MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pTrp

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002252	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
2	NC_002252	A	7	7	35	41	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
3	NC_002252	A	8	8	133	140	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
4	NC_002252	A	7	7	268	274	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
5	NC_002252	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
6	NC_002252	A	7	7	287	293	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
7	NC_002252	A	7	7	346	352	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
8	NC_002252	T	6	6	353	358	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
9	NC_002252	T	6	6	433	438	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
10	NC_002252	A	6	6	496	501	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
11	NC_002252	A	9	9	560	568	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
12	NC_002252	A	7	7	611	617	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
13	NC_002252	A	7	7	625	631	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
14	NC_002252	A	7	7	750	756	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
15	NC_002252	T	8	8	811	818	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
16	NC_002252	A	8	8	855	862	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
17	NC_002252	T	6	6	883	888	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
18	NC_002252	A	7	7	950	956	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
19	NC_002252	A	7	7	1005	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
20	NC_002252	A	7	7	1533	1539	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
21	NC_002252	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
22	NC_002252	A	6	6	1701	1706	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
23	NC_002252	A	7	7	1781	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
24	NC_002252	A	6	6	2020	2025	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
25	NC_002252	A	6	6	2119	2124	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
26	NC_002252	A	9	9	2170	2178	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
27	NC_002252	T	7	7	2199	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002252	T	6	6	2351	2356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002252	A	6	6	2435	2440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002252	A	6	6	2449	2454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002252	T	6	6	2656	2661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002252	A	7	7	2689	2695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002252	A	6	6	3130	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002252	T	7	7	3142	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002252	A	6	6	3189	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002252	T	6	6	3242	3247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002252	A	7	7	3250	3256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002252	T	10	10	3257	3266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002252	A	6	6	3365	3370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002252	A	7	7	3432	3438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002252	T	6	6	3554	3559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002252	T	7	7	3630	3636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002252	A	7	7	3663	3669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002252	A	8	8	3761	3768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002252	A	7	7	3896	3902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002252	T	6	6	3908	3913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002252	A	7	7	3915	3921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002252	A	7	7	3974	3980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002252	T	6	6	3981	3986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002252	T	6	6	4061	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002252	A	6	6	4124	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002252	A	9	9	4188	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002252	A	7	7	4239	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002252	A	7	7	4253	4259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002252	A	7	7	4378	4384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002252	T	8	8	4439	4446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002252	A	8	8	4483	4490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002252	T	6	6	4511	4516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002252	A	7	7	4578	4584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002252	A	7	7	4633	4639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002252	A	7	7	5163	5169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002252	A	7	7	5269	5275	100 %	0 %	0 %	0 %	10957102
63	NC_002252	A	6	6	5331	5336	100 %	0 %	0 %	0 %	10957102
64	NC_002252	A	7	7	5411	5417	100 %	0 %	0 %	0 %	10957102
65	NC_002252	A	6	6	5650	5655	100 %	0 %	0 %	0 %	10957102
66	NC_002252	A	6	6	5749	5754	100 %	0 %	0 %	0 %	10957102
67	NC_002252	A	10	10	5800	5809	100 %	0 %	0 %	0 %	10957102
68	NC_002252	T	7	7	5830	5836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002252	T	6	6	5982	5987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002252	A	6	6	6066	6071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002252	A	6	6	6080	6085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002252	T	6	6	6287	6292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002252	A	7	7	6320	6326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002252	G	6	6	6327	6332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002252	A	7	7	6760	6766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002252	T	7	7	6773	6779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002252	A	6	6	6820	6825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002252	T	6	6	6873	6878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002252	A	7	7	6881	6887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002252	T	9	9	6888	6896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002252	A	6	6	6995	7000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002252	A	7	7	7062	7068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002252	T	6	6	7184	7189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.