50 %	50 %	10956772
55	NC_002490	GC	3	6	49013	49018	0 %	0 %	50 %	50 %	10956772
56	NC_002490	CT	3	6	49034	49039	0 %	50 %	0 %	50 %	10956772

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.