MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970 chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002162	TTATT	2	10	1895	1904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002162	ATTTT	2	10	26724	26733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002162	GAAAT	2	10	34500	34509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002162	TTTTA	2	10	34595	34604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002162	TTGTT	2	10	34610	34619	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002162	TAAGT	2	10	35425	35434	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002162	ACAAA	2	10	35468	35477	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_002162	ATATT	2	10	36522	36531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002162	TTTTA	2	10	39959	39968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002162	TGTTT	2	10	66325	66334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002162	AATTA	2	10	88476	88485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002162	TATAA	2	10	95549	95558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002162	TACTT	2	10	101626	101635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_002162	ATAGG	2	10	102187	102196	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002162	TGTTT	2	10	104759	104768	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002162	AAATT	2	10	105698	105707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002162	AACAT	2	10	110880	110889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_002162	ATTTT	2	10	111054	111063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002162	TAATA	2	10	112592	112601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002162	AAATT	2	10	112707	112716	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002162	AATTA	2	10	115358	115367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002162	TTTTC	2	10	118772	118781	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_002162	AATTT	2	10	119241	119250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002162	TTTTA	2	10	119376	119385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002162	ATTTT	2	10	135068	135077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002162	TATTT	2	10	136717	136726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002162	TCGTG	2	10	146399	146408	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002162	ATTAA	2	10	147098	147107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002162	GTGAA	2	10	147337	147346	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002162	GAAAA	2	10	147365	147374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002162	GAATG	2	10	149564	149573	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002162	CTCAT	2	10	149669	149678	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_002162	CGCTA	2	10	150219	150228	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_002162	AAATT	2	10	153909	153918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002162	TAAAA	2	10	161622	161631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002162	TTTTA	2	10	187858	187867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002162	AAACC	2	10	188212	188221	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_002162	GGTTT	2	10	188227	188236	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002162	TAAAA	2	10	194772	194781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002162	CTTCT	2	10	194793	194802	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_002162	TTTAA	2	10	201910	201919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002162	GTTTA	2	10	209007	209016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002162	TTTTA	2	10	215987	215996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002162	ATATT	2	10	217716	217725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002162	TTAAT	2	10	235505	235514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002162	ATTAT	3	15	253464	253478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002162	TTATT	2	10	254522	254531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002162	TAAAA	2	10	254847	254856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002162	TAATA	2	10	262263	262272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002162	AAAAT	2	10	267932	267941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002162	TAAAA	2	10	267991	268000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002162	CAAAT	2	10	270452	270461	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_002162	GAAAT	2	10	271701	271710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002162	AATTT	2	10	272090	272099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002162	ATTAT	2	10	297453	297462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002162	TTAAA	2	10	300581	300590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002162	ATATT	2	10	300653	300662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002162	TCTTA	2	10	305698	305707	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002162	ATTAT	2	10	310412	310421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002162	TAAAT	2	10	312485	312494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002162	GATTC	2	10	337903	337912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_002162	TTAAT	2	10	343663	343672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002162	TCGTG	2	10	344985	344994	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002162	ATTAA	2	10	345684	345693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002162	GTGAA	2	10	345923	345932	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002162	GAAAA	2	10	345951	345960	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002162	GAATG	2	10	348150	348159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002162	CTCAT	2	10	348255	348264	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_002162	CGCTA	2	10	348805	348814	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_002162	ATTTA	2	10	354198	354207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002162	GCATA	2	10	355630	355639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_002162	AAATT	2	10	355808	355817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002162	AGAAC	2	10	355870	355879	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_002162	ATTAT	2	10	359210	359219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002162	TCAGT	2	10	374735	374744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_002162	TTATT	2	10	374745	374754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002162	AAATT	2	10	378069	378078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002162	TAATT	2	10	379382	379391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002162	TAATA	2	10	391444	391453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002162	AATTA	2	10	400646	400655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002162	AAATT	2	10	418732	418741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002162	ATTTA	2	10	427279	427288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002162	ATTTT	2	10	427290	427299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002162	ATTAA	2	10	437643	437652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002162	TATCT	2	10	437720	437729	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_002162	TAAAA	2	10	488106	488115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002162	TAATG	2	10	492360	492369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002162	TAATA	2	10	493570	493579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002162	ATTTT	2	10	496205	496214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002162	TAATT	2	10	496434	496443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002162	TAAAA	2	10	497636	497645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002162	ATAAA	2	10	500240	500249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002162	ATTTT	2	10	500282	500291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002162	ACGAA	2	10	504418	504427	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002162	TAATT	2	10	511491	511500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002162	TATTT	2	10	520054	520063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002162	ATTAT	2	10	528694	528703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002162	ATTTC	2	10	528880	528889	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_002162	TTATT	2	10	537531	537540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002162	TGTTT	2	10	537591	537600	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002162	TTTAT	2	10	537608	537617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002162	TAAAT	2	10	550125	550134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002162	TAATT	2	10	553375	553384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002162	CTAAT	2	10	553522	553531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_002162	AATTT	2	10	555488	555497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002162	AATTT	2	10	555561	555570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002162	TAATT	2	10	558431	558440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002162	TTAAT	2	10	558478	558487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002162	GCAAA	2	10	581527	581536	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_002162	TTAAA	2	10	584437	584446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002162	AATTT	2	10	584540	584549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002162	TAATT	2	10	588393	588402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002162	TAATT	2	10	611553	611562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002162	AAAAT	2	10	621321	621330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002162	TTTTA	2	10	621338	621347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002162	TAATT	2	10	624925	624934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002162	AATTC	2	10	658678	658687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002162	TTTTA	2	10	660950	660959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002162	TATAT	2	10	664142	664151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002162	TAATA	2	10	664162	664171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002162	GTTAA	2	10	670730	670739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002162	TATAC	2	10	670830	670839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_002162	TCTTT	2	10	680975	680984	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002162	TTAAA	2	10	687186	687195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002162	AGTTT	2	10	688529	688538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002162	AAATA	2	10	688885	688894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002162	TTATA	2	10	705749	705758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002162	TAAAA	2	10	717980	717989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002162	AAATC	2	10	722255	722264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_002162	TATAA	2	10	724131	724140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002162	AAAAT	2	10	727515	727524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002162	AAAAG	2	10	731149	731158	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002162	TAATA	2	10	735934	735943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002162	ATATT	2	10	738144	738153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002162	TTCAA	2	10	751030	751039	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.