MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 2735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	GGTT	2	8	1071	1078	0 %	50 %	50 %	0 %	16752297
2	NC_002179	TAAT	2	8	1696	1703	50 %	50 %	0 %	0 %	16752298
3	NC_002179	GATT	2	8	1729	1736	25 %	50 %	25 %	0 %	16752298
4	NC_002179	AGCT	2	8	1747	1754	25 %	25 %	25 %	25 %	16752298
5	NC_002179	GTAG	2	8	2007	2014	25 %	25 %	50 %	0 %	16752298
6	NC_002179	GCCA	2	8	2857	2864	25 %	0 %	25 %	50 %	16752299
7	NC_002179	CTGT	2	8	2927	2934	0 %	50 %	25 %	25 %	16752299
8	NC_002179	AATT	2	8	3467	3474	50 %	50 %	0 %	0 %	16752300
9	NC_002179	TTTC	2	8	3764	3771	0 %	75 %	0 %	25 %	16752300
10	NC_002179	AGTT	2	8	3938	3945	25 %	50 %	25 %	0 %	16752300
11	NC_002179	CTTC	2	8	4418	4425	0 %	50 %	0 %	50 %	16752300
12	NC_002179	TGTT	2	8	4580	4587	0 %	75 %	25 %	0 %	16752300
13	NC_002179	CTTT	2	8	5278	5285	0 %	75 %	0 %	25 %	16752300
14	NC_002179	GAAG	2	8	6028	6035	50 %	0 %	50 %	0 %	16752301
15	NC_002179	GAAA	2	8	6133	6140	75 %	0 %	25 %	0 %	16752301
16	NC_002179	GTGG	2	8	7419	7426	0 %	25 %	75 %	0 %	16752302
17	NC_002179	TAGA	2	8	7904	7911	50 %	25 %	25 %	0 %	16752303
18	NC_002179	ATCA	2	8	8005	8012	50 %	25 %	0 %	25 %	16752303
19	NC_002179	AAAT	2	8	8488	8495	75 %	25 %	0 %	0 %	16752303
20	NC_002179	TAGG	2	8	8613	8620	25 %	25 %	50 %	0 %	16752303
21	NC_002179	GCAA	2	8	8644	8651	50 %	0 %	25 %	25 %	16752303
22	NC_002179	AAAT	2	8	9026	9033	75 %	25 %	0 %	0 %	16752303
23	NC_002179	AAAG	2	8	9068	9075	75 %	0 %	25 %	0 %	16752303
24	NC_002179	TAGG	2	8	9435	9442	25 %	25 %	50 %	0 %	16752303
25	NC_002179	TAGG	2	8	9578	9585	25 %	25 %	50 %	0 %	16752303
26	NC_002179	TTGG	2	8	10236	10243	0 %	50 %	50 %	0 %	16752303
27	NC_002179	TAGT	2	8	10367	10374	25 %	50 %	25 %	0 %	16752303
28	NC_002179	TCAA	2	8	10718	10725	50 %	25 %	0 %	25 %	16752303
29	NC_002179	ATAA	2	8	11305	11312	75 %	25 %	0 %	0 %	16752304
30	NC_002179	AAAG	2	8	11376	11383	75 %	0 %	25 %	0 %	16752304
31	NC_002179	AGTA	2	8	11512	11519	50 %	25 %	25 %	0 %	16752304
32	NC_002179	CATT	2	8	11580	11587	25 %	50 %	0 %	25 %	16752304
33	NC_002179	AAGG	2	8	11775	11782	50 %	0 %	50 %	0 %	16752304
34	NC_002179	CAGG	2	8	11905	11912	25 %	0 %	50 %	25 %	16752304
35	NC_002179	TGAA	2	8	12438	12445	50 %	25 %	25 %	0 %	16752304
36	NC_002179	TTTG	2	8	12954	12961	0 %	75 %	25 %	0 %	16752304
37	NC_002179	TCTT	2	8	14598	14605	0 %	75 %	0 %	25 %	16752305
38	NC_002179	GGTT	2	8	15063	15070	0 %	50 %	50 %	0 %	16752305
39	NC_002179	AGAA	2	8	15541	15548	75 %	0 %	25 %	0 %	16752305
40	NC_002179	AGAT	2	8	16045	16052	50 %	25 %	25 %	0 %	16752306
41	NC_002179	AGAA	2	8	17975	17982	75 %	0 %	25 %	0 %	16752308
42	NC_002179	CTTT	2	8	18246	18253	0 %	75 %	0 %	25 %	16752308
43	NC_002179	GTTC	2	8	18703	18710	0 %	50 %	25 %	25 %	16752309
44	NC_002179	GGAG	2	8	19461	19468	25 %	0 %	75 %	0 %	16752309
45	NC_002179	TTTA	2	8	19873	19880	25 %	75 %	0 %	0 %	16752310
46	NC_002179	GATT	2	8	20262	20269	25 %	50 %	25 %	0 %	16752311
47	NC_002179	GTTC	2	8	20899	20906	0 %	50 %	25 %	25 %	16752311
