MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	TTTTAT	2	12	17738	17749	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002179	TATTTT	2	12	28019	28030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002179	TTAATG	2	12	28156	28167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002179	TTTTTA	2	12	41735	41746	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002179	TTTATT	2	12	61746	61757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002179	GCATTC	2	12	73167	73178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002179	AAAAAT	2	12	80236	80247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002179	TTGTTT	2	12	90438	90449	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002179	CTTAGG	2	12	97312	97323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_002179	TTTCTA	2	12	111034	111045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_002179	ATAATT	2	12	162145	162156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002179	TGTTTT	2	12	179300	179311	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002179	TAAAAA	2	12	185909	185920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002179	GAGGGG	2	12	195151	195162	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002179	TTTTTC	2	12	237656	237667	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_002179	ATTTCT	2	12	273515	273526	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_002179	TTTTCA	2	12	300236	300247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_002179	TTATTT	2	12	352634	352645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002179	TCTCTA	2	12	372962	372973	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002179	AAAATG	2	12	401846	401857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002179	GGGAAA	2	12	409358	409369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002179	AAAAAT	2	12	414955	414966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002179	CATGGG	2	12	428403	428414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_002179	TAAAAA	2	12	466214	466225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002179	TTCTCT	2	12	507328	507339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002179	TAGTTT	2	12	508192	508203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002179	ATTACT	2	12	511387	511398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_002179	AATATC	2	12	553014	553025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_002179	TAAATT	2	12	563182	563193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002179	TAAAAT	2	12	567011	567022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002179	CTTAAA	2	12	575035	575046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_002179	TAAATA	2	12	618733	618744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002179	AAATAG	2	12	632909	632920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002179	AAAATT	2	12	639191	639202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002179	ATCTTC	2	12	665368	665379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002179	TTTCTT	2	12	696066	696077	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_002179	ATAGAA	2	12	703226	703237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002179	CCTACA	2	12	703918	703929	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002179	CAAATT	2	12	767584	767595	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_002179	GAAATC	2	12	816883	816894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_002179	TAAAAG	2	12	837331	837342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002179	CTAGGA	2	12	848061	848072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002179	TAAAAA	2	12	929055	929066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002179	TTATAA	2	12	951346	951357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002179	AGAAAT	2	12	981907	981918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002179	TTTATG	2	12	982592	982603	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002179	AATAAC	2	12	1059981	1059992	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_002179	TCGCTT	2	12	1068353	1068364	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_002179	TTTAAA	2	12	1078226	1078237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002179	TGCTTA	2	12	1089825	1089836	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_002179	ATTTTT	2	12	1103178	1103189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002179	AGAGAT	2	12	1132970	1132981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002179	ATTAAA	2	12	1140696	1140707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002179	AATTTA	2	12	1149410	1149421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002179	ATTTTT	2	12	1149490	1149501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.