MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 = ATCC 700819 chromosome

Total Repeats: 1654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002163	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	218561694
2	NC_002163	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	218561694
3	NC_002163	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	218561694
4	NC_002163	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	218561695
5	NC_002163	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	218561696
6	NC_002163	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	218561697
7	NC_002163	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002163	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002163	GTTTT	2	10	7487	7496	0 %	80 %	20 %	0 %	218561699
10	NC_002163	ATTTT	2	10	8704	8713	20 %	80 %	0 %	0 %	218561700
11	NC_002163	AAGAG	2	10	9736	9745	60 %	0 %	40 %	0 %	218561700
12	NC_002163	TGCTT	2	10	10045	10054	0 %	60 %	20 %	20 %	218561700
13	NC_002163	ACTTC	2	10	10398	10407	20 %	40 %	0 %	40 %	218561700
14	NC_002163	TCAAA	2	10	10960	10969	60 %	20 %	0 %	20 %	218561700
15	NC_002163	TTTTA	2	10	13052	13061	20 %	80 %	0 %	0 %	218561701
16	NC_002163	AATTT	2	10	13236	13245	40 %	60 %	0 %	0 %	218561701
17	NC_002163	TAGAT	2	10	13264	13273	40 %	40 %	20 %	0 %	218561701
18	NC_002163	TATTT	2	10	13709	13718	20 %	80 %	0 %	0 %	218561701
19	NC_002163	CTTTA	2	10	14037	14046	20 %	60 %	0 %	20 %	218561701
20	NC_002163	GACAA	2	10	15321	15330	60 %	0 %	20 %	20 %	218561702
21	NC_002163	CTTAA	2	10	16750	16759	40 %	40 %	0 %	20 %	218561705
22	NC_002163	CATTT	2	10	17300	17309	20 %	60 %	0 %	20 %	218561705
23	NC_002163	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002163	GCGAT	2	10	17570	17579	20 %	20 %	40 %	20 %	218561706
25	NC_002163	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002163	TTTCA	2	10	20266	20275	20 %	60 %	0 %	20 %	218561708
27	NC_002163	AAGAT	2	10	21808	21817	60 %	20 %	20 %	0 %	218561709
28	NC_002163	ACCAA	2	10	23471	23480	60 %	0 %	0 %	40 %	218561711
29	NC_002163	AAAAT	2	10	23612	23621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002163	GTTAA	2	10	23639	23648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002163	TTTAT	2	10	27401	27410	20 %	80 %	0 %	0 %	218561715
32	NC_002163	TTCTT	2	10	28156	28165	0 %	80 %	0 %	20 %	218561715
33	NC_002163	TTTGG	2	10	28829	28838	0 %	60 %	40 %	0 %	218561716
34	NC_002163	AGATA	2	10	29914	29923	60 %	20 %	20 %	0 %	218561717
35	NC_002163	GCTTT	2	10	30428	30437	0 %	60 %	20 %	20 %	218561717
36	NC_002163	ATACT	2	10	31837	31846	40 %	40 %	0 %	20 %	218561717
37	NC_002163	AATCC	2	10	32288	32297	40 %	20 %	0 %	40 %	218561718
38	NC_002163	TGTTT	2	10	33275	33284	0 %	80 %	20 %	0 %	218561718
39	NC_002163	GCAAA	2	10	33342	33351	60 %	0 %	20 %	20 %	218561718
40	NC_002163	AAAGT	2	10	34244	34253	60 %	20 %	20 %	0 %	218561719
41	NC_002163	AAAAT	2	10	35496	35505	80 %	20 %	0 %	0 %	218561720
42	NC_002163	ATTAT	2	10	36241	36250	40 %	60 %	0 %	0 %	218561721
43	NC_002163	AAATC	2	10	36911	36920	60 %	20 %	0 %	20 %	218561721
