MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 32079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002488	AGA	2	6	193	198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836606
2	NC_002488	GTG	2	6	237	242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
3	NC_002488	GTC	2	6	248	253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
4	NC_002488	TAG	2	6	285	290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
5	NC_002488	AGT	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
6	NC_002488	ACA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
7	NC_002488	TTG	2	6	477	482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836606
8	NC_002488	TGC	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
9	NC_002488	TGG	2	6	571	576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
10	NC_002488	TGC	2	6	607	612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836606
11	NC_002488	AAG	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836606
12	NC_002488	ACA	2	6	841	846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
13	NC_002488	ATT	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836606
14	NC_002488	CCT	2	6	944	949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836606
15	NC_002488	GTG	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836606
16	NC_002488	TAG	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836606
17	NC_002488	CAA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
18	NC_002488	ATT	2	6	1212	1217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836606
19	NC_002488	ACA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836606
20	NC_002488	TAA	2	6	1859	1864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836607
21	NC_002488	GAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
22	NC_002488	AAT	2	6	1929	1934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836607
23	NC_002488	GAT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
24	NC_002488	TAT	3	9	2136	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
25	NC_002488	TTA	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
26	NC_002488	CAA	2	6	2197	2202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836607
27	NC_002488	TTA	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
28	NC_002488	ATT	2	6	2335	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
29	NC_002488	TTA	2	6	2374	2379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836607
30	NC_002488	GGC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836607
31	NC_002488	GTG	2	6	2594	2599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836607
32	NC_002488	AAG	3	9	2654	2662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836607
33	NC_002488	AGG	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836607
34	NC_002488	GTG	2	6	2753	2758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836607
35	NC_002488	TTC	2	6	2790	2795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836607
36	NC_002488	AGT	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836607
37	NC_002488	GTT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836608
38	NC_002488	TGC	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836608
39	NC_002488	AGT	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836608
40	NC_002488	TCA	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836608
41	NC_002488	ACG	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836608
42	NC_002488	ATT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836608
43	NC_002488	AAC	2	6	3645	3650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836608
44	NC_002488	AAC	2	6	3768	3773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836608
45	NC_002488	CGT	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836608
46	NC_002488	GCT	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
47	NC_002488	GGC	2	6	4799	4804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836610
48	NC_002488	TAC	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
49	NC_002488	CAC	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836610
50	NC_002488	AGA	2	6	5047	5052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836610
51	NC_002488	TGG	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
52	NC_002488	CGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836610
53	NC_002488	TGG	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
54	NC_002488	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836610
55	NC_002488	TAC	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
56	NC_002488	GTG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
57	NC_002488	GGT	2	6	5453	5458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
58	NC_002488	TTG	2	6	5544	5549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836610
59	NC_002488	TGG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836610
60	NC_002488	TGC	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
61	NC_002488	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836610
62	NC_002488	TTC	2	6	5791	5796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836610
63	NC_002488	GGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836610
64	NC_002488	TGC	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
65	NC_002488	GCT	2	6	5945	5950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
66	NC_002488	TCG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
67	NC_002488	CTG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
68	NC_002488	CAT	3	9	6271	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
69	NC_002488	GCC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836610
70	NC_002488	CCT	2	6	6607	6612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836610
71	NC_002488	TGA	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836610
72	NC_002488	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836610
73	NC_002488	TTG	2	6	6776	6781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836610
74	NC_002488	TGC	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
75	NC_002488	GAA	2	6	6982	6987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836610
76	NC_002488	AGC	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836610
77	NC_002488	TAC	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836610
78	NC_002488	TGC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836610
79	NC_002488	GAA	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836611
80	NC_002488	TGA	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836611
81	NC_002488	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836611
82	NC_002488	GCA	3	9	8248	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836611
83	NC_002488	TTG	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836611
84	NC_002488	AAC	2	6	8502	8507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836611
85	NC_002488	GCT	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836611
86	NC_002488	CGT	2	6	8539	8544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836611
87	NC_002488	TCA	2	6	8551	8556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836611
88	NC_002488	GAG	2	6	8558	8563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836611
89	NC_002488	TGC	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836611
90	NC_002488	TTG	2	6	8693	8698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836611
91	NC_002488	TTG	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836611
92	NC_002488	GAA	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836611
93	NC_002488	CCG	2	6	8825	8830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836611
94	NC_002488	AGC	2	6	8880	8885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836611
95	NC_002488	GCA	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836611
96	NC_002488	AGA	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836611
97	NC_002488	GGT	2	6	9126	9131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836612
98	NC_002488	CTG	2	6	9142	9147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
99	NC_002488	ATC	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836612
100	NC_002488	TGC	2	6	9185	9190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
101	NC_002488	CTC	2	6	9254	9259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836612
102	NC_002488	GCT	2	6	9408	9413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
103	NC_002488	GCA	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836612
104	NC_002488	AAC	2	6	9486	9491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836612
105	NC_002488	TGC	2	6	9505	9510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
106	NC_002488	TTA	2	6	9667	9672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836612
107	NC_002488	TGC	2	6	9683	9688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
108	NC_002488	TTA	2	6	9720	9725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836612
109	NC_002488	GTG	2	6	9870	9875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836612
110	NC_002488	ACA	2	6	9955	9960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836612
111	NC_002488	TTA	2	6	10052	10057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836612
112	NC_002488	GAA	2	6	10094	10099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836612
113	NC_002488	GCT	2	6	10101	10106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836612
114	NC_002488	ACG	2	6	10117	10122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836612
115	NC_002488	GCC	2	6	10165	10170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836612
116	NC_002488	AGA	2	6	10226	10231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836612
117	NC_002488	AAG	2	6	10236	10241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836612
118	NC_002488	GAA	2	6	10709	10714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836614
119	NC_002488	TGC	2	6	10807	10812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836614
120	NC_002488	GCG	2	6	10874	10879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836614
121	NC_002488	CCA	2	6	10901	10906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836614
122	NC_002488	GCC	2	6	10948	10953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836614
123	NC_002488	CAC	2	6	10968	10973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836614
124	NC_002488	GCC	2	6	10996	11001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836614
125	NC_002488	GTG	2	6	11012	11017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836614
126	NC_002488	TGT	3	9	11044	11052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836614
127	NC_002488	GCC	2	6	11053	11058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836614
128	NC_002488	GCC	2	6	11062	11067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836614
129	NC_002488	GCC	2	6	11071	11076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836614
130	NC_002488	CTC	2	6	11079	11084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836614
131	NC_002488	TGC	2	6	11266	11271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836614
132	NC_002488	CAG	2	6	11492	11497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836615
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258	NC_002488	GGC	2	6	22897	22902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836632
259	NC_002488	GAA	2	6	22966	22971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836632
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