MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	TTTTG	2	10	2743	2752	0 %	80 %	20 %	0 %	16752299
2	NC_002179	AAAGT	2	10	3361	3370	60 %	20 %	20 %	0 %	16752300
3	NC_002179	AAAGA	2	10	4530	4539	80 %	0 %	20 %	0 %	16752300
4	NC_002179	TCCCT	2	10	4789	4798	0 %	40 %	0 %	60 %	16752300
5	NC_002179	AGAGA	2	10	5082	5091	60 %	0 %	40 %	0 %	16752300
6	NC_002179	AAGGA	2	10	5345	5354	60 %	0 %	40 %	0 %	16752300
7	NC_002179	CTTGT	2	10	5677	5686	0 %	60 %	20 %	20 %	16752301
8	NC_002179	AGATG	2	10	5767	5776	40 %	20 %	40 %	0 %	16752301
9	NC_002179	TGTAA	2	10	12679	12688	40 %	40 %	20 %	0 %	16752304
10	NC_002179	AAGGG	2	10	13605	13614	40 %	0 %	60 %	0 %	16752304
11	NC_002179	CCCTT	2	10	14062	14071	0 %	40 %	0 %	60 %	16752305
12	NC_002179	CTTGC	2	10	14359	14368	0 %	40 %	20 %	40 %	16752305
13	NC_002179	AATTT	2	10	16079	16088	40 %	60 %	0 %	0 %	16752306
14	NC_002179	GTACA	2	10	17103	17112	40 %	20 %	20 %	20 %	16752307
15	NC_002179	TAATA	2	10	17599	17608	60 %	40 %	0 %	0 %	16752307
16	NC_002179	AGATA	2	10	18826	18835	60 %	20 %	20 %	0 %	16752309
17	NC_002179	GAAAA	2	10	22629	22638	80 %	0 %	20 %	0 %	16753066
18	NC_002179	GTGAT	2	10	24618	24627	20 %	40 %	40 %	0 %	16752312
19	NC_002179	TTTGA	2	10	26548	26557	20 %	60 %	20 %	0 %	16752313
20	NC_002179	TTTGT	2	10	28041	28050	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002179	TAAAT	2	10	28677	28686	60 %	40 %	0 %	0 %	16752314
22	NC_002179	GATTA	2	10	30993	31002	40 %	40 %	20 %	0 %	16752315
23	NC_002179	GATCC	2	10	33783	33792	20 %	20 %	20 %	40 %	16752319
24	NC_002179	ATTTT	2	10	38884	38893	20 %	80 %	0 %	0 %	16752325
25	NC_002179	GGAAG	2	10	40894	40903	40 %	0 %	60 %	0 %	16752326
26	NC_002179	TCGAT	2	10	43379	43388	20 %	40 %	20 %	20 %	16752328
27	NC_002179	CCTTT	2	10	44147	44156	0 %	60 %	0 %	40 %	16752328
28	NC_002179	CTTTG	2	10	45423	45432	0 %	60 %	20 %	20 %	16752331
29	NC_002179	AGAGA	2	10	49159	49168	60 %	0 %	40 %	0 %	16752335
30	NC_002179	CTAAC	2	10	50111	50120	40 %	20 %	0 %	40 %	16752336
31	NC_002179	CTCCC	2	10	50165	50174	0 %	20 %	0 %	80 %	16752336
32	NC_002179	GGTTA	2	10	51365	51374	20 %	40 %	40 %	0 %	16752337
33	NC_002179	AAAGT	2	10	53764	53773	60 %	20 %	20 %	0 %	16752338
34	NC_002179	GCAAG	2	10	55013	55022	40 %	0 %	40 %	20 %	16752339
35	NC_002179	GAAAA	2	10	56834	56843	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002179	TGATG	2	10	60075	60084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002179	ATTGC	2	10	62071	62080	20 %	40 %	20 %	20 %	16752346
38	NC_002179	TTATG	2	10	63253	63262	20 %	60 %	20 %	0 %	16752346
39	NC_002179	TTTTC	2	10	63300	63309	0 %	80 %	0 %	20 %	16752346
40	NC_002179	GTTTT	2	10	72102	72111	0 %	80 %	20 %	0 %	16752352
41	NC_002179	TGGGG	2	10	72646	72655	0 %	20 %	80 %	0 %	16752353
42	NC_002179	TTTGA	2	10	73129	73138	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002179	TTTTC	2	10	73261	73270	0 %	80 %	0 %	20 %	16752354
44	NC_002179	TTTTG	2	10	74518	74527	0 %	80 %	20 %	0 %	16752357
45	NC_002179	TCTTT	2	10	76196	76205	0 %	80 %	0 %	20 %	16752359
46	NC_002179	TCTTT	2	10	77797	77806	0 %	80 %	0 %	20 %	16752361
