MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002128	CAAAGA	2	12	756	767	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_002128	AAATAA	2	12	3397	3408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10955267
3	NC_002128	GCGAAG	2	12	4293	4304	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	10955268
4	NC_002128	TTTTCC	2	12	5480	5491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10955269
5	NC_002128	ATGGAC	2	12	6650	6661	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10955269
6	NC_002128	AGGGGG	2	12	6789	6800	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	10955269
7	NC_002128	ATAAGG	2	12	8296	8307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10955271
8	NC_002128	TAGAGG	2	12	9464	9475	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	10955273
9	NC_002128	ATTTTA	2	12	16579	16590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955282
10	NC_002128	TTTATG	2	12	19103	19114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10955283
11	NC_002128	TTCTGT	2	12	23017	23028	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10955285
12	NC_002128	TATCCA	2	12	26084	26095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223296
13	NC_002128	GTGTCA	2	12	26282	26293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	41223296
14	NC_002128	GCAGCG	2	12	27695	27706	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	10955292
15	NC_002128	CTCTTT	2	12	28245	28256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002128	GACAGC	2	12	28709	28720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10955293
17	NC_002128	ACCGGA	2	12	40987	40998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10955306
18	NC_002128	TCCTCT	2	12	43229	43240	0 %	50 %	0 %	50 %	10955310
19	NC_002128	TCAGCA	2	12	45158	45169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	10955312
20	NC_002128	GCAGAA	2	12	45564	45575	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10955312
21	NC_002128	TACCGC	2	12	45588	45599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	10955312
22	NC_002128	TGCTAC	7	42	46468	46509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10955314
23	NC_002128	TCAGCC	2	12	47519	47530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	10955315
24	NC_002128	GGCGCT	2	12	48531	48542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	10955316
25	NC_002128	CAGGTG	2	12	48562	48573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10955316
26	NC_002128	GCCGGA	2	12	48903	48914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	10955316
27	NC_002128	CACTGG	2	12	50297	50308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	10955317
28	NC_002128	TGGCAG	2	12	50973	50984	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10955318
29	NC_002128	GGAAAA	2	12	53994	54005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955321
30	NC_002128	CTTATC	2	12	55195	55206	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002128	TGGATT	2	12	62753	62764	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10955324
32	NC_002128	ATAAAA	2	12	63284	63295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10955324
33	NC_002128	CGTATT	2	12	65069	65080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10955324
34	NC_002128	CGGGAG	2	12	67610	67621	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_002128	AACACG	2	12	67761	67772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	10955328
36	NC_002128	TGGGGA	2	12	68028	68039	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	10955328
37	NC_002128	ATAGAT	2	12	75129	75140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10955337
38	NC_002128	GCAGAA	2	12	80520	80531	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10955343
39	NC_002128	AAAGCA	2	12	82914	82925	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	10955344
40	NC_002128	AAGGAC	2	12	84339	84350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10955344

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.