MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 15556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	CAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002179	AAC	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002179	AGA	3	9	125	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002179	AGA	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752297
5	NC_002179	CAG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752297
6	NC_002179	TTG	2	6	264	269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752297
7	NC_002179	ATT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752297
8	NC_002179	TGA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752297
9	NC_002179	CTC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752297
10	NC_002179	ATG	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752297
11	NC_002179	ATG	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752297
12	NC_002179	ATG	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752297
13	NC_002179	CTT	2	6	802	807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752297
14	NC_002179	TCT	2	6	912	917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752297
15	NC_002179	GAG	3	9	924	932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752297
16	NC_002179	CAA	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752297
17	NC_002179	ATT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752297
18	NC_002179	GAA	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002179	CAC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752298
20	NC_002179	AAT	2	6	1460	1465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752298
21	NC_002179	AAC	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752298
22	NC_002179	TTG	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752298
23	NC_002179	GTA	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752298
24	NC_002179	TTC	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752298
25	NC_002179	CTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752298
26	NC_002179	CTT	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752298
27	NC_002179	TGA	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752298
28	NC_002179	GTT	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752298
29	NC_002179	ATG	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752298
30	NC_002179	CGT	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752298
31	NC_002179	ACT	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752298
32	NC_002179	AAG	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752299
33	NC_002179	ATT	2	6	2889	2894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752299
34	NC_002179	AGG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752299
35	NC_002179	TAT	2	6	3059	3064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752299
36	NC_002179	TAT	2	6	3093	3098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752299
37	NC_002179	CAT	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002179	TAT	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002179	ATT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002179	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
41	NC_002179	GAG	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752300
42	NC_002179	TTG	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
43	NC_002179	CGT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752300
44	NC_002179	TTC	2	6	3461	3466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752300
45	NC_002179	GAA	2	6	3550	3555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
46	NC_002179	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
47	NC_002179	CAG	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752300
48	NC_002179	GCG	2	6	3803	3808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16752300
49	NC_002179	ACG	2	6	3822	3827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752300
50	NC_002179	GTT	2	6	3880	3885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
51	NC_002179	GGT	2	6	3977	3982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752300
52	NC_002179	TTA	2	6	4151	4156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752300
53	NC_002179	TAA	2	6	4239	4244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752300
54	NC_002179	CTT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752300
55	NC_002179	AGA	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
56	NC_002179	GTC	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752300
57	NC_002179	TTG	2	6	4373	4378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
58	NC_002179	CAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752300
59	NC_002179	TTC	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752300
60	NC_002179	ACC	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752300
61	NC_002179	ATG	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752300
62	NC_002179	ACT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752300
63	NC_002179	TGG	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752300
64	NC_002179	GAT	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752300
65	NC_002179	CCA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752300
66	NC_002179	TCT	3	9	4843	4851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752300
67	NC_002179	GTT	2	6	4882	4887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
68	NC_002179	AGA	3	9	4920	4928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
69	NC_002179	TTG	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752300
70	NC_002179	AAG	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
71	NC_002179	GAA	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
72	NC_002179	GAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
73	NC_002179	GAA	2	6	5386	5391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752300
74	NC_002179	CAA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002179	TTG	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002179	CGG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16752301
77	NC_002179	GAA	3	9	5714	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752301
78	NC_002179	AGG	2	6	5833	5838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752301
79	NC_002179	CTT	2	6	5867	5872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752301
80	NC_002179	TTA	2	6	5974	5979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752301
81	NC_002179	GTT	2	6	6066	6071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752301
82	NC_002179	GCT	2	6	6251	6256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752301
83	NC_002179	TCA	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752301
84	NC_002179	TGA	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752301
85	NC_002179	AGA	2	6	6355	6360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752301
86	NC_002179	CAC	2	6	6384	6389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752301
87	NC_002179	AGA	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752301
88	NC_002179	AAC	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752301
89	NC_002179	ACA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752301
90	NC_002179	GAA	2	6	6645	6650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752301
91	NC_002179	TAT	3	9	6758	6766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752302
92	NC_002179	CTT	2	6	6877	6882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752302
93	NC_002179	CTT	2	6	6934	6939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752302
94	NC_002179	AGA	2	6	6941	6946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752302
95	NC_002179	CTC	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752302
96	NC_002179	TTG	2	6	7073	7078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752302
97	NC_002179	TAG	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752302
98	NC_002179	TGG	2	6	7248	7253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752302
99	NC_002179	AAG	2	6	7438	7443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752302
100	NC_002179	ACA	2	6	7518	7523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16752302
101	NC_002179	TGG	2	6	7555	7560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752302
102	NC_002179	CTC	2	6	7582	7587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752302
103	NC_002179	GAA	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752302
104	NC_002179	GCT	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752303
105	NC_002179	CAT	3	9	7815	7823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752303
106	NC_002179	AAT	2	6	7969	7974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752303
107	NC_002179	GTA	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752303
108	NC_002179	AGT	2	6	8141	8146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752303
109	NC_002179	TGT	2	6	8300	8305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752303
110	NC_002179	AGA	2	6	8743	8748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752303
111	NC_002179	AAG	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752303
112	NC_002179	TTC	3	9	8806	8814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752303
113	NC_002179	GAA	2	6	8847	8852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752303