48	NC_002179	TGCT	2	8	21345	21352	0 %	50 %	25 %	25 %	16752311
49	NC_002179	CCAC	2	8	23414	23421	25 %	0 %	0 %	75 %	16752312
50	NC_002179	CTTC	2	8	23688	23695	0 %	50 %	0 %	50 %	16752312
51	NC_002179	CAGA	2	8	23825	23832	50 %	0 %	25 %	25 %	16752312
52	NC_002179	GTTT	2	8	24936	24943	0 %	75 %	25 %	0 %	16752312
53	NC_002179	TAAA	2	8	25557	25564	75 %	25 %	0 %	0 %	16752313
54	NC_002179	CTTT	2	8	26253	26260	0 %	75 %	0 %	25 %	16752313
55	NC_002179	TCAT	2	8	27266	27273	25 %	50 %	0 %	25 %	16752313
56	NC_002179	ATGT	2	8	27306	27313	25 %	50 %	25 %	0 %	16752313
57	NC_002179	AGCT	2	8	27732	27739	25 %	25 %	25 %	25 %	16752313
58	NC_002179	GCGA	2	8	28381	28388	25 %	0 %	50 %	25 %	16752314
59	NC_002179	GGCA	2	8	28836	28843	25 %	0 %	50 %	25 %	16752314
60	NC_002179	AAAC	2	8	29741	29748	75 %	0 %	0 %	25 %	16752314
61	NC_002179	GATC	2	8	29952	29959	25 %	25 %	25 %	25 %	16752314
62	NC_002179	TTAC	2	8	30378	30385	25 %	50 %	0 %	25 %	16752314
63	NC_002179	CTCG	2	8	30846	30853	0 %	25 %	25 %	50 %	16752315
64	NC_002179	GCTT	2	8	31210	31217	0 %	50 %	25 %	25 %	16752316
65	NC_002179	TTTG	2	8	32916	32923	0 %	75 %	25 %	0 %	16752318
66	NC_002179	TAGA	2	8	33305	33312	50 %	25 %	25 %	0 %	16752319
67	NC_002179	GTAA	2	8	33436	33443	50 %	25 %	25 %	0 %	16752319
68	NC_002179	TTTA	2	8	33471	33478	25 %	75 %	0 %	0 %	16752319
69	NC_002179	TGCT	2	8	34387	34394	0 %	50 %	25 %	25 %	16752320
70	NC_002179	ATAA	2	8	34484	34491	75 %	25 %	0 %	0 %	16752320
71	NC_002179	TTTA	2	8	34722	34729	25 %	75 %	0 %	0 %	16752321
72	NC_002179	TCCT	2	8	34961	34968	0 %	50 %	0 %	50 %	16752321
73	NC_002179	GTTT	2	8	35072	35079	0 %	75 %	25 %	0 %	16752321
74	NC_002179	TGGA	2	8	35355	35362	25 %	25 %	50 %	0 %	16752321
75	NC_002179	TCAG	2	8	35599	35606	25 %	25 %	25 %	25 %	16752321
76	NC_002179	TACA	2	8	35636	35643	50 %	25 %	0 %	25 %	16752321
77	NC_002179	TGAA	2	8	36370	36377	50 %	25 %	25 %	0 %	16752323
78	NC_002179	AGAT	2	8	36700	36707	50 %	25 %	25 %	0 %	16752324
79	NC_002179	TAAA	2	8	38588	38595	75 %	25 %	0 %	0 %	16752325
80	NC_002179	GTAG	2	8	39358	39365	25 %	25 %	50 %	0 %	16752325
81	NC_002179	CCCG	2	8	39858	39865	0 %	0 %	25 %	75 %	16752325
82	NC_002179	AAAG	2	8	39891	39898	75 %	0 %	25 %	0 %	16752325
83	NC_002179	TGCT	2	8	39901	39908	0 %	50 %	25 %	25 %	16752325
84	NC_002179	GAAA	2	8	40519	40526	75 %	0 %	25 %	0 %	16752326
85	NC_002179	TTAC	2	8	40616	40623	25 %	50 %	0 %	25 %	16752326
86	NC_002179	GAAA	2	8	41278	41285	75 %	0 %	25 %	0 %	16752326
87	NC_002179	TTTA	2	8	41301	41308	25 %	75 %	0 %	0 %	16752326
88	NC_002179	TAAA	2	8	41367	41374	75 %	25 %	0 %	0 %	16752326
89	NC_002179	TTCC	2	8	41472	41479	0 %	50 %	0 %	50 %	16752326
90	NC_002179	GTGC	2	8	41969	41976	0 %	25 %	50 %	25 %	16752327
91	NC_002179	TTCT	2	8	42548	42555	0 %	75 %	0 %	25 %	16752328
92	NC_002179	GAAA	2	8	43034	43041	75 %	0 %	25 %	0 %	16752328
93	NC_002179	AAGG	2	8	43125	43132	50 %	0 %	50 %	0 %	16752328
94	NC_002179	GTTT	2	8	43807	43814	0 %	75 %	25 %	0 %	16752328
95	NC_002179	TGTT	2	8	43918	43925	0 %	75 %	25 %	0 %	16752328
