MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 1757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002488	TGCGT	2	10	8340	8349	0 %	40 %	40 %	20 %	15836611
2	NC_002488	AAGTG	2	10	8391	8400	40 %	20 %	40 %	0 %	15836611
3	NC_002488	GATCA	2	10	10065	10074	40 %	20 %	20 %	20 %	15836612
4	NC_002488	GATGT	2	10	12774	12783	20 %	40 %	40 %	0 %	15836617
5	NC_002488	CAATT	2	10	12898	12907	40 %	40 %	0 %	20 %	15836617
6	NC_002488	CAAAG	2	10	15428	15437	60 %	0 %	20 %	20 %	15836620
7	NC_002488	CTTTT	2	10	16607	16616	0 %	80 %	0 %	20 %	15836621
8	NC_002488	GTCGT	2	10	19453	19462	0 %	40 %	40 %	20 %	15836626
9	NC_002488	GCTTG	2	10	20704	20713	0 %	40 %	40 %	20 %	15836629
10	NC_002488	TGCGT	2	10	22701	22710	0 %	40 %	40 %	20 %	77747482
11	NC_002488	AGCGA	2	10	24770	24779	40 %	0 %	40 %	20 %	15836634
12	NC_002488	AATGG	2	10	24800	24809	40 %	20 %	40 %	0 %	15836634
13	NC_002488	ATTGA	2	10	25093	25102	40 %	40 %	20 %	0 %	15836635
14	NC_002488	ACAAT	2	10	25457	25466	60 %	20 %	0 %	20 %	15836635
15	NC_002488	GTGCA	2	10	25691	25700	20 %	20 %	40 %	20 %	15836635
16	NC_002488	GGGAC	2	10	28499	28508	20 %	0 %	60 %	20 %	15836637
17	NC_002488	ACGGT	2	10	30207	30216	20 %	20 %	40 %	20 %	15836637
18	NC_002488	CGGCG	2	10	31374	31383	0 %	0 %	60 %	40 %	15836639
19	NC_002488	TTGCG	2	10	34781	34790	0 %	40 %	40 %	20 %	15836643
20	NC_002488	GTTTG	2	10	37254	37263	0 %	60 %	40 %	0 %	15836647
21	NC_002488	TGCGC	2	10	38491	38500	0 %	20 %	40 %	40 %	15836648
22	NC_002488	AGCCG	2	10	39631	39640	20 %	0 %	40 %	40 %	15836649
23	NC_002488	TGCGT	2	10	41018	41027	0 %	40 %	40 %	20 %	15836650
24	NC_002488	GGCTT	2	10	41886	41895	0 %	40 %	40 %	20 %	15836650
25	NC_002488	TTTGG	2	10	42819	42828	0 %	60 %	40 %	0 %	15836650
26	NC_002488	ATTTG	2	10	46864	46873	20 %	60 %	20 %	0 %	15836655
27	NC_002488	TAGGA	2	10	47364	47373	40 %	20 %	40 %	0 %	15836655
28	NC_002488	GCGCC	2	10	48213	48222	0 %	0 %	40 %	60 %	15836655
29	NC_002488	CGATG	2	10	48862	48871	20 %	20 %	40 %	20 %	15836655
30	NC_002488	GGTAT	2	10	51426	51435	20 %	40 %	40 %	0 %	15836658
31	NC_002488	TGATC	2	10	51663	51672	20 %	40 %	20 %	20 %	15836658
32	NC_002488	GCATT	2	10	51773	51782	20 %	40 %	20 %	20 %	15836659
33	NC_002488	TCGAT	2	10	53610	53619	20 %	40 %	20 %	20 %	15836664
34	NC_002488	TTGGC	2	10	55513	55522	0 %	40 %	40 %	20 %	15836666
35	NC_002488	TTGAG	2	10	57509	57518	20 %	40 %	40 %	0 %	15836668
36	NC_002488	GCAGC	2	10	57872	57881	20 %	0 %	40 %	40 %	15836668
37	NC_002488	GACTG	2	10	58124	58133	20 %	20 %	40 %	20 %	15836669