47	NC_002179	AATAG	2	10	80145	80154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002179	TTAAT	2	10	80205	80214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002179	AAAGC	2	10	81334	81343	60 %	0 %	20 %	20 %	16752364
50	NC_002179	TGCAA	2	10	81417	81426	40 %	20 %	20 %	20 %	16752364
51	NC_002179	AAAAC	2	10	82659	82668	80 %	0 %	0 %	20 %	16752365
52	NC_002179	AGAAA	2	10	84574	84583	80 %	0 %	20 %	0 %	16752366
53	NC_002179	GAGAG	2	10	86363	86372	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002179	ACAAT	2	10	88269	88278	60 %	20 %	0 %	20 %	16752370
55	NC_002179	ACGTC	2	10	90710	90719	20 %	20 %	20 %	40 %	16752373
56	NC_002179	TAAAG	2	10	92304	92313	60 %	20 %	20 %	0 %	16752374
57	NC_002179	TTTTC	2	10	93320	93329	0 %	80 %	0 %	20 %	16752374
58	NC_002179	AAATC	2	10	93886	93895	60 %	20 %	0 %	20 %	16752374
59	NC_002179	GGATT	2	10	96290	96299	20 %	40 %	40 %	0 %	16752375
60	NC_002179	CACTT	2	10	97464	97473	20 %	40 %	0 %	40 %	16752377
61	NC_002179	TTCTT	2	10	97677	97686	0 %	80 %	0 %	20 %	16752377
62	NC_002179	GCTTT	2	10	97843	97852	0 %	60 %	20 %	20 %	16752377
63	NC_002179	CGATA	2	10	97930	97939	40 %	20 %	20 %	20 %	16752377
64	NC_002179	TTAAA	2	10	99543	99552	60 %	40 %	0 %	0 %	16752378
65	NC_002179	GGGTG	2	10	102779	102788	0 %	20 %	80 %	0 %	16752382
66	NC_002179	TCAAA	2	10	103968	103977	60 %	20 %	0 %	20 %	16752385
67	NC_002179	TTAAC	2	10	106362	106371	40 %	40 %	0 %	20 %	16752387
68	NC_002179	CTACA	2	10	106923	106932	40 %	20 %	0 %	40 %	16752388
69	NC_002179	CTTTT	2	10	111167	111176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002179	TTGGA	2	10	111585	111594	20 %	40 %	40 %	0 %	16752393
71	NC_002179	AAATA	2	10	111990	111999	80 %	20 %	0 %	0 %	16752394
72	NC_002179	GCAAT	2	10	114910	114919	40 %	20 %	20 %	20 %	16752399
73	NC_002179	ATGCA	2	10	115296	115305	40 %	20 %	20 %	20 %	16752400
74	NC_002179	TGCTT	2	10	119784	119793	0 %	60 %	20 %	20 %	161353774
75	NC_002179	AGTTT	2	10	120694	120703	20 %	60 %	20 %	0 %	161353774
76	NC_002179	TATGT	2	10	120710	120719	20 %	60 %	20 %	0 %	161353774
77	NC_002179	TGAAA	2	10	120786	120795	60 %	20 %	20 %	0 %	161353774
78	NC_002179	ACAAT	2	10	121635	121644	60 %	20 %	0 %	20 %	16752413
79	NC_002179	TGCTT	2	10	122124	122133	0 %	60 %	20 %	20 %	16752414
80	NC_002179	TTGAC	2	10	124288	124297	20 %	40 %	20 %	20 %	16752416
81	NC_002179	TAAAA	2	10	128094	128103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002179	GTTTA	2	10	128564	128573	20 %	60 %	20 %	0 %	16752421
83	NC_002179	ACGTA	2	10	128710	128719	40 %	20 %	20 %	20 %	16752422
84	NC_002179	TTGGT	2	10	130830	130839	0 %	60 %	40 %	0 %	16752423
85	NC_002179	CAACT	2	10	130953	130962	40 %	20 %	0 %	40 %	16752423
86	NC_002179	GTTAT	2	10	132895	132904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002179	GAAAA	2	10	134996	135005	80 %	0 %	20 %	0 %	16752426
88	NC_002179	TCCTA	2	10	135081	135090	20 %	40 %	0 %	40 %	16752426
89	NC_002179	CTGGA	2	10	135397	135406	20 %	20 %	40 %	20 %	16752426
90	NC_002179	CTTTG	2	10	136998	137007	0 %	60 %	20 %	20 %	16752428
91	NC_002179	AGAGA	2	10	137311	137320	60 %	0 %	40 %	0 %	16752428
92	NC_002179	TTTGG	2	10	139090	139099	0 %	60 %	40 %	0 %	16752428
93	NC_002179	TCTCC	2	10	142070	142079	0 %	40 %	0 %	60 %	16752432