96	NC_002179	ATCA	2	8	44031	44038	50 %	25 %	0 %	25 %	16752328
97	NC_002179	GCAT	2	8	44251	44258	25 %	25 %	25 %	25 %	16752328
98	NC_002179	TGAT	2	8	44713	44720	25 %	50 %	25 %	0 %	16752328
99	NC_002179	GAAG	2	8	44765	44772	50 %	0 %	50 %	0 %	16752328
100	NC_002179	AATA	2	8	44796	44803	75 %	25 %	0 %	0 %	16752328
101	NC_002179	TTAA	2	8	46252	46259	50 %	50 %	0 %	0 %	16752332
102	NC_002179	ATTG	2	8	46345	46352	25 %	50 %	25 %	0 %	16752332
103	NC_002179	GAGT	2	8	46791	46798	25 %	25 %	50 %	0 %	16752333
104	NC_002179	TAAA	2	8	47879	47886	75 %	25 %	0 %	0 %	16752333
105	NC_002179	TAGA	2	8	47948	47955	50 %	25 %	25 %	0 %	16752334
106	NC_002179	TGCT	2	8	48197	48204	0 %	50 %	25 %	25 %	16752334
107	NC_002179	GGAA	2	8	48522	48529	50 %	0 %	50 %	0 %	16752335
108	NC_002179	TCAT	2	8	49972	49979	25 %	50 %	0 %	25 %	16752336
109	NC_002179	CAGT	2	8	50219	50226	25 %	25 %	25 %	25 %	16752336
110	NC_002179	AAAG	2	8	50375	50382	75 %	0 %	25 %	0 %	16752336
111	NC_002179	CTTT	2	8	51028	51035	0 %	75 %	0 %	25 %	16752337
112	NC_002179	TCTT	2	8	51044	51051	0 %	75 %	0 %	25 %	16752337
113	NC_002179	TAGA	2	8	51455	51462	50 %	25 %	25 %	0 %	16752337
114	NC_002179	GAAA	2	8	51546	51553	75 %	0 %	25 %	0 %	16752337
115	NC_002179	GTAA	2	8	52731	52738	50 %	25 %	25 %	0 %	16752338
116	NC_002179	GAAC	2	8	52747	52754	50 %	0 %	25 %	25 %	16752338
117	NC_002179	TATC	2	8	52898	52905	25 %	50 %	0 %	25 %	16752338
118	NC_002179	GAAC	2	8	53287	53294	50 %	0 %	25 %	25 %	16752338
119	NC_002179	TCCC	2	8	53833	53840	0 %	25 %	0 %	75 %	16752338
120	NC_002179	TTTA	2	8	54416	54423	25 %	75 %	0 %	0 %	16752338
121	NC_002179	AAGG	2	8	54519	54526	50 %	0 %	50 %	0 %	16752338
122	NC_002179	GGAA	2	8	55858	55865	50 %	0 %	50 %	0 %	16752339
123	NC_002179	TTTG	2	8	55917	55924	0 %	75 %	25 %	0 %	16752339
124	NC_002179	CTTT	2	8	55933	55940	0 %	75 %	0 %	25 %	16752339
125	NC_002179	TAGA	2	8	56328	56335	50 %	25 %	25 %	0 %	16752340
126	NC_002179	CATA	2	8	56384	56391	50 %	25 %	0 %	25 %	16752340
127	NC_002179	GTGA	2	8	56472	56479	25 %	25 %	50 %	0 %	16752340
128	NC_002179	CTAA	2	8	57414	57421	50 %	25 %	0 %	25 %	16752342
129	NC_002179	CATA	2	8	57503	57510	50 %	25 %	0 %	25 %	16752342
130	NC_002179	CTTT	2	8	58381	58388	0 %	75 %	0 %	25 %	16752343
131	NC_002179	TCTT	2	8	59406	59413	0 %	75 %	0 %	25 %	16752344
132	NC_002179	TTAA	2	8	60236	60243	50 %	50 %	0 %	0 %	16752345
133	NC_002179	GTAG	2	8	60443	60450	25 %	25 %	50 %	0 %	16752345
134	NC_002179	GTTT	2	8	60660	60667	0 %	75 %	25 %	0 %	16752345
135	NC_002179	TCTA	2	8	61057	61064	25 %	50 %	0 %	25 %	16752345
136	NC_002179	GTGC	2	8	62701	62708	0 %	25 %	50 %	25 %	16752346
137	NC_002179	TTCA	2	8	62845	62852	25 %	50 %	0 %	25 %	16752346
138	NC_002179	CTTT	2	8	63397	63404	0 %	75 %	0 %	25 %	16752346
139	NC_002179	CTTC	2	8	63672	63679	0 %	50 %	0 %	50 %	16752346
140	NC_002179	TATT	2	8	63957	63964	25 %	75 %	0 %	0 %	16752346
141	NC_002179	GAAC	2	8	64064	64071	50 %	0 %	25 %	25 %	16752346
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