MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c plasmid pXF51

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002490	A	6	6	60	65	100 %	0 %	0 %	0 %	10956712
2	NC_002490	A	6	6	2736	2741	100 %	0 %	0 %	0 %	10956714
3	NC_002490	A	6	6	2884	2889	100 %	0 %	0 %	0 %	10956714
4	NC_002490	A	6	6	2959	2964	100 %	0 %	0 %	0 %	10956714
5	NC_002490	A	6	6	3348	3353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002490	A	6	6	6550	6555	100 %	0 %	0 %	0 %	10956719
7	NC_002490	A	6	6	7267	7272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002490	A	6	6	7554	7559	100 %	0 %	0 %	0 %	10956721
9	NC_002490	T	6	6	8882	8887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002490	A	6	6	9168	9173	100 %	0 %	0 %	0 %	15426424
11	NC_002490	C	6	6	10042	10047	0 %	0 %	0 %	100 %	10956724
12	NC_002490	T	6	6	10358	10363	0 %	100 %	0 %	0 %	10956724
13	NC_002490	A	6	6	10517	10522	100 %	0 %	0 %	0 %	10956724
14	NC_002490	T	6	6	10824	10829	0 %	100 %	0 %	0 %	10956725
15	NC_002490	A	6	6	12153	12158	100 %	0 %	0 %	0 %	10956725
16	NC_002490	A	7	7	13346	13352	100 %	0 %	0 %	0 %	10956727
17	NC_002490	A	6	6	13426	13431	100 %	0 %	0 %	0 %	10956727
18	NC_002490	A	6	6	13807	13812	100 %	0 %	0 %	0 %	10956727
19	NC_002490	A	6	6	14190	14195	100 %	0 %	0 %	0 %	10956727
20	NC_002490	A	6	6	14625	14630	100 %	0 %	0 %	0 %	10956727
21	NC_002490	A	7	7	15268	15274	100 %	0 %	0 %	0 %	10956728
22	NC_002490	A	8	8	15567	15574	100 %	0 %	0 %	0 %	10956728
23	NC_002490	A	7	7	16115	16121	100 %	0 %	0 %	0 %	10956728
24	NC_002490	A	7	7	17973	17979	100 %	0 %	0 %	0 %	10956729
25	NC_002490	A	6	6	18261	18266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002490	T	6	6	19250	19255	0 %	100 %	0 %	0 %	10956731
27	NC_002490	G	6	6	19288	19293	0 %	0 %	100 %	0 %	10956732
28	NC_002490	T	6	6	20613	20618	0 %	100 %	0 %	0 %	10956735
29	NC_002490	A	6	6	21304	21309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002490	T	6	6	21373	21378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002490	T	6	6	22773	22778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002490	A	7	7	23796	23802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002490	T	6	6	24561	24566	0 %	100 %	0 %	0 %	10956742
34	NC_002490	T	6	6	24965	24970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002490	A	6	6	24983	24988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002490	T	6	6	25232	25237	0 %	100 %	0 %	0 %	10956743
37	NC_002490	T	6	6	25304	25309	0 %	100 %	0 %	0 %	10956743
38	NC_002490	T	7	7	25405	25411	0 %	100 %	0 %	0 %	10956743
39	NC_002490	T	6	6	25572	25577	0 %	100 %	0 %	0 %	10956743
40	NC_002490	A	6	6	26254	26259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002490	T	6	6	27147	27152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002490	C	8	8	28237	28244	0 %	0 %	0 %	100 %	10956748
43	NC_002490	T	7	7	31468	31474	0 %	100 %	0 %	0 %	10956751
44	NC_002490	T	7	7	37291	37297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002490	T	8	8	37376	37383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002490	A	6	6	39689	39694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002490	C	6	6	40849	40854	0 %	0 %	0 %	100 %	10956761
48	NC_002490	A	6	6	40954	40959	100 %	0 %	0 %	0 %	10956761
49	NC_002490	T	6	6	42464	42469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002490	T	6	6	42738	42743	0 %	100 %	0 %	0 %	10956764
51	NC_002490	T	6	6	42868	42873	0 %	100 %	0 %	0 %	10956764
52	NC_002490	T	6	6	44016	44021	0 %	100 %	0 %	0 %	10956765
53	NC_002490	T	6	6	44053	44058	0 %	100 %	0 %	0 %	10956765
54	NC_002490	T	6	6	44222	44227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002490	G	6	6	44877	44882	0 %	0 %	100 %	0 %	10956766
56	NC_002490	T	6	6	44927	44932	0 %	100 %	0 %	0 %	10956766
57	NC_002490	C	6	6	45183	45188	0 %	0 %	0 %	100 %	10956767
58	NC_002490	C	6	6	45330	45335	0 %	0 %	0 %	100 %	10956768
59	NC_002490	T	6	6	46383	46388	0 %	100 %	0 %	0 %	10956769
60	NC_002490	A	6	6	47779	47784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002490	T	6	6	48904	48909	0 %	100 %	0 %	0 %	10956772
62	NC_002490	T	6	6	49211	49216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002490	G	6	6	49866	49871	0 %	0 %	100 %	0 %	10956773
64	NC_002490	T	7	7	50057	50063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002490	A	7	7	50088	50094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002490	G	6	6	50287	50292	0 %	0 %	100 %	0 %	10956774
67	NC_002490	T	6	6	50952	50957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002490	T	7	7	51041	51047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002490	A	6	6	51087	51092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002490	T	6	6	51114	51119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.