94	NC_002179	AAATT	2	10	142657	142666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002179	GAGGG	2	10	142769	142778	20 %	0 %	80 %	0 %	16752433
96	NC_002179	TACCT	2	10	142912	142921	20 %	40 %	0 %	40 %	16752433
97	NC_002179	GGATA	2	10	144214	144223	40 %	20 %	40 %	0 %	16752434
98	NC_002179	ATCTA	2	10	145215	145224	40 %	40 %	0 %	20 %	16752435
99	NC_002179	GTCCT	2	10	145983	145992	0 %	40 %	20 %	40 %	16752436
100	NC_002179	GACGA	2	10	149127	149136	40 %	0 %	40 %	20 %	16753079
101	NC_002179	TATGG	2	10	151852	151861	20 %	40 %	40 %	0 %	16752441
102	NC_002179	TGGAG	2	10	155546	155555	20 %	20 %	60 %	0 %	16752444
103	NC_002179	TTTTC	2	10	157426	157435	0 %	80 %	0 %	20 %	16752446
104	NC_002179	AAGAA	2	10	158336	158345	80 %	0 %	20 %	0 %	16752446
105	NC_002179	TTGTT	2	10	161500	161509	0 %	80 %	20 %	0 %	16752448
106	NC_002179	ATAAA	2	10	164176	164185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002179	GCTTT	2	10	165337	165346	0 %	60 %	20 %	20 %	16752452
108	NC_002179	AAGAG	2	10	168182	168191	60 %	0 %	40 %	0 %	16752454
109	NC_002179	TTTGA	2	10	169008	169017	20 %	60 %	20 %	0 %	16752455
110	NC_002179	TTTGT	2	10	169419	169428	0 %	80 %	20 %	0 %	16752456
111	NC_002179	GGGGA	2	10	169596	169605	20 %	0 %	80 %	0 %	16752456
112	NC_002179	CTTGT	2	10	170453	170462	0 %	60 %	20 %	20 %	16752457
113	NC_002179	TTTGA	2	10	171627	171636	20 %	60 %	20 %	0 %	16752459
114	NC_002179	AGGAG	2	10	172702	172711	40 %	0 %	60 %	0 %	16752460
115	NC_002179	TTAAA	2	10	173313	173322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002179	CAAAA	2	10	173764	173773	80 %	0 %	0 %	20 %	16752462
117	NC_002179	ACTTG	2	10	177056	177065	20 %	40 %	20 %	20 %	16752466
118	NC_002179	ATGTT	2	10	178005	178014	20 %	60 %	20 %	0 %	16752466
119	NC_002179	CGTCC	2	10	178436	178445	0 %	20 %	20 %	60 %	16752466
120	NC_002179	AAAAG	2	10	181170	181179	80 %	0 %	20 %	0 %	16752468
121	NC_002179	CATCG	2	10	182330	182339	20 %	20 %	20 %	40 %	16752468
122	NC_002179	AGATA	2	10	182444	182453	60 %	20 %	20 %	0 %	16752468
123	NC_002179	AAGAA	2	10	184165	184174	80 %	0 %	20 %	0 %	16752471
124	NC_002179	TATTC	2	10	185587	185596	20 %	60 %	0 %	20 %	16752473
125	NC_002179	GTTGC	2	10	190528	190537	0 %	40 %	40 %	20 %	16752475
126	NC_002179	AAACG	2	10	190868	190877	60 %	0 %	20 %	20 %	16752475
127	NC_002179	ACAAG	2	10	192010	192019	60 %	0 %	20 %	20 %	16752476
128	NC_002179	GGCAT	2	10	192633	192642	20 %	20 %	40 %	20 %	16752476
129	NC_002179	CTCTT	2	10	192891	192900	0 %	60 %	0 %	40 %	16752476
130	NC_002179	GAAAA	2	10	194832	194841	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002179	TGTCT	2	10	194873	194882	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_002179	ATTAA	2	10	195847	195856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002179	ACCTC	2	10	197073	197082	20 %	20 %	0 %	60 %	16752479
134	NC_002179	ATTTC	2	10	197829	197838	20 %	60 %	0 %	20 %	16752480
135	NC_002179	TGATT	2	10	197889	197898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002179	CGTAA	2	10	199466	199475	40 %	20 %	20 %	20 %	16752484
137	NC_002179	CAATC	2	10	200505	200514	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_002179	GTCCA	2	10	200790	200799	20 %	20 %	20 %	40 %	16752485
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