MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 1406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002488	AAAT	2	8	1509	1516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002488	ATTT	2	8	3004	3011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002488	CAGT	2	8	7456	7463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002488	ATTG	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002488	TTTG	2	8	7752	7759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002488	TTTC	2	8	9032	9039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002488	CAAT	2	8	10522	10529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002488	AAAG	2	8	13439	13446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002488	CTAG	2	8	18072	18079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_002488	GCAG	2	8	18152	18159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002488	TCCT	2	8	18262	18269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002488	CAGA	2	8	18435	18442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002488	TCGT	2	8	20085	20092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002488	CAAC	2	8	20896	20903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002488	GTGG	2	8	21544	21551	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002488	AGTT	2	8	21687	21694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002488	GCCA	2	8	30823	30830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002488	CGTT	2	8	30924	30931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002488	AATA	3	12	32092	32103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002488	TGTT	2	8	32902	32909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002488	TGCG	2	8	34562	34569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002488	ATCA	2	8	39253	39260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002488	GTGA	2	8	39945	39952	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002488	AGGC	2	8	39974	39981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002488	TGCA	2	8	43922	43929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002488	GAAT	2	8	46689	46696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002488	AATG	2	8	49260	49267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002488	GTGA	2	8	49822	49829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002488	AAGC	2	8	49836	49843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_002488	TGGT	2	8	52376	52383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002488	ACTC	2	8	53201	53208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002488	TGAT	3	12	53245	53256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002488	GATT	2	8	55120	55127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002488	TTGC	2	8	56781	56788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002488	AGTC	2	8	56844	56851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002488	AAAT	2	8	57138	57145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002488	TGAC	2	8	60770	60777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002488	GTCA	2	8	60917	60924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002488	TGGG	2	8	61322	61329	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002488	TTGC	2	8	61353	61360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002488	AATC	2	8	63066	63073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002488	GATT	2	8	63212	63219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002488	ATTA	2	8	63310	63317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002488	ATAA	2	8	63466	63473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002488	TAAA	2	8	63697	63704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002488	AAGG	2	8	64424	64431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002488	TAGT	2	8	64511	64518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002488	CCGT	2	8	64583	64590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002488	ATAA	2	8	64910	64917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002488	AAAT	2	8	65676	65683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002488	TTAA	2	8	65926	65933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002488	CTGG	2	8	66318	66325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002488	TATT	2	8	66474	66481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002488	GACC	2	8	68991	68998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002488	CGTC	2	8	69509	69516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002488	AAAG	2	8	69632	69639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002488	GTTG	2	8	69998	70005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002488	AGGT	2	8	70165	70172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002488	GTTT	2	8	71740	71747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002488	AGAA	2	8	77988	77995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002488	GATA	2	8	79535	79542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002488	TAAA	2	8	79646	79653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002488	CATA	2	8	80710	80717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002488	ATGA	2	8	84314	84321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002488	TATT	2	8	85118	85125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002488	GTAT	2	8	85138	85145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002488	TGAT	2	8	85191	85198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002488	TAAT	2	8	85292	85299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002488	TGGT	2	8	85879	85886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002488	TTTG	2	8	85911	85918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002488	AAGT	2	8	85984	85991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002488	TTGC	2	8	86017	86024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002488	CTAA	2	8	86072	86079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002488	GCAG	2	8	86086	86093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_002488	GCAG	2	8	86170	86177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002488	GTTT	2	8	90030	90037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002488	CCCT	2	8	98212	98219	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_002488	TCGT	2	8	98924	98931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002488	TACA	2	8	102756	102763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002488	TTCA	2	8	108550	108557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002488	TCGC	2	8	108589	108596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002488	TTTA	2	8	111671	111678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002488	CAAA	2	8	113216	113223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_002488	ATGC	2	8	116464	116471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002488	ATGA	2	8	118090	118097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002488	CATC	2	8	118289	118296	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002488	GCCT	2	8	119252	119259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002488	GACG	2	8	120495	120502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002488	GAGG	2	8	120519	120526	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002488	TGCT	2	8	120613	120620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002488	TTGA	2	8	123582	123589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002488	TCTA	2	8	124242	124249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_002488	AACA	2	8	124635	124642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002488	TTGT	2	8	124720	124727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002488	CTTG	2	8	129166	129173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002488	GTGG	2	8	135518	135525	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002488	AGCG	2	8	140297	140304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_002488	GATG	2	8	140723	140730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002488	ATTT	2	8	140875	140882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002488	GGTT	2	8	144682	144689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002488	CCCA	2	8	151162	151169	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_002488	TACA	2	8	153786	153793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002488	ACTT	2	8	154245	154252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002488	AGCG	2	8	159104	159111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002488	GTTT	2	8	159113	159120	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002488	GCCA	2	8	160468	160475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002488	TCAT	2	8	160928	160935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002488	TGCG	2	8	161066	161073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_002488	GCGG	2	8	162429	162436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_002488	TGGT	2	8	164694	164701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002488	TGAA	2	8	165106	165113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002488	GAAG	2	8	167557	167564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002488	GTCC	2	8	171808	171815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002488	CTGG	2	8	172034	172041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002488	TATT	2	8	172190	172197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002488	GACC	2	8	174707	174714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002488	CGTC	2	8	175225	175232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002488	AAAG	2	8	175348	175355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002488	GTTG	2	8	175714	175721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002488	AGGT	2	8	175881	175888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002488	GTTT	2	8	177456	177463	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002488	GTGG	2	8	183146	183153	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002488	AGGT	2	8	183197	183204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002488	CTGC	2	8	183301	183308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002488	CCAT	2	8	185728	185735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_002488	GATC	2	8	185863	185870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_002488	TACA	2	8	187081	187088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_002488	GACT	2	8	187152	187159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002488	TCAG	2	8	188093	188100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002488	GCAG	2	8	189407	189414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002488	ACCG	2	8	190490	190497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002488	CTGA	2	8	190584	190591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002488	AGAA	2	8	190849	190856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002488	GCAT	2	8	191088	191095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_002488	GCTT	2	8	191404	191411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_002488	TAGA	2	8	191484	191491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002488	AACC	2	8	192208	192215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002488	GATC	2	8	192683	192690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002488	TGAT	2	8	200114	200121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002488	TTGT	2	8	200214	200221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002488	AATT	2	8	200923	200930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002488	ATGG	2	8	201130	201137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002488	AGTC	2	8	203870	203877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_002488	TAAT	2	8	205064	205071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002488	ATTT	2	8	206331	206338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002488	TTTG	2	8	206352	206359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002488	CATA	2	8	206643	206650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002488	GTGG	2	8	207541	207548	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002488	TGGT	2	8	207626	207633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002488	TTCA	2	8	209080	209087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_002488	TCTT	2	8	215546	215553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_002488	AGGA	2	8	217556	217563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002488	TTCT	2	8	220943	220950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_002488	TGTC	2	8	222914	222921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_002488	CTAT	2	8	223056	223063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_002488	CGTA	2	8	224342	224349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_002488	GTTA	3	12	231125	231136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_002488	TTGA	2	8	231255	231262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_002488	TAAA	2	8	243275	243282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_002488	GTTG	2	8	243403	243410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_002488	TGAA	2	8	255121	255128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_002488	AATA	2	8	275840	275847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_002488	TAAA	2	8	276083	276090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_002488	TTTC	2	8	276608	276615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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194	NC_002488	TATT	2	8	277093	277100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_002488	ATAA	2	8	277654	277661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_002488	GTAA	2	8	355125	355132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_002488	TTGA	2	8	397522	397529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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