38	NC_002488	TTGCT	2	10	58928	58937	0 %	60 %	20 %	20 %	15836669
39	NC_002488	ATTTC	2	10	62539	62548	20 %	60 %	0 %	20 %	15836674
40	NC_002488	GCATC	2	10	71948	71957	20 %	20 %	20 %	40 %	15836676
41	NC_002488	TGTGC	2	10	74159	74168	0 %	40 %	40 %	20 %	15836678
42	NC_002488	TTGCT	2	10	76794	76803	0 %	60 %	20 %	20 %	15836681
43	NC_002488	CCGTT	2	10	78123	78132	0 %	40 %	20 %	40 %	77747485
44	NC_002488	TTCGG	2	10	83705	83714	0 %	40 %	40 %	20 %	15836687
45	NC_002488	CGTGA	2	10	83720	83729	20 %	20 %	40 %	20 %	15836687
46	NC_002488	AACGC	2	10	84013	84022	40 %	0 %	20 %	40 %	15836687
47	NC_002488	GATGC	2	10	84899	84908	20 %	20 %	40 %	20 %	15836688
48	NC_002488	GTACA	2	10	87321	87330	40 %	20 %	20 %	20 %	15836692
49	NC_002488	TGCGG	2	10	87562	87571	0 %	20 %	60 %	20 %	15836692
50	NC_002488	CCTCC	2	10	90945	90954	0 %	20 %	0 %	80 %	15836695
51	NC_002488	ATGTT	2	10	91339	91348	20 %	60 %	20 %	0 %	15836696
52	NC_002488	CAGCT	2	10	94450	94459	20 %	20 %	20 %	40 %	15836699
53	NC_002488	AGAGA	2	10	98340	98349	60 %	0 %	40 %	0 %	15836705
54	NC_002488	TGCAT	2	10	99591	99600	20 %	40 %	20 %	20 %	15836707
55	NC_002488	TCTTT	2	10	99603	99612	0 %	80 %	0 %	20 %	15836707
56	NC_002488	TGCAA	2	10	101011	101020	40 %	20 %	20 %	20 %	15836708
57	NC_002488	TGGCG	2	10	101520	101529	0 %	20 %	60 %	20 %	15836708
58	NC_002488	GCGTA	2	10	102301	102310	20 %	20 %	40 %	20 %	15836709
59	NC_002488	ACGCC	2	10	102594	102603	20 %	0 %	20 %	60 %	15836709
60	NC_002488	AATGC	2	10	110123	110132	40 %	20 %	20 %	20 %	15836718
61	NC_002488	TGACC	2	10	111727	111736	20 %	20 %	20 %	40 %	15836721
62	NC_002488	TGATC	2	10	111739	111748	20 %	40 %	20 %	20 %	15836721
63	NC_002488	TCGCA	2	10	112615	112624	20 %	20 %	20 %	40 %	15836721
64	NC_002488	CGCGT	2	10	113723	113732	0 %	20 %	40 %	40 %	15836723
65	NC_002488	TGGAT	2	10	113962	113971	20 %	40 %	40 %	0 %	15836723
66	NC_002488	CATCG	2	10	114011	114020	20 %	20 %	20 %	40 %	15836723
67	NC_002488	TGAGG	2	10	119115	119124	20 %	20 %	60 %	0 %	15836727
68	NC_002488	CTGAA	2	10	123554	123563	40 %	20 %	20 %	20 %	15836729
69	NC_002488	GTGAC	2	10	127595	127604	20 %	20 %	40 %	20 %	15836733
70	NC_002488	ACTGC	2	10	128546	128555	20 %	20 %	20 %	40 %	15836735
71	NC_002488	GCCAT	2	10	128918	128927	20 %	20 %	20 %	40 %	77747488
72	NC_002488	ACAGC	2	10	128976	128985	40 %	0 %	20 %	40 %	77747488
73	NC_002488	TTCCC	3	15	129224	129238	0 %	40 %	0 %	60 %	15836737
74	NC_002488	CTGGA	2	10	130011	130020	20 %	20 %	40 %	20 %	15836737
75	NC_002488	GAACA	2	10	130534	130543	60 %	0 %	20 %	20 %	15836737
