MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 3128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	GGTT	2	8	1071	1078	0 %	50 %	50 %	0 %	16752297
2	NC_002179	TAAT	2	8	1696	1703	50 %	50 %	0 %	0 %	16752298
3	NC_002179	GATT	2	8	1729	1736	25 %	50 %	25 %	0 %	16752298
4	NC_002179	AGCT	2	8	1747	1754	25 %	25 %	25 %	25 %	16752298
5	NC_002179	GTAG	2	8	2007	2014	25 %	25 %	50 %	0 %	16752298
6	NC_002179	TTCA	2	8	2667	2674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002179	GCCA	2	8	2857	2864	25 %	0 %	25 %	50 %	16752299
8	NC_002179	CTGT	2	8	2927	2934	0 %	50 %	25 %	25 %	16752299
9	NC_002179	AATT	2	8	3467	3474	50 %	50 %	0 %	0 %	16752300
10	NC_002179	TTTC	2	8	3764	3771	0 %	75 %	0 %	25 %	16752300
11	NC_002179	AGTT	2	8	3938	3945	25 %	50 %	25 %	0 %	16752300
12	NC_002179	CTTC	2	8	4418	4425	0 %	50 %	0 %	50 %	16752300
13	NC_002179	TGTT	2	8	4580	4587	0 %	75 %	25 %	0 %	16752300
14	NC_002179	CTTT	2	8	5278	5285	0 %	75 %	0 %	25 %	16752300
15	NC_002179	AATC	2	8	5503	5510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002179	GAAG	2	8	6028	6035	50 %	0 %	50 %	0 %	16752301
17	NC_002179	GAAA	2	8	6133	6140	75 %	0 %	25 %	0 %	16752301
18	NC_002179	GTGG	2	8	7419	7426	0 %	25 %	75 %	0 %	16752302
19	NC_002179	TAGA	2	8	7904	7911	50 %	25 %	25 %	0 %	16752303
20	NC_002179	ATCA	2	8	8005	8012	50 %	25 %	0 %	25 %	16752303
21	NC_002179	AAAT	2	8	8488	8495	75 %	25 %	0 %	0 %	16752303
22	NC_002179	TAGG	2	8	8613	8620	25 %	25 %	50 %	0 %	16752303
23	NC_002179	GCAA	2	8	8644	8651	50 %	0 %	25 %	25 %	16752303
24	NC_002179	AAAT	2	8	9026	9033	75 %	25 %	0 %	0 %	16752303
25	NC_002179	AAAG	2	8	9068	9075	75 %	0 %	25 %	0 %	16752303
26	NC_002179	TAGG	2	8	9435	9442	25 %	25 %	50 %	0 %	16752303
27	NC_002179	TAGG	2	8	9578	9585	25 %	25 %	50 %	0 %	16752303
28	NC_002179	TTGG	2	8	10236	10243	0 %	50 %	50 %	0 %	16752303
29	NC_002179	TAGT	2	8	10367	10374	25 %	50 %	25 %	0 %	16752303
30	NC_002179	TCAA	2	8	10718	10725	50 %	25 %	0 %	25 %	16752303
31	NC_002179	ATAA	2	8	11305	11312	75 %	25 %	0 %	0 %	16752304
32	NC_002179	AAAG	2	8	11376	11383	75 %	0 %	25 %	0 %	16752304
33	NC_002179	AGTA	2	8	11512	11519	50 %	25 %	25 %	0 %	16752304
34	NC_002179	CATT	2	8	11580	11587	25 %	50 %	0 %	25 %	16752304
35	NC_002179	AAGG	2	8	11775	11782	50 %	0 %	50 %	0 %	16752304
36	NC_002179	CAGG	2	8	11905	11912	25 %	0 %	50 %	25 %	16752304
37	NC_002179	TGAA	2	8	12438	12445	50 %	25 %	25 %	0 %	16752304
38	NC_002179	TTTG	2	8	12954	12961	0 %	75 %	25 %	0 %	16752304
39	NC_002179	TCTT	2	8	14598	14605	0 %	75 %	0 %	25 %	16752305
40	NC_002179	GGTT	2	8	15063	15070	0 %	50 %	50 %	0 %	16752305
41	NC_002179	AGAA	2	8	15541	15548	75 %	0 %	25 %	0 %	16752305
42	NC_002179	ATCT	2	8	15678	15685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002179	AGAT	2	8	16045	16052	50 %	25 %	25 %	0 %	16752306
44	NC_002179	AGAA	2	8	17975	17982	75 %	0 %	25 %	0 %	16752308
45	NC_002179	CTTT	2	8	18246	18253	0 %	75 %	0 %	25 %	16752308
46	NC_002179	GTTC	2	8	18703	18710	0 %	50 %	25 %	25 %	16752309
47	NC_002179	GGAG	2	8	19461	19468	25 %	0 %	75 %	0 %	16752309
48	NC_002179	TTTA	2	8	19873	19880	25 %	75 %	0 %	0 %	16752310
49	NC_002179	GATT	2	8	20262	20269	25 %	50 %	25 %	0 %	16752311
