MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 7628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002488	CTCG	2	8	500	507	0 %	25 %	25 %	50 %	15836606
2	NC_002488	TTCG	2	8	660	667	0 %	50 %	25 %	25 %	15836606
3	NC_002488	ATTG	2	8	754	761	25 %	50 %	25 %	0 %	15836606
4	NC_002488	CGAT	2	8	936	943	25 %	25 %	25 %	25 %	15836606
5	NC_002488	CTGA	2	8	1307	1314	25 %	25 %	25 %	25 %	15836606
6	NC_002488	AAAT	2	8	1509	1516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002488	ATTG	2	8	2463	2470	25 %	50 %	25 %	0 %	15836607
8	NC_002488	ATTT	2	8	3004	3011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002488	TAAT	2	8	3396	3403	50 %	50 %	0 %	0 %	15836608
10	NC_002488	AGAA	2	8	3669	3676	75 %	0 %	25 %	0 %	15836608
11	NC_002488	ATGG	2	8	3837	3844	25 %	25 %	50 %	0 %	15836608
12	NC_002488	TTGA	2	8	3863	3870	25 %	50 %	25 %	0 %	15836608
13	NC_002488	TTTA	2	8	3874	3881	25 %	75 %	0 %	0 %	15836608
14	NC_002488	AGAA	2	8	4534	4541	75 %	0 %	25 %	0 %	15836609
15	NC_002488	GATA	2	8	4674	4681	50 %	25 %	25 %	0 %	15836609
16	NC_002488	GTCT	2	8	4996	5003	0 %	50 %	25 %	25 %	15836610
17	NC_002488	TCCT	2	8	5375	5382	0 %	50 %	0 %	50 %	15836610
18	NC_002488	AGTT	2	8	5398	5405	25 %	50 %	25 %	0 %	15836610
19	NC_002488	TGAT	2	8	5406	5413	25 %	50 %	25 %	0 %	15836610
20	NC_002488	ATTG	2	8	6355	6362	25 %	50 %	25 %	0 %	15836610
21	NC_002488	TTTA	2	8	6456	6463	25 %	75 %	0 %	0 %	15836610
22	NC_002488	CAAT	2	8	6932	6939	50 %	25 %	0 %	25 %	15836610
23	NC_002488	CAGT	2	8	7456	7463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_002488	ATTG	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002488	TTTG	2	8	7752	7759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002488	TGTT	2	8	8412	8419	0 %	75 %	25 %	0 %	15836611
27	NC_002488	TTTC	2	8	9032	9039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002488	ATCA	2	8	9496	9503	50 %	25 %	0 %	25 %	15836612
29	NC_002488	AGCA	2	8	9673	9680	50 %	0 %	25 %	25 %	15836612
30	NC_002488	AAAG	2	8	9702	9709	75 %	0 %	25 %	0 %	15836612
31	NC_002488	TTTA	2	8	10384	10391	25 %	75 %	0 %	0 %	15836613
32	NC_002488	CAAT	2	8	10522	10529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002488	GAAA	2	8	11319	11326	75 %	0 %	25 %	0 %	15836614
34	NC_002488	ATTA	2	8	12791	12798	50 %	50 %	0 %	0 %	15836617
35	NC_002488	CCAA	3	12	13002	13013	50 %	0 %	0 %	50 %	15836617
36	NC_002488	ATAG	2	8	13271	13278	50 %	25 %	25 %	0 %	15836618
37	NC_002488	AAAG	2	8	13439	13446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002488	TCTA	2	8	14509	14516	25 %	50 %	0 %	25 %	15836620
39	NC_002488	GTAC	2	8	14664	14671	25 %	25 %	25 %	25 %	15836620
40	NC_002488	GACG	2	8	15177	15184	25 %	0 %	50 %	25 %	15836620
41	NC_002488	TGTA	2	8	15197	15204	25 %	50 %	25 %	0 %	15836620
42	NC_002488	CAAC	2	8	15376	15383	50 %	0 %	0 %	50 %	15836620
43	NC_002488	GTAT	2	8	15808	15815	25 %	50 %	25 %	0 %	15836620
44	NC_002488	GGTG	2	8	15899	15906	0 %	25 %	75 %	0 %	15836620
45	NC_002488	CACC	2	8	16154	16161	25 %	0 %	0 %	75 %	15836620
46	NC_002488	CAGG	2	8	17210	17217	25 %	0 %	50 %	25 %	77747481
47	NC_002488	CTGG	2	8	17282	17289	0 %	25 %	50 %	25 %	77747481
48	NC_002488	GGCG	2	8	17810	17817	0 %	0 %	75 %	25 %	77747481
49	NC_002488	TGAA	2	8	17934	17941	50 %	25 %	25 %	0 %	77747481