44	NC_002163	TATAT	2	10	38733	38742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002163	CTTTT	2	10	39020	39029	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002163	CTTTT	2	10	39190	39199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002163	GGTAA	2	10	39502	39511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002163	TCGTG	2	10	40298	40307	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_002163	TCTTT	2	10	41326	41335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_002163	TAACT	2	10	41340	41349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_002163	CCGTA	2	10	43185	43194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_002163	AAAAT	2	10	45309	45318	80 %	20 %	0 %	0 %	218561723
53	NC_002163	TTGAC	2	10	47034	47043	20 %	40 %	20 %	20 %	218561724
54	NC_002163	AAGAA	2	10	47938	47947	80 %	0 %	20 %	0 %	218561724
55	NC_002163	ATGTT	2	10	48036	48045	20 %	60 %	20 %	0 %	218561724
56	NC_002163	GAAAT	2	10	49444	49453	60 %	20 %	20 %	0 %	218561724
57	NC_002163	AAAAG	2	10	49742	49751	80 %	0 %	20 %	0 %	218561724
58	NC_002163	AAAAT	2	10	50080	50089	80 %	20 %	0 %	0 %	218561724
59	NC_002163	GAAAA	2	10	51473	51482	80 %	0 %	20 %	0 %	218561725
60	NC_002163	GTTTA	2	10	51684	51693	20 %	60 %	20 %	0 %	218561725
61	NC_002163	AGCTT	2	10	51945	51954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_002163	CAAAT	2	10	53994	54003	60 %	20 %	0 %	20 %	218561728
63	NC_002163	TACTC	2	10	56274	56283	20 %	40 %	0 %	40 %	218561729
64	NC_002163	GATAA	2	10	56672	56681	60 %	20 %	20 %	0 %	218561730
65	NC_002163	ACCGC	2	10	57590	57599	20 %	0 %	20 %	60 %	218561731
66	NC_002163	CTTTT	2	10	57756	57765	0 %	80 %	0 %	20 %	218561731
67	NC_002163	TTTCA	2	10	58003	58012	20 %	60 %	0 %	20 %	218561731
68	NC_002163	AAGAT	2	10	59395	59404	60 %	20 %	20 %	0 %	218561732
69	NC_002163	TAATG	2	10	59447	59456	40 %	40 %	20 %	0 %	218561732
70	NC_002163	GATAA	2	10	59772	59781	60 %	20 %	20 %	0 %	218561733
71	NC_002163	AAATT	2	10	60681	60690	60 %	40 %	0 %	0 %	218561733
72	NC_002163	TACTA	2	10	62540	62549	40 %	40 %	0 %	20 %	218561735
73	NC_002163	TGCTT	2	10	63334	63343	0 %	60 %	20 %	20 %	218561735
74	NC_002163	AATAT	2	10	63519	63528	60 %	40 %	0 %	0 %	218561735
75	NC_002163	CATTT	2	10	64118	64127	20 %	60 %	0 %	20 %	218561736
76	NC_002163	AATTT	2	10	64132	64141	40 %	60 %	0 %	0 %	218561736
77	NC_002163	ATTTC	2	10	64234	64243	20 %	60 %	0 %	20 %	218561736
78	NC_002163	TGATT	2	10	64285	64294	20 %	60 %	20 %	0 %	218561736
79	NC_002163	TTTTA	2	10	64352	64361	20 %	80 %	0 %	0 %	218561736
80	NC_002163	GATAA	2	10	65286	65295	60 %	20 %	20 %	0 %	218561736
81	NC_002163	TCAAA	2	10	65839	65848	60 %	20 %	0 %	20 %	218561737
82	NC_002163	TGTGT	2	10	66334	66343	0 %	60 %	40 %	0 %	218561737
83	NC_002163	AAAAT	2	10	66514	66523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002163	ATTAC	2	10	66870	66879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_002163	AAAAT	2	10	67562	67571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002163	ATATT	2	10	69846	69855	40 %	60 %	0 %	0 %	218561739
87	NC_002163	TTTAT	2	10	70233	70242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002163	CAAGA	2	10	72291	72300	60 %	0 %	20 %	20 %	218561742
89	NC_002163	GAGCA	2	10	72663	72672	40 %	0 %	40 %	20 %	218561742
90	NC_002163	ATCAA	2	10	73142	73151	60 %	20 %	0 %	20 %	218561743
91	NC_002163	CTCTT	2	10	76137	76146	0 %	60 %	0 %	40 %	218561747
92	NC_002163	TTTTC	2	10	76178	76187	0 %	80 %	0 %	20 %	218561747
93	NC_002163	TCTCT	2	10	76442	76451	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_002163	ATCTC	2	10	76993	77002	20 %	40 %	0 %	40 %	218561748
95	NC_002163	GCCAA	2	10	77131	77140	40 %	0 %	20 %	40 %	218561748
96	NC_002163	TTTTG	2	10	78375	78384	0 %	80 %	20 %	0 %	218561749