50	NC_002179	GTTC	2	8	20899	20906	0 %	50 %	25 %	25 %	16752311
51	NC_002179	TGCT	2	8	21345	21352	0 %	50 %	25 %	25 %	16752311
52	NC_002179	TGTT	2	8	21626	21633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002179	CTTT	2	8	21650	21657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002179	ATTA	2	8	23030	23037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002179	CCAC	2	8	23414	23421	25 %	0 %	0 %	75 %	16752312
56	NC_002179	CTTC	2	8	23688	23695	0 %	50 %	0 %	50 %	16752312
57	NC_002179	CAGA	2	8	23825	23832	50 %	0 %	25 %	25 %	16752312
58	NC_002179	GTTT	2	8	24936	24943	0 %	75 %	25 %	0 %	16752312
59	NC_002179	AATA	2	8	25148	25155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002179	TGAT	2	8	25251	25258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002179	TTCT	2	8	25295	25302	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_002179	TAAA	2	8	25557	25564	75 %	25 %	0 %	0 %	16752313
63	NC_002179	CTTT	2	8	26253	26260	0 %	75 %	0 %	25 %	16752313
64	NC_002179	TCAT	2	8	27266	27273	25 %	50 %	0 %	25 %	16752313
65	NC_002179	ATGT	2	8	27306	27313	25 %	50 %	25 %	0 %	16752313
66	NC_002179	AGCT	2	8	27732	27739	25 %	25 %	25 %	25 %	16752313
67	NC_002179	ATAA	2	8	28011	28018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002179	TTAA	2	8	28168	28175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002179	GCGA	2	8	28381	28388	25 %	0 %	50 %	25 %	16752314
70	NC_002179	GGCA	2	8	28836	28843	25 %	0 %	50 %	25 %	16752314
71	NC_002179	AAAC	2	8	29741	29748	75 %	0 %	0 %	25 %	16752314
72	NC_002179	GATC	2	8	29952	29959	25 %	25 %	25 %	25 %	16752314
73	NC_002179	TTAC	2	8	30378	30385	25 %	50 %	0 %	25 %	16752314
74	NC_002179	CTCG	2	8	30846	30853	0 %	25 %	25 %	50 %	16752315
75	NC_002179	GCTT	2	8	31210	31217	0 %	50 %	25 %	25 %	16752316
76	NC_002179	TTTG	2	8	32916	32923	0 %	75 %	25 %	0 %	16752318
77	NC_002179	TAGA	2	8	33305	33312	50 %	25 %	25 %	0 %	16752319
78	NC_002179	GTAA	2	8	33436	33443	50 %	25 %	25 %	0 %	16752319
79	NC_002179	TTTA	2	8	33471	33478	25 %	75 %	0 %	0 %	16752319
80	NC_002179	TGCT	2	8	34387	34394	0 %	50 %	25 %	25 %	16752320
81	NC_002179	ATAA	2	8	34484	34491	75 %	25 %	0 %	0 %	16752320
82	NC_002179	TAAT	2	8	34642	34649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002179	AAAT	2	8	34666	34673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002179	TTTA	2	8	34722	34729	25 %	75 %	0 %	0 %	16752321
85	NC_002179	TCCT	2	8	34961	34968	0 %	50 %	0 %	50 %	16752321
86	NC_002179	GTTT	2	8	35072	35079	0 %	75 %	25 %	0 %	16752321
87	NC_002179	TGGA	2	8	35355	35362	25 %	25 %	50 %	0 %	16752321
88	NC_002179	TCAG	2	8	35599	35606	25 %	25 %	25 %	25 %	16752321
89	NC_002179	TACA	2	8	35636	35643	50 %	25 %	0 %	25 %	16752321
90	NC_002179	CTTT	2	8	35681	35688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002179	GAAA	2	8	35732	35739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002179	TGAA	2	8	36370	36377	50 %	25 %	25 %	0 %	16752323
93	NC_002179	AGAT	2	8	36700	36707	50 %	25 %	25 %	0 %	16752324
94	NC_002179	TAAA	2	8	38588	38595	75 %	25 %	0 %	0 %	16752325
95	NC_002179	GTAG	2	8	39358	39365	25 %	25 %	50 %	0 %	16752325