76	NC_002488	GGCGC	2	10	132813	132822	0 %	0 %	60 %	40 %	15836739
77	NC_002488	TGTGG	2	10	137846	137855	0 %	40 %	60 %	0 %	15836743
78	NC_002488	GTGTT	2	10	141399	141408	0 %	60 %	40 %	0 %	15836746
79	NC_002488	GCGTC	2	10	142511	142520	0 %	20 %	40 %	40 %	15836746
80	NC_002488	GTTTG	2	10	144782	144791	0 %	60 %	40 %	0 %	15836748
81	NC_002488	AGCAC	2	10	146961	146970	40 %	0 %	20 %	40 %	15836749
82	NC_002488	CCGAC	2	10	147241	147250	20 %	0 %	20 %	60 %	15836749
83	NC_002488	GATGT	2	10	147508	147517	20 %	40 %	40 %	0 %	15836749
84	NC_002488	GGTGC	2	10	148180	148189	0 %	20 %	60 %	20 %	15836750
85	NC_002488	GCCAG	2	10	148195	148204	20 %	0 %	40 %	40 %	15836750
86	NC_002488	TGCGT	2	10	149462	149471	0 %	40 %	40 %	20 %	15836752
87	NC_002488	GTTGC	2	10	154924	154933	0 %	40 %	40 %	20 %	77747490
88	NC_002488	AGCGC	2	10	155687	155696	20 %	0 %	40 %	40 %	77747490
89	NC_002488	AGCGT	2	10	155815	155824	20 %	20 %	40 %	20 %	77747490
90	NC_002488	ATTAT	2	10	158468	158477	40 %	60 %	0 %	0 %	15836760
91	NC_002488	TGGAT	2	10	158902	158911	20 %	40 %	40 %	0 %	15836760
92	NC_002488	CGGAG	2	10	164222	164231	20 %	0 %	60 %	20 %	15836766
93	NC_002488	TGTGT	2	10	165568	165577	0 %	60 %	40 %	0 %	15836769
94	NC_002488	TCGAT	2	10	166161	166170	20 %	40 %	20 %	20 %	15836770
95	NC_002488	GAGGT	2	10	170795	170804	20 %	20 %	60 %	0 %	15836774
96	NC_002488	GCATC	2	10	177664	177673	20 %	20 %	20 %	40 %	15836775
97	NC_002488	GCTTG	2	10	180726	180735	0 %	40 %	40 %	20 %	77747492
98	NC_002488	CGCGT	2	10	184304	184313	0 %	20 %	40 %	40 %	15836779
99	NC_002488	GAGTG	2	10	185420	185429	20 %	20 %	60 %	0 %	15836780
100	NC_002488	TTGCC	2	10	187499	187508	0 %	40 %	20 %	40 %	15836782
101	NC_002488	GCAAC	2	10	189984	189993	40 %	0 %	20 %	40 %	15836785
102	NC_002488	GACTG	2	10	191953	191962	20 %	20 %	40 %	20 %	161378178
103	NC_002488	ACGTA	2	10	193104	193113	40 %	20 %	20 %	20 %	15836788
104	NC_002488	TGCGA	2	10	193258	193267	20 %	20 %	40 %	20 %	15836788
105	NC_002488	CCCAT	2	10	194352	194361	20 %	20 %	0 %	60 %	15836789
106	NC_002488	TGCAT	2	10	196938	196947	20 %	40 %	20 %	20 %	77747493
107	NC_002488	CGCGC	2	10	198281	198290	0 %	0 %	40 %	60 %	15836794
108	NC_002488	GGCTT	2	10	199216	199225	0 %	40 %	40 %	20 %	15836794
109	NC_002488	TGTCA	2	10	199388	199397	20 %	40 %	20 %	20 %	15836795
110	NC_002488	GCATC	2	10	202662	202671	20 %	20 %	20 %	40 %	15836797
111	NC_002488	AACAA	2	10	202935	202944	80 %	0 %	0 %	20 %	15836797
112	NC_002488	GATGT	2	10	204084	204093	20 %	40 %	40 %	0 %	15836800
113	NC_002488	GTGGC	2	10	204963	204972	0 %	20 %	60 %	20 %	15836801
