MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 1546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	CAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002179	AAC	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002179	AGA	3	9	125	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002179	GAA	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002179	CAT	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002179	TAT	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002179	ATT	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002179	CAA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002179	TTG	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002179	TGT	2	6	15871	15876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002179	TTC	2	6	16611	16616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002179	GAA	2	6	16645	16650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002179	AAT	2	6	17665	17670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002179	GAT	2	6	17818	17823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002179	AGA	2	6	18554	18559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002179	GCT	2	6	19546	19551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_002179	TAA	3	9	19587	19595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002179	AAT	2	6	19666	19671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002179	ATC	2	6	19695	19700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002179	AAG	2	6	19720	19725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002179	GCT	2	6	19752	19757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002179	CTT	2	6	19792	19797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002179	TCT	2	6	21686	21691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_002179	TAA	2	6	23003	23008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002179	ATA	2	6	23065	23070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002179	TAT	2	6	23086	23091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002179	TTA	2	6	25088	25093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002179	TTG	2	6	25112	25117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002179	CTT	2	6	25174	25179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002179	CAG	2	6	25278	25283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002179	GAA	2	6	25342	25347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002179	AGG	2	6	34009	34014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002179	AAG	2	6	34042	34047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002179	ATT	2	6	34262	34267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002179	AAT	2	6	35780	35785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002179	CAT	3	9	35867	35875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002179	TAC	2	6	36576	36581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002179	TTA	2	6	36641	36646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002179	TTG	2	6	39936	39941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002179	AAG	2	6	39949	39954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002179	GAG	2	6	40154	40159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002179	GAA	2	6	40201	40206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002179	ATT	2	6	40364	40369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002179	ATT	2	6	41624	41629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002179	GAA	2	6	41777	41782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002179	TGC	2	6	41839	41844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002179	AGT	2	6	47888	47893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002179	GAT	2	6	54675	54680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002179	CCG	2	6	54686	54691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_002179	AAG	2	6	54732	54737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002179	GTC	2	6	54847	54852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002179	TTA	2	6	58128	58133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002179	AAC	2	6	59847	59852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002179	TAG	2	6	59990	59995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002179	TAA	2	6	59998	60003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002179	AAT	2	6	60059	60064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002179	AAG	2	6	60120	60125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002179	GAG	2	6	60173	60178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002179	ACG	2	6	61434	61439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002179	TTA	2	6	61556	61561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002179	AAG	2	6	61575	61580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002179	CTC	2	6	61700	61705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_002179	TCT	2	6	61828	61833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_002179	TTC	2	6	61861	61866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_002179	CTT	2	6	61879	61884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002179	TAT	2	6	61887	61892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002179	AAT	2	6	61917	61922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002179	ATA	2	6	61967	61972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002179	CTC	2	6	65275	65280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_002179	AGA	2	6	66407	66412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002179	TCT	2	6	66525	66530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002179	CTT	2	6	66563	66568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_002179	TCT	2	6	71412	71417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002179	AAG	2	6	72206	72211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002179	TCT	2	6	72223	72228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002179	GCT	2	6	72293	72298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002179	GAT	2	6	73217	73222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002179	TTA	2	6	76624	76629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002179	TAG	2	6	78629	78634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002179	TTG	2	6	79906	79911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002179	CTT	2	6	79941	79946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002179	CTC	2	6	80078	80083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_002179	TAA	2	6	80228	80233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002179	GTA	2	6	81024	81029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002179	ATT	2	6	81088	81093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002179	ATT	2	6	81120	81125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002179	TTG	2	6	82341	82346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002179	AGT	2	6	82350	82355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002179	TAA	2	6	83546	83551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002179	ATG	2	6	83599	83604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002179	ATA	2	6	83607	83612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002179	GAA	2	6	83621	83626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002179	TCT	2	6	84854	84859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002179	TGA	2	6	84884	84889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002179	AAG	2	6	86076	86081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002179	GAA	2	6	86408	86413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002179	TTG	2	6	86464	86469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002179	TTA	2	6	87869	87874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002179	ACA	3	9	90387	90395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002179	CAT	2	6	90402	90407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002179	GAA	2	6	96625	96630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002179	AGG	2	6	96665	96670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002179	TAG	2	6	96704	96709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002179	CTT	2	6	97120	97125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_002179	AAG	2	6	102100	102105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002179	ATA	2	6	102201	102206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002179	CAG	2	6	102240	102245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002179	TTG	2	6	102263	102268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002179	CAA	2	6	104607	104612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002179	TTA	2	6	109927	109932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002179	AGG	2	6	109965	109970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002179	AAG	2	6	110999	111004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002179	TCC	2	6	111222	111227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_002179	ATT	2	6	111244	111249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002179	ATT	2	6	115196	115201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002179	ATC	2	6	125548	125553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002179	TGG	2	6	125615	125620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002179	GTA	2	6	126799	126804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002179	ACT	2	6	126856	126861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002179	ATC	2	6	126886	126891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002179	CTC	2	6	128087	128092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_002179	ACT	2	6	131108	131113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002179	ACG	2	6	131133	131138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002179	TCT	2	6	131180	131185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_002179	ATA	2	6	131197	131202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002179	TTC	2	6	131256	131261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002179	CGG	2	6	131289	131294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_002179	AAC	2	6	131360	131365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002179	TGA	2	6	133124	133129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002179	TAT	2	6	134088	134093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002179	TCT	2	6	134115	134120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002179	ATG	2	6	141934	141939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002179	ATT	2	6	142598	142603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002179	TGT	2	6	142623	142628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002179	CTT	2	6	145456	145461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002179	CTT	2	6	145540	145545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_002179	ATG	2	6	145594	145599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002179	CGA	2	6	148507	148512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_002179	ATT	2	6	148885	148890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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