96	NC_002179	CCCG	2	8	39858	39865	0 %	0 %	25 %	75 %	16752325
97	NC_002179	AAAG	2	8	39891	39898	75 %	0 %	25 %	0 %	16752325
98	NC_002179	TGCT	2	8	39901	39908	0 %	50 %	25 %	25 %	16752325
99	NC_002179	ATCC	2	8	40103	40110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002179	GCCT	2	8	40233	40240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002179	GAAA	2	8	40519	40526	75 %	0 %	25 %	0 %	16752326
102	NC_002179	TTAC	2	8	40616	40623	25 %	50 %	0 %	25 %	16752326
103	NC_002179	GAAA	2	8	41278	41285	75 %	0 %	25 %	0 %	16752326
104	NC_002179	TTTA	2	8	41301	41308	25 %	75 %	0 %	0 %	16752326
105	NC_002179	TAAA	2	8	41367	41374	75 %	25 %	0 %	0 %	16752326
106	NC_002179	TTCC	2	8	41472	41479	0 %	50 %	0 %	50 %	16752326
107	NC_002179	GTGC	2	8	41969	41976	0 %	25 %	50 %	25 %	16752327
108	NC_002179	TTCT	2	8	42548	42555	0 %	75 %	0 %	25 %	16752328
109	NC_002179	GAAA	2	8	43034	43041	75 %	0 %	25 %	0 %	16752328
110	NC_002179	AAGG	2	8	43125	43132	50 %	0 %	50 %	0 %	16752328
111	NC_002179	GTTT	2	8	43807	43814	0 %	75 %	25 %	0 %	16752328
112	NC_002179	TGTT	2	8	43918	43925	0 %	75 %	25 %	0 %	16752328
113	NC_002179	ATCA	2	8	44031	44038	50 %	25 %	0 %	25 %	16752328
114	NC_002179	GCAT	2	8	44251	44258	25 %	25 %	25 %	25 %	16752328
115	NC_002179	TGAT	2	8	44713	44720	25 %	50 %	25 %	0 %	16752328
116	NC_002179	GAAG	2	8	44765	44772	50 %	0 %	50 %	0 %	16752328
117	NC_002179	AATA	2	8	44796	44803	75 %	25 %	0 %	0 %	16752328
118	NC_002179	ATTA	2	8	44821	44828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002179	TTAA	2	8	46252	46259	50 %	50 %	0 %	0 %	16752332
120	NC_002179	ATTG	2	8	46345	46352	25 %	50 %	25 %	0 %	16752332
121	NC_002179	GAGT	2	8	46791	46798	25 %	25 %	50 %	0 %	16752333
122	NC_002179	TAAA	2	8	47879	47886	75 %	25 %	0 %	0 %	16752333
123	NC_002179	TAGA	2	8	47948	47955	50 %	25 %	25 %	0 %	16752334
124	NC_002179	TGCT	2	8	48197	48204	0 %	50 %	25 %	25 %	16752334
125	NC_002179	GGAA	2	8	48522	48529	50 %	0 %	50 %	0 %	16752335
126	NC_002179	TCAT	2	8	49972	49979	25 %	50 %	0 %	25 %	16752336
127	NC_002179	CAGT	2	8	50219	50226	25 %	25 %	25 %	25 %	16752336
128	NC_002179	AAAG	2	8	50375	50382	75 %	0 %	25 %	0 %	16752336
129	NC_002179	CTTT	2	8	51028	51035	0 %	75 %	0 %	25 %	16752337
130	NC_002179	TCTT	2	8	51044	51051	0 %	75 %	0 %	25 %	16752337
131	NC_002179	TAGA	2	8	51455	51462	50 %	25 %	25 %	0 %	16752337
132	NC_002179	GAAA	2	8	51546	51553	75 %	0 %	25 %	0 %	16752337
133	NC_002179	GTAA	2	8	52731	52738	50 %	25 %	25 %	0 %	16752338
134	NC_002179	GAAC	2	8	52747	52754	50 %	0 %	25 %	25 %	16752338
135	NC_002179	TATC	2	8	52898	52905	25 %	50 %	0 %	25 %	16752338
136	NC_002179	GAAC	2	8	53287	53294	50 %	0 %	25 %	25 %	16752338
137	NC_002179	TCCC	2	8	53833	53840	0 %	25 %	0 %	75 %	16752338
138	NC_002179	TTTA	2	8	54416	54423	25 %	75 %	0 %	0 %	16752338
139	NC_002179	AAGG	2	8	54519	54526	50 %	0 %	50 %	0 %	16752338
140	NC_002179	GGAA	2	8	55858	55865	50 %	0 %	50 %	0 %	16752339
141	NC_002179	TTTG	2	8	55917	55924	0 %	75 %	25 %	0 %	16752339
142	NC_002179	CTTT	2	8	55933	55940	0 %	75 %	0 %	25 %	16752339
143	NC_002179	TAGA	2	8	56328	56335	50 %	25 %	25 %	0 %	16752340
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