114	NC_002488	ACCGA	2	10	205582	205591	40 %	0 %	20 %	40 %	15836802
115	NC_002488	GTTGG	2	10	205880	205889	0 %	40 %	60 %	0 %	15836802
116	NC_002488	TGTCG	2	10	208086	208095	0 %	40 %	40 %	20 %	15836806
117	NC_002488	GTTGC	2	10	208284	208293	0 %	40 %	40 %	20 %	15836806
118	NC_002488	GGTTG	2	10	208902	208911	0 %	40 %	60 %	0 %	15836807
119	NC_002488	TGCGC	2	10	208995	209004	0 %	20 %	40 %	40 %	15836807
120	NC_002488	GGCGT	2	10	212081	212090	0 %	20 %	60 %	20 %	77747494
121	NC_002488	CCAGT	2	10	214268	214277	20 %	20 %	20 %	40 %	15836810
122	NC_002488	GATCG	2	10	214907	214916	20 %	20 %	40 %	20 %	15836810
123	NC_002488	GTGAT	2	10	216627	216636	20 %	40 %	40 %	0 %	77747495
124	NC_002488	GGTGG	2	10	218166	218175	0 %	20 %	80 %	0 %	15836815
125	NC_002488	GTCAT	2	10	218674	218683	20 %	40 %	20 %	20 %	15836815
126	NC_002488	ATGGC	2	10	220624	220633	20 %	20 %	40 %	20 %	15836817
127	NC_002488	GTAAA	2	10	224217	224226	60 %	20 %	20 %	0 %	15836822
128	NC_002488	TGACA	2	10	226418	226427	40 %	20 %	20 %	20 %	15836825
129	NC_002488	TTCGC	2	10	227923	227932	0 %	40 %	20 %	40 %	15836826
130	NC_002488	GCAGC	2	10	227965	227974	20 %	0 %	40 %	40 %	15836826
131	NC_002488	GCCAG	2	10	231476	231485	20 %	0 %	40 %	40 %	161378177
132	NC_002488	CGTGG	2	10	232122	232131	0 %	20 %	60 %	20 %	161378177
133	NC_002488	GCGTG	2	10	234184	234193	0 %	20 %	60 %	20 %	15836830
134	NC_002488	GCGGT	2	10	236310	236319	0 %	20 %	60 %	20 %	15836832
135	NC_002488	GTGCG	2	10	236733	236742	0 %	20 %	60 %	20 %	15836832
136	NC_002488	GCCGC	2	10	237184	237193	0 %	0 %	40 %	60 %	15836832
137	NC_002488	GTTGG	2	10	237508	237517	0 %	40 %	60 %	0 %	15836833
138	NC_002488	GACTC	2	10	238191	238200	20 %	20 %	20 %	40 %	161378176
139	NC_002488	TCGTG	2	10	238975	238984	0 %	40 %	40 %	20 %	15836835
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142	NC_002488	TGCGT	2	10	240584	240593	0 %	40 %	40 %	20 %	15836837
143	NC_002488	ATTGT	2	10	245190	245199	20 %	60 %	20 %	0 %	15836839
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149	NC_002488	CATGA	2	10	257773	257782	40 %	20 %	20 %	20 %	15836848
150	NC_002488	GGAAC	2	10	258822	258831	40 %	0 %	40 %	20 %	15836849
151	NC_002488	TGGTG	2	10	261710	261719	0 %	40 %	60 %	0 %	15836855
152	NC_002488	TGGTG	2	10	262053	262062	0 %	40 %	60 %	0 %	15836855
153	NC_002488	TGGTT	2	10	262869	262878	0 %	60 %	40 %	0 %	15836857
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155	NC_002488	GTTGA	2	10	265895	265904	20 %	40 %	40 %	0 %	15836858