50	NC_002488	CTAG	2	8	18072	18079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002488	GCAG	2	8	18152	18159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002488	TCCT	2	8	18262	18269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002488	CAGA	2	8	18435	18442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002488	CAAT	2	8	18885	18892	50 %	25 %	0 %	25 %	15836624
55	NC_002488	TCGT	2	8	20085	20092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002488	GTGC	2	8	20510	20517	0 %	25 %	50 %	25 %	15836628
57	NC_002488	GTCA	2	8	20725	20732	25 %	25 %	25 %	25 %	15836629
58	NC_002488	CAAC	2	8	20896	20903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002488	CCGG	2	8	21037	21044	0 %	0 %	50 %	50 %	15836630
60	NC_002488	GTGG	2	8	21544	21551	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002488	AGTT	2	8	21687	21694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002488	GTCT	2	8	21778	21785	0 %	50 %	25 %	25 %	77747482
63	NC_002488	GAGC	2	8	21800	21807	25 %	0 %	50 %	25 %	77747482
64	NC_002488	ATCA	2	8	22032	22039	50 %	25 %	0 %	25 %	77747482
65	NC_002488	TGGC	2	8	22075	22082	0 %	25 %	50 %	25 %	77747482
66	NC_002488	ATTG	2	8	22092	22099	25 %	50 %	25 %	0 %	77747482
67	NC_002488	CCAA	2	8	22515	22522	50 %	0 %	0 %	50 %	77747482
68	NC_002488	AGTT	2	8	24156	24163	25 %	50 %	25 %	0 %	15836633
69	NC_002488	TATG	2	8	24444	24451	25 %	50 %	25 %	0 %	15836633
70	NC_002488	TATT	2	8	24633	24640	25 %	75 %	0 %	0 %	15836634
71	NC_002488	ATGC	2	8	24930	24937	25 %	25 %	25 %	25 %	15836634
72	NC_002488	TCTG	2	8	25407	25414	0 %	50 %	25 %	25 %	15836635
73	NC_002488	CAGT	2	8	25571	25578	25 %	25 %	25 %	25 %	15836635
74	NC_002488	ACTT	2	8	25606	25613	25 %	50 %	0 %	25 %	15836635
75	NC_002488	ACAG	2	8	26017	26024	50 %	0 %	25 %	25 %	15836636
76	NC_002488	TTAA	2	8	26572	26579	50 %	50 %	0 %	0 %	15836636
77	NC_002488	AGTG	2	8	27325	27332	25 %	25 %	50 %	0 %	15836637
78	NC_002488	TTGA	2	8	27482	27489	25 %	50 %	25 %	0 %	15836637
79	NC_002488	ACTG	2	8	27863	27870	25 %	25 %	25 %	25 %	15836637
80	NC_002488	TGCC	2	8	27889	27896	0 %	25 %	25 %	50 %	15836637
81	NC_002488	CAAC	2	8	28254	28261	50 %	0 %	0 %	50 %	15836637
82	NC_002488	TGCC	2	8	28299	28306	0 %	25 %	25 %	50 %	15836637
83	NC_002488	GCGG	2	8	28402	28409	0 %	0 %	75 %	25 %	15836637
84	NC_002488	ATTA	2	8	28760	28767	50 %	50 %	0 %	0 %	15836637
85	NC_002488	GACC	2	8	29212	29219	25 %	0 %	25 %	50 %	15836637
86	NC_002488	CCAG	2	8	29463	29470	25 %	0 %	25 %	50 %	15836637
87	NC_002488	GCCA	2	8	30823	30830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002488	CGTT	2	8	30924	30931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002488	AGTG	2	8	31174	31181	25 %	25 %	50 %	0 %	15836639
90	NC_002488	GCCA	2	8	31593	31600	25 %	0 %	25 %	50 %	15836639
91	NC_002488	AATA	3	12	32092	32103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002488	TGAT	2	8	32777	32784	25 %	50 %	25 %	0 %	15836640
93	NC_002488	TGTT	2	8	32902	32909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002488	TGCG	2	8	33988	33995	0 %	25 %	50 %	25 %	15836641
95	NC_002488	TGCG	2	8	34562	34569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002488	GATC	2	8	36214	36221	25 %	25 %	25 %	25 %	15836646
97	NC_002488	GCAG	2	8	36680	36687	25 %	0 %	50 %	25 %	15836647
98	NC_002488	GGTG	2	8	36808	36815	0 %	25 %	75 %	0 %	15836647
