MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pTrp

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002252	ACA	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957100
2	NC_002252	ATC	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957100
3	NC_002252	ATT	2	6	105	110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957100
4	NC_002252	CAG	2	6	119	124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957100
5	NC_002252	TAA	2	6	129	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957100
6	NC_002252	CTG	2	6	185	190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957100
7	NC_002252	ACA	2	6	326	331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957100
8	NC_002252	TGA	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957100
9	NC_002252	AAC	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957100
10	NC_002252	TTG	2	6	545	550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957100
11	NC_002252	ATC	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957100
12	NC_002252	AGA	2	6	636	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957100
13	NC_002252	GAA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957100
14	NC_002252	ATG	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957100
15	NC_002252	CAG	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957100
16	NC_002252	AGT	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957100
17	NC_002252	CGG	2	6	1350	1355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957100
18	NC_002252	CAA	2	6	1436	1441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957100
19	NC_002252	GTT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957100
20	NC_002252	TAA	2	6	1520	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957100
21	NC_002252	ACA	2	6	1591	1596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957101
22	NC_002252	AAC	2	6	1624	1629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957101
23	NC_002252	ATT	2	6	1683	1688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957101
24	NC_002252	TAA	2	6	1777	1782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957101
25	NC_002252	TAG	2	6	1807	1812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957101
26	NC_002252	TCA	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957101
27	NC_002252	TAG	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957101
28	NC_002252	GGC	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957101
29	NC_002252	CAT	2	6	1894	1899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957101
30	NC_002252	ATG	2	6	1909	1914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957101
31	NC_002252	CAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957101
32	NC_002252	AAC	2	6	2093	2098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957101
33	NC_002252	ACA	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957102
34	NC_002252	AAC	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957102
35	NC_002252	ATT	2	6	5313	5318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957102
36	NC_002252	TAA	2	6	5407	5412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957102
37	NC_002252	TAG	2	6	5437	5442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957102
38	NC_002252	TCA	2	6	5456	5461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957102
39	NC_002252	TAG	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957102
40	NC_002252	GGC	2	6	5481	5486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957102
41	NC_002252	CAT	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957102
42	NC_002252	ATG	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957102
43	NC_002252	CAA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957102
44	NC_002252	AAC	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957102

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.