156	NC_002488	TGTGG	2	10	266416	266425	0 %	40 %	60 %	0 %	15836859
157	NC_002488	GTGTG	2	10	269531	269540	0 %	40 %	60 %	0 %	15836863
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162	NC_002488	GCGTA	2	10	284546	284555	20 %	20 %	40 %	20 %	15836879
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164	NC_002488	CGCTG	2	10	285934	285943	0 %	20 %	40 %	40 %	161378175
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166	NC_002488	CTTGG	2	10	286875	286884	0 %	40 %	40 %	20 %	15836881
167	NC_002488	CCACG	2	10	288363	288372	20 %	0 %	20 %	60 %	15836882
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170	NC_002488	GAGGG	2	10	290976	290985	20 %	0 %	80 %	0 %	15836883
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235	NC_002488	CCGTA	2	10	388912	388921	20 %	20 %	20 %	40 %	15836979
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243	NC_002488	GCTGT	21	105	403890	403994	0 %	40 %	40 %	20 %	15836993
244	NC_002488	GCCAA	12	60	408996	409055	40 %	0 %	20 %	40 %	15837000
245	NC_002488	AAACA	2	10	410233	410242	80 %	0 %	0 %	20 %	15837003
246	NC_002488	TTCGA	2	10	410255	410264	20 %	40 %	20 %	20 %	15837003
247	NC_002488	GACCA	2	10	410575	410584	40 %	0 %	20 %	40 %	15837003
248	NC_002488	GCGCA	2	10	412974	412983	20 %	0 %	40 %	40 %	77747500
249	NC_002488	GTGTT	2	10	414051	414060	0 %	60 %	40 %	0 %	15837007
250	NC_002488	GATCA	2	10	416419	416428	40 %	20 %	20 %	20 %	15837009
251	NC_002488	ACAGT	2	10	417521	417530	40 %	20 %	20 %	20 %	77747501
252	NC_002488	CATGA	2	10	418800	418809	40 %	20 %	20 %	20 %	15837011
253	NC_002488	TGGAT	2	10	420465	420474	20 %	40 %	40 %	0 %	15837013
254	NC_002488	CCAAG	2	10	423595	423604	40 %	0 %	20 %	40 %	15837015
255	NC_002488	GCATC	2	10	424783	424792	20 %	20 %	20 %	40 %	15837018
256	NC_002488	GCCAA	2	10	425073	425082	40 %	0 %	20 %	40 %	15837018
257	NC_002488	CGCTG	2	10	425195	425204	0 %	20 %	40 %	40 %	15837018
258	NC_002488	TGATC	2	10	427848	427857	20 %	40 %	20 %	20 %	15837022
259	NC_002488	GCAGT	2	10	427917	427926	20 %	20 %	40 %	20 %	15837022
260	NC_002488	ATGGG	2	10	428246	428255	20 %	20 %	60 %	0 %	15837023
261	NC_002488	TGCAA	2	10	428914	428923	40 %	20 %	20 %	20 %	15837023
262	NC_002488	GTGCC	2	10	429504	429513	0 %	20 %	40 %	40 %	15837024
263	NC_002488	TCGAC	2	10	431851	431860	20 %	20 %	20 %	40 %	15837024
264	NC_002488	GCGCA	2	10	433428	433437	20 %	0 %	40 %	40 %	15837025
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266	NC_002488	GACGC	2	10	436237	436246	20 %	0 %	40 %	40 %	15837025
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