99	NC_002488	CAGG	2	8	36823	36830	25 %	0 %	50 %	25 %	15836647
100	NC_002488	TTCT	2	8	37299	37306	0 %	75 %	0 %	25 %	15836647
101	NC_002488	TGGG	2	8	37399	37406	0 %	25 %	75 %	0 %	15836647
102	NC_002488	GTTG	2	8	37559	37566	0 %	50 %	50 %	0 %	15836647
103	NC_002488	GGGT	2	8	37583	37590	0 %	25 %	75 %	0 %	15836647
104	NC_002488	GTGC	2	8	38381	38388	0 %	25 %	50 %	25 %	15836648
105	NC_002488	AGTG	2	8	38796	38803	25 %	25 %	50 %	0 %	15836648
106	NC_002488	ATCA	2	8	39253	39260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_002488	GTCC	2	8	39400	39407	0 %	25 %	25 %	50 %	15836649
108	NC_002488	TTGA	2	8	39934	39941	25 %	50 %	25 %	0 %	15836649
109	NC_002488	GTGA	2	8	39945	39952	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002488	AGGC	2	8	39974	39981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002488	GCTT	2	8	40091	40098	0 %	50 %	25 %	25 %	15836650
112	NC_002488	CAGC	2	8	40289	40296	25 %	0 %	25 %	50 %	15836650
113	NC_002488	GCGG	2	8	40463	40470	0 %	0 %	75 %	25 %	15836650
114	NC_002488	CGTT	2	8	40626	40633	0 %	50 %	25 %	25 %	15836650
115	NC_002488	GGTC	2	8	41062	41069	0 %	25 %	50 %	25 %	15836650
116	NC_002488	GTCG	2	8	41616	41623	0 %	25 %	50 %	25 %	15836650
117	NC_002488	GTGC	2	8	42063	42070	0 %	25 %	50 %	25 %	15836650
118	NC_002488	GTCG	2	8	42855	42862	0 %	25 %	50 %	25 %	15836650
119	NC_002488	CAAG	2	8	43106	43113	50 %	0 %	25 %	25 %	15836650
120	NC_002488	GCTG	2	8	43565	43572	0 %	25 %	50 %	25 %	15836650
121	NC_002488	TGCA	2	8	43922	43929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002488	TTGA	2	8	44377	44384	25 %	50 %	25 %	0 %	77747483
123	NC_002488	GGAG	2	8	44619	44626	25 %	0 %	75 %	0 %	77747483
124	NC_002488	TCCA	2	8	46330	46337	25 %	25 %	0 %	50 %	161378180
125	NC_002488	GAAT	2	8	46689	46696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002488	ACCA	2	8	46836	46843	50 %	0 %	0 %	50 %	15836655
127	NC_002488	CTGG	2	8	47567	47574	0 %	25 %	50 %	25 %	15836655
128	NC_002488	TGGG	2	8	48828	48835	0 %	25 %	75 %	0 %	15836655
129	NC_002488	AATG	2	8	49260	49267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002488	GTGA	2	8	49822	49829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002488	AAGC	2	8	49836	49843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_002488	ATCC	2	8	50824	50831	25 %	25 %	0 %	50 %	15836658
133	NC_002488	GGTG	2	8	51001	51008	0 %	25 %	75 %	0 %	15836658
134	NC_002488	GATG	2	8	51468	51475	25 %	25 %	50 %	0 %	15836658
135	NC_002488	ATTG	2	8	51577	51584	25 %	50 %	25 %	0 %	15836658
136	NC_002488	GATG	2	8	51720	51727	25 %	25 %	50 %	0 %	15836658
137	NC_002488	AATG	2	8	51809	51816	50 %	25 %	25 %	0 %	15836659
138	NC_002488	GATA	2	8	52298	52305	50 %	25 %	25 %	0 %	15836660
139	NC_002488	TGGT	2	8	52376	52383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002488	AAAT	2	8	52772	52779	75 %	25 %	0 %	0 %	15836662
141	NC_002488	GATA	2	8	52800	52807	50 %	25 %	25 %	0 %	15836662
142	NC_002488	ACTC	2	8	53201	53208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002488	TGAT	3	12	53245	53256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002488	GCTT	2	8	53460	53467	0 %	50 %	25 %	25 %	15836663
145	NC_002488	AGTG	2	8	53591	53598	25 %	25 %	50 %	0 %	15836664
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