MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970 chromosome

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002162	AAGA	2	8	4976	4983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002162	ATTA	2	8	7869	7876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002162	AAAC	2	8	10665	10672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002162	TTTA	2	8	10685	10692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002162	ATTT	2	8	15780	15787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002162	ATTT	2	8	17388	17395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002162	CTTT	2	8	22013	22020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002162	TTTG	2	8	27956	27963	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002162	TAAA	2	8	28020	28027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002162	AATT	2	8	34570	34577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002162	TTTA	2	8	39576	39583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002162	TAAT	2	8	40010	40017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002162	AAAT	2	8	40124	40131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002162	TAAT	2	8	40141	40148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002162	TTAG	2	8	41768	41775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002162	ATTT	2	8	45170	45177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002162	TTTA	2	8	50202	50209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002162	AAAT	2	8	52735	52742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002162	ATTA	2	8	66283	66290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002162	TTTA	2	8	72430	72437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002162	TATT	2	8	77459	77466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002162	ATTG	2	8	79281	79288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002162	TAAT	2	8	79928	79935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002162	AAAT	2	8	84404	84411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002162	ATTT	2	8	84446	84453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002162	TATT	2	8	88426	88433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002162	TAAA	2	8	88451	88458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002162	TAAT	2	8	88496	88503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002162	ATAA	3	12	95488	95499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002162	TTTA	2	8	104743	104750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002162	ATCA	2	8	104843	104850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002162	AATT	2	8	107861	107868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002162	ATAA	2	8	110601	110608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002162	TAAA	2	8	110639	110646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002162	TTTA	2	8	110982	110989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002162	TAAT	2	8	111022	111029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002162	TAAT	2	8	111167	111174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002162	CATA	2	8	118563	118570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002162	TCTT	2	8	118932	118939	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002162	TTGT	2	8	119334	119341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002162	AAAT	2	8	119511	119518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002162	CATA	2	8	119853	119860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002162	AAAC	2	8	123303	123310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002162	TTAA	2	8	126893	126900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002162	ATAA	2	8	127652	127659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002162	TGCT	2	8	135036	135043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002162	TTTG	2	8	135050	135057	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002162	AGCT	2	8	136421	136428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002162	ATTG	2	8	136469	136476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002162	ATTA	2	8	136484	136491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002162	TAAT	2	8	142285	142292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002162	TTAA	2	8	145125	145132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002162	AAAT	2	8	145139	145146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002162	CGAA	2	8	145401	145408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002162	GTTA	2	8	146449	146456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002162	ATAA	2	8	147123	147130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002162	TTGG	2	8	147479	147486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002162	GAAC	2	8	148791	148798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002162	TAGG	2	8	149276	149283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002162	CTGG	2	8	149373	149380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_002162	AACT	2	8	149924	149931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_002162	AACC	2	8	150230	150237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002162	GGTT	2	8	150251	150258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002162	TAAA	2	8	150305	150312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002162	TAAA	2	8	152568	152575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002162	ATCT	2	8	153840	153847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002162	TTAA	2	8	153853	153860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002162	TAAA	2	8	153958	153965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002162	AAGA	2	8	161657	161664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002162	TTAA	2	8	161716	161723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002162	ATAA	2	8	169030	169037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002162	ATTT	2	8	169396	169403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002162	TAAT	2	8	169446	169453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002162	TATT	2	8	169467	169474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002162	TTAA	2	8	176910	176917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002162	TTTA	2	8	176929	176936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002162	ATTT	2	8	176941	176948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002162	TTAA	2	8	177321	177328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002162	GCTT	2	8	178694	178701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002162	TAAA	2	8	178708	178715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002162	ATAA	2	8	179597	179604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002162	AGAA	2	8	183953	183960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002162	TTTC	2	8	183982	183989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_002162	AATA	2	8	187962	187969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002162	TAAA	2	8	188246	188253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002162	TAAT	3	12	188266	188277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002162	GTAG	2	8	194618	194625	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002162	TAAT	2	8	194917	194924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002162	AAGC	2	8	195024	195031	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002162	ACGT	2	8	197245	197252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002162	TGAA	2	8	197357	197364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002162	CTTT	2	8	199963	199970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_002162	TAAA	2	8	201992	201999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002162	TCAA	2	8	209017	209024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002162	ATAA	2	8	209211	209218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002162	AATA	2	8	209248	209255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002162	TAAA	2	8	210200	210207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002162	AAAT	2	8	210214	210221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002162	TAGT	2	8	211894	211901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002162	ATTA	2	8	214025	214032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002162	CTTA	2	8	215998	216005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_002162	CTAA	2	8	218494	218501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002162	ATAA	2	8	234500	234507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002162	TAAA	2	8	234512	234519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002162	ATTA	2	8	235254	235261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002162	TAAA	2	8	235526	235533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002162	TATT	2	8	249024	249031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002162	TAAA	2	8	249047	249054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002162	TAAT	3	12	249092	249103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002162	ATTT	2	8	249308	249315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002162	TTAA	2	8	249338	249345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002162	TTAA	2	8	254542	254549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002162	TGAC	2	8	254576	254583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002162	TAAT	2	8	254606	254613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002162	ATTT	2	8	255865	255872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002162	TTAT	2	8	256008	256015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002162	TGCT	2	8	260559	260566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002162	ATTA	2	8	262252	262259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002162	ATTT	2	8	262311	262318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002162	TTAA	2	8	263939	263946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002162	AACT	2	8	263947	263954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002162	ATAA	2	8	267983	267990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002162	TTAT	2	8	270473	270480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002162	ATAA	2	8	274236	274243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002162	AAAG	2	8	274264	274271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002162	ATAA	2	8	275187	275194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002162	AGGA	2	8	282392	282399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002162	TCAT	2	8	284121	284128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002162	AAAG	2	8	288876	288883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002162	ATAA	2	8	288888	288895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002162	ATTT	2	8	291171	291178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002162	ACAA	2	8	291179	291186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002162	TTTA	2	8	297491	297498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002162	AGTT	2	8	297559	297566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002162	TAAA	2	8	300680	300687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002162	ATTA	2	8	310092	310099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002162	TAAT	2	8	310403	310410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002162	ATAA	2	8	310430	310437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002162	ATTT	2	8	310443	310450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002162	TGGT	2	8	312412	312419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002162	ATTT	2	8	316564	316571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002162	ATAA	2	8	317315	317322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002162	ATTA	2	8	317352	317359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002162	AAAG	2	8	317383	317390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002162	TTAA	2	8	325331	325338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002162	TAGT	2	8	327213	327220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002162	ATTT	2	8	327387	327394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002162	ACAA	2	8	333003	333010	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002162	ATTT	2	8	337729	337736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002162	TTTA	2	8	342690	342697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002162	TAAT	2	8	343876	343883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002162	CGAA	2	8	343987	343994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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341	NC_002162	TTTG	2	8	730999	731006	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.