MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 = ATCC 700819 chromosome

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002163	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002163	ATTTAT	2	12	41179	41190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002163	TACAGC	2	12	67634	67645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002163	CTTTTA	2	12	67905	67916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_002163	TAAAAT	2	12	96042	96053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002163	ATTTTT	2	12	165702	165713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002163	ATATTA	2	12	172723	172734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002163	AATATT	2	12	172865	172876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002163	GTTTAT	2	12	206578	206589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002163	AAAATT	2	12	208946	208957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002163	TTTGAA	2	12	209121	209132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002163	TATTTT	2	12	209221	209232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002163	TTAATT	2	12	224100	224111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002163	TATATT	2	12	224673	224684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002163	AAAAAT	2	12	226083	226094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002163	TGGTTT	2	12	227740	227751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002163	TATATT	2	12	240839	240850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002163	TATAAA	2	12	240977	240988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002163	AAAATT	2	12	268988	268999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002163	TATTTT	2	12	364201	364212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002163	TGTGTT	2	12	371632	371643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002163	ATTTAT	2	12	396060	396071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002163	TTTATT	2	12	399783	399794	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002163	TAAGGA	2	12	413323	413334	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002163	AGTTAG	2	12	451068	451079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002163	AAAAGA	2	12	451681	451692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002163	ATTTGT	2	12	451780	451791	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002163	ATTTTT	2	12	452047	452058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002163	AAAAGG	2	12	452128	452139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002163	AATTTA	2	12	477689	477700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002163	GTTTTT	2	12	486187	486198	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002163	AAAATA	2	12	494045	494056	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002163	TTTTAA	2	12	522629	522640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002163	TTATAT	2	12	577185	577196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002163	ATTAAA	2	12	577425	577436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002163	ATATTT	2	12	578265	578276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002163	ATATAA	2	12	587839	587850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002163	TAATAG	2	12	616487	616498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002163	ATTTAA	2	12	625430	625441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002163	TACAAA	2	12	627639	627650	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_002163	ATTGCT	2	12	633365	633376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_002163	CTAATG	2	12	633429	633440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002163	TTTATT	2	12	635571	635582	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002163	TAAATT	2	12	635640	635651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002163	ATTTTT	2	12	641821	641832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002163	ATAATT	2	12	669298	669309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002163	TTAAAT	2	12	688880	688891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002163	ATTTTA	2	12	693930	693941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002163	TAACTT	2	12	694937	694948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_002163	AATTTA	2	12	695482	695493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002163	ATTTAT	2	12	698354	698365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002163	TCTTAT	2	12	702051	702062	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_002163	GGGTTG	2	12	702408	702419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002163	GTTTGG	2	12	702590	702601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002163	AATTAA	2	12	703895	703906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002163	TCAAAA	2	12	703927	703938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_002163	TTAGCT	2	12	704376	704387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_002163	CTTCTA	2	12	704394	704405	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002163	ATATAG	2	12	765794	765805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002163	AAATTT	2	12	768797	768808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002163	AATTTT	2	12	782095	782106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002163	AAATTA	2	12	810700	810711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002163	ACAAAG	2	12	823524	823535	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_002163	TTTTTA	2	12	826001	826012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002163	AATAAA	2	12	872397	872408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002163	ATTTTT	2	12	890959	890970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002163	TTCATT	2	12	891357	891368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_002163	ATCTTA	2	12	901540	901551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_002163	ATCTTA	2	12	906755	906766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_002163	TATAAA	2	12	907012	907023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002163	ATCTTA	2	12	907038	907049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_002163	ATTTTA	2	12	1029387	1029398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002163	TTAATT	2	12	1128219	1128230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002163	TTAATT	2	12	1156206	1156217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002163	AATTTT	2	12	1191665	1191676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002163	CTTTAT	2	12	1239660	1239671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_002163	ATTTAA	2	12	1251711	1251722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002163	CAAAAA	2	12	1312411	1312422	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_002163	TTAATT	2	12	1322462	1322473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002163	TTTACT	2	12	1325763	1325774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_002163	AAATGA	2	12	1326374	1326385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002163	AAAGAA	2	12	1326390	1326401	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002163	AGTGCA	2	12	1330154	1330165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_002163	TAAAAA	2	12	1404422	1404433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002163	TATAAT	2	12	1459866	1459877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002163	TAGCTT	2	12	1490458	1490469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_002163	ATTTTT	2	12	1491080	1491091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002163	TTTGTG	2	12	1491247	1491258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002163	ATAAAA	2	12	1491943	1491954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002163	TAAAAA	2	12	1525313	1525324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002163	ATTTTT	2	12	1583494	1583505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002163	TAAAAA	2	12	1626356	1626367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002163	GCAGGC	2	12	1634010	1634021	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002163	TAAAAT	2	12	1637896	1637907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002163	AAGCCT	2	12	1637999	1638010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.