MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae AR39

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002179	AT	4	8	157	164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002179	TA	3	6	19739	19744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002179	GA	3	6	25082	25087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002179	AC	3	6	25129	25134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002179	CT	4	8	28249	28256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002179	TA	3	6	34029	34034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002179	GA	3	6	45110	45115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002179	AG	4	8	45383	45390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002179	TA	3	6	54660	54665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002179	TC	3	6	54875	54880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002179	AT	3	6	54888	54893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002179	TC	3	6	56784	56789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_002179	CT	3	6	56808	56813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_002179	TA	5	10	61668	61677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002179	TG	3	6	66590	66595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002179	AT	3	6	74591	74596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002179	AT	3	6	78645	78650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002179	CT	3	6	79947	79952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002179	TG	3	6	79981	79986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002179	TC	3	6	80959	80964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002179	TC	3	6	80986	80991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002179	CT	3	6	84840	84845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002179	GC	3	6	97232	97237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002179	AG	3	6	111946	111951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002179	AG	3	6	112991	112996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002179	AT	3	6	132910	132915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002179	AG	3	6	132936	132941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002179	CT	3	6	133215	133220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002179	AT	3	6	133301	133306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002179	GC	3	6	145563	145568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002179	CT	3	6	149297	149302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002179	CT	3	6	149379	149384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002179	TC	3	6	162076	162081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002179	AC	3	6	162105	162110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_002179	TC	3	6	173849	173854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002179	CT	3	6	187130	187135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002179	AG	3	6	195893	195898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002179	TC	3	6	195938	195943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002179	CT	4	8	197621	197628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_002179	TC	3	6	204780	204785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002179	AG	3	6	204931	204936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002179	CT	3	6	210031	210036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_002179	AG	3	6	210062	210067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002179	AG	3	6	210678	210683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002179	GA	3	6	214590	214595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002179	GT	3	6	214630	214635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002179	CT	3	6	214667	214672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002179	GA	3	6	222978	222983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002179	AG	3	6	233891	233896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002179	CT	3	6	234232	234237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002179	AT	3	6	237641	237646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002179	TC	3	6	237746	237751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002179	CT	3	6	240738	240743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_002179	TA	3	6	251508	251513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002179	AT	3	6	266113	266118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002179	GA	3	6	270517	270522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002179	TC	3	6	270566	270571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002179	TA	3	6	273668	273673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002179	AT	3	6	281081	281086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002179	AG	3	6	281526	281531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002179	TC	4	8	281598	281605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002179	TC	3	6	281933	281938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002179	TA	3	6	291865	291870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002179	AT	3	6	293589	293594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002179	AG	3	6	296110	296115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002179	CT	3	6	296125	296130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002179	TA	3	6	296157	296162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002179	AG	3	6	299497	299502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002179	AG	3	6	299854	299859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002179	AG	3	6	300211	300216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002179	GA	3	6	300272	300277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002179	AG	3	6	300826	300831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002179	GT	3	6	300947	300952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002179	AG	3	6	301517	301522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002179	AT	3	6	302021	302026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002179	TA	3	6	310478	310483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002179	AC	3	6	312590	312595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002179	CT	4	8	317476	317483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002179	TC	5	10	319840	319849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002179	TC	3	6	319859	319864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002179	GA	3	6	322335	322340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002179	CT	3	6	333406	333411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002179	GA	4	8	336278	336285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002179	GA	3	6	336334	336339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002179	GA	3	6	341083	341088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002179	GA	3	6	351041	351046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002179	GA	3	6	351164	351169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002179	AT	3	6	352507	352512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002179	GA	3	6	353269	353274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002179	AG	4	8	365090	365097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002179	CT	3	6	376358	376363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002179	AG	3	6	376367	376372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002179	TG	3	6	376525	376530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002179	TA	3	6	387177	387182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002179	AG	3	6	387251	387256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002179	TG	3	6	391839	391844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002179	TG	3	6	392099	392104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002179	AT	3	6	393742	393747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002179	GA	3	6	395390	395395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_002179	AG	3	6	422937	422942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002179	AG	3	6	422982	422987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002179	GA	3	6	422994	422999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002179	AG	3	6	424184	424189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002179	CT	3	6	424240	424245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002179	GA	3	6	424262	424267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002179	CA	3	6	428256	428261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002179	AT	3	6	428449	428454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002179	AG	3	6	429638	429643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002179	AT	3	6	431438	431443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002179	AG	3	6	439638	439643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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114	NC_002179	AG	3	6	448489	448494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002179	AG	3	6	457132	457137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002179	AG	3	6	457364	457369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002179	GA	3	6	457602	457607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002179	AG	3	6	457821	457826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002179	CT	3	6	459029	459034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002179	TA	3	6	462003	462008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002179	TA	3	6	462072	462077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002179	TA	3	6	466204	466209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002179	AT	3	6	468393	468398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002179	TA	3	6	484382	484387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002179	GA	3	6	487752	487757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002179	TA	3	6	492069	492074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002179	CT	3	6	492173	492178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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132	NC_002179	AT	3	6	523577	523582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002179	GA	3	6	523617	523622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002179	TA	3	6	526374	526379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002179	AT	3	6	526596	526601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_002179	AT	3	6	542331	542336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_002179	TA	3	6	542619	542624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002179	GA	3	6	545036	545041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_002179	TC	3	6	546217	546222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_002179	GA	3	6	548083	548088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002179	TA	3	6	548976	548981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002179	AT	3	6	549028	549033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_002179	AT	3	6	560534	560539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002179	TA	3	6	564599	564604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_002179	TA	3	6	579667	579672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.