97	NC_002163	AGTAA	2	10	78948	78957	60 %	20 %	20 %	0 %	218561750
98	NC_002163	TAAGG	2	10	82849	82858	40 %	20 %	40 %	0 %	218561754
99	NC_002163	ATTTT	2	10	82902	82911	20 %	80 %	0 %	0 %	218561754
100	NC_002163	TAGGA	2	10	83178	83187	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002163	AAAAT	2	10	83204	83213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002163	ATTTT	2	10	83214	83223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002163	TAAGA	2	10	83630	83639	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002163	TTAAT	2	10	83939	83948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002163	TATTT	2	10	84007	84016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002163	TATAA	2	10	84024	84033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002163	TTTGC	2	10	84703	84712	0 %	60 %	20 %	20 %	218561756
108	NC_002163	TGGAC	2	10	85052	85061	20 %	20 %	40 %	20 %	218561757
109	NC_002163	TAAAA	2	10	87801	87810	80 %	20 %	0 %	0 %	218561759
110	NC_002163	CAAAA	2	10	88334	88343	80 %	0 %	0 %	20 %	218561759
111	NC_002163	TAAAA	2	10	88773	88782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002163	TAAAA	2	10	91044	91053	80 %	20 %	0 %	0 %	218561762
113	NC_002163	GAAAT	2	10	91916	91925	60 %	20 %	20 %	0 %	218561764
114	NC_002163	TGGTT	2	10	92100	92109	0 %	60 %	40 %	0 %	218561764
115	NC_002163	TCCAT	2	10	92713	92722	20 %	40 %	0 %	40 %	218561764
116	NC_002163	TATTT	2	10	93260	93269	20 %	80 %	0 %	0 %	218561765
117	NC_002163	TTTTA	2	10	93272	93281	20 %	80 %	0 %	0 %	218561765
118	NC_002163	TATTT	2	10	93620	93629	20 %	80 %	0 %	0 %	218561765
119	NC_002163	TTGGC	2	10	94134	94143	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_002163	AAGAT	2	10	94221	94230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002163	GTAAA	2	10	94870	94879	60 %	20 %	20 %	0 %	218561766
122	NC_002163	AGAAT	2	10	95400	95409	60 %	20 %	20 %	0 %	218561767
123	NC_002163	AAGAA	2	10	96082	96091	80 %	0 %	20 %	0 %	218561768
124	NC_002163	CCTTG	2	10	96523	96532	0 %	40 %	20 %	40 %	218561768
125	NC_002163	AGGTA	2	10	97039	97048	40 %	20 %	40 %	0 %	218561768
126	NC_002163	GTGCA	2	10	98697	98706	20 %	20 %	40 %	20 %	218561769
127	NC_002163	ACCTT	2	10	99808	99817	20 %	40 %	0 %	40 %	218561770
128	NC_002163	TATTT	2	10	100323	100332	20 %	80 %	0 %	0 %	218561771
129	NC_002163	TCAAA	2	10	100381	100390	60 %	20 %	0 %	20 %	218561771
130	NC_002163	TTAGA	2	10	100652	100661	40 %	40 %	20 %	0 %	218561771
131	NC_002163	GCTTT	2	10	100743	100752	0 %	60 %	20 %	20 %	218561772
132	NC_002163	GTTTA	2	10	101260	101269	20 %	60 %	20 %	0 %	218561772
133	NC_002163	TAAAA	2	10	101325	101334	80 %	20 %	0 %	0 %	218561772
134	NC_002163	AAATG	2	10	101511	101520	60 %	20 %	20 %	0 %	218561773
135	NC_002163	AGGCA	2	10	102147	102156	40 %	0 %	40 %	20 %	218561773
136	NC_002163	TAAAA	2	10	102510	102519	80 %	20 %	0 %	0 %	218561773
137	NC_002163	AAATT	2	10	103505	103514	60 %	40 %	0 %	0 %	218561774
138	NC_002163	AAAGC	2	10	104200	104209	60 %	0 %	20 %	20 %	218561775
139	NC_002163	AAGAA	2	10	105574	105583	80 %	0 %	20 %	0 %	218561777
140	NC_002163	ACTCA	2	10	107710	107719	40 %	20 %	0 %	40 %	218561780
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400	NC_002163	CTTTT	2	10	394071	394080	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
401	NC_002163	GGTAA	2	10	394383	394392	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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