MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pTrp

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002252	TCC	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_002252	ACA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002252	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002252	AAG	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002252	AGG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002252	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002252	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002252	GAG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002252	CAT	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002252	TCT	2	6	2885	2890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002252	TGT	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002252	TAT	2	6	3449	3454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002252	TAT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002252	TTA	2	6	3525	3530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002252	ATT	2	6	3577	3582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002252	ACA	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_002252	ATC	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002252	ATT	2	6	3733	3738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002252	CAG	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002252	TAA	2	6	3757	3762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002252	CTG	2	6	3813	3818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002252	ACA	2	6	3954	3959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002252	TGA	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002252	AAC	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_002252	TTG	2	6	4173	4178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002252	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002252	AGA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002252	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002252	ATG	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002252	CAG	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002252	AGT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002252	CGG	2	6	4978	4983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002252	CAA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002252	GTT	2	6	5087	5092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002252	TAA	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002252	TCC	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_002252	ACA	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002252	ATT	2	6	6006	6011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002252	AAG	2	6	6015	6020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002252	AGG	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002252	ATT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002252	CAA	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002252	GAG	2	6	6470	6475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002252	CAT	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002252	TCT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002252	TGT	2	6	6725	6730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002252	TAT	2	6	7079	7084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002252	TAT	2	6	7117	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002252	TTA	2	6	7155	7160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002252	ATT	2	6	7207	7212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.