114	NC_002179	TGG	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752303
115	NC_002179	AAG	2	6	8868	8873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752303
116	NC_002179	TCA	2	6	8964	8969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752303
117	NC_002179	ATG	2	6	8995	9000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752303
118	NC_002179	TCT	2	6	9041	9046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752303
119	NC_002179	GAA	2	6	9129	9134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752303
120	NC_002179	TAG	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752303
121	NC_002179	AGA	2	6	9360	9365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752303
122	NC_002179	ACT	2	6	9403	9408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752303
123	NC_002179	ATT	2	6	9523	9528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752303
124	NC_002179	TCT	2	6	9548	9553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752303
125	NC_002179	TTG	2	6	9691	9696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752303
126	NC_002179	TCA	2	6	9716	9721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752303
127	NC_002179	GCA	2	6	9950	9955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752303
128	NC_002179	ATG	2	6	10063	10068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752303
129	NC_002179	ATC	2	6	10072	10077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752303
130	NC_002179	GCT	2	6	10092	10097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752303
131	NC_002179	TTG	2	6	10174	10179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752303
132	NC_002179	AGG	2	6	10227	10232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752303
133	NC_002179	CCA	2	6	10266	10271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752303
134	NC_002179	TGA	2	6	10379	10384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752303
135	NC_002179	AAG	2	6	10575	10580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752303
136	NC_002179	CTT	2	6	10957	10962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752304
137	NC_002179	TGA	2	6	10986	10991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752304
138	NC_002179	TTC	2	6	10997	11002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752304
139	NC_002179	AGG	2	6	11110	11115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752304
140	NC_002179	TGG	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16752304
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142	NC_002179	GAA	2	6	11167	11172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752304
143	NC_002179	AGA	2	6	11234	11239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752304
144	NC_002179	GTT	2	6	11268	11273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752304
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146	NC_002179	TTG	2	6	11611	11616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752304
147	NC_002179	TGT	2	6	11628	11633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752304
148	NC_002179	GAG	2	6	11783	11788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752304
149	NC_002179	GAA	2	6	11864	11869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752304
150	NC_002179	GAT	2	6	11970	11975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752304
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154	NC_002179	TGT	2	6	12113	12118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752304
155	NC_002179	TTA	2	6	12120	12125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752304
156	NC_002179	TGT	2	6	12461	12466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752304
157	NC_002179	TTC	2	6	12518	12523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752304
158	NC_002179	TTG	2	6	12551	12556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752304
159	NC_002179	GAA	2	6	12576	12581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752304
160	NC_002179	GTT	2	6	12643	12648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752304
161	NC_002179	GAA	2	6	12673	12678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752304
162	NC_002179	AGA	2	6	12710	12715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752304
163	NC_002179	AGG	2	6	12720	12725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752304
164	NC_002179	TCA	2	6	12762	12767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16752304
165	NC_002179	CCT	2	6	12901	12906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752304
166	NC_002179	GAG	2	6	12973	12978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752304
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170	NC_002179	TAA	2	6	13291	13296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752304
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172	NC_002179	ATT	2	6	13370	13375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752304
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174	NC_002179	AAG	2	6	13402	13407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752304
175	NC_002179	AAT	2	6	13431	13436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752304
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179	NC_002179	ATT	2	6	13592	13597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752304
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197	NC_002179	TTG	2	6	15205	15210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752305
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201	NC_002179	TGT	2	6	15871	15876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
202	NC_002179	TGA	2	6	15918	15923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16752306
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248	NC_002179	CCA	2	6	18667	18672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752309
249	NC_002179	GCA	2	6	18904	18909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752309
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260	NC_002179	GCT	2	6	19546	19551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_002179	TAA	3	9	19587	19595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_002179	AAT	2	6	19666	19671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_002179	ATC	2	6	19695	19700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_002179	AAG	2	6	19720	19725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_002179	GCT	2	6	19752	19757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_002179	CTT	2	6	19792	19797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_002179	TCC	2	6	19894	19899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16752310
268	NC_002179	GAA	2	6	19913	19918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16752310
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270	NC_002179	GCT	2	6	20114	20119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16752311
271	NC_002179	AGG	2	6	20164	20169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16752311
272	NC_002179	GCG	2	6	20234	20239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16752311
273	NC_002179	GCA	2	6	20274	20279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752311
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275	NC_002179	TTC	2	6	20322	20327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752311
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284	NC_002179	TAT	2	6	21260	21265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16752311
285	NC_002179	CAC	2	6	21420	21425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16752311
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289	NC_002179	CTT	2	6	21549	21554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16752311
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291	NC_002179	TCT	2	6	21686	21691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_002179	ACT	2	6	21858	21863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16753066
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294	NC_002179	AGA	2	6	21952	21957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16753066
295	NC_002179	AGG	2	6	22093	22098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16753066
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297	NC_002179	GCT	2	6	22469	22474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16753066
298	NC_002179	TCG	2	6	22515	22520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16753066
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301	NC_002179	TGC	2	6	22801	22806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16753066
302	NC_002179	TAA	2	6	23003	23008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_002179	ATA	2	6	23065	23070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_002179	TAT	2	6	23086	23091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_002179	GCA	2	6	23192	23197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16752312
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381	NC_002179	AAT	2	6	28717	28722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16752314
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386	NC_002179	TTG	2	6	29231	29236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16752314
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