MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002128	AAATAA	2	12	3397	3408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10955267
2	NC_002128	GCGAAG	2	12	4293	4304	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	10955268
3	NC_002128	TTTTCC	2	12	5480	5491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10955269
4	NC_002128	ATGGAC	2	12	6650	6661	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10955269
5	NC_002128	AGGGGG	2	12	6789	6800	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	10955269
6	NC_002128	ATAAGG	2	12	8296	8307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10955271
7	NC_002128	TAGAGG	2	12	9464	9475	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	10955273
8	NC_002128	ATTTTA	2	12	16579	16590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10955282
9	NC_002128	TTTATG	2	12	19103	19114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10955283
10	NC_002128	TTCTGT	2	12	23017	23028	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10955285
11	NC_002128	TATCCA	2	12	26084	26095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223296
12	NC_002128	GTGTCA	2	12	26282	26293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	41223296
13	NC_002128	GCAGCG	2	12	27695	27706	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	10955292
14	NC_002128	GACAGC	2	12	28709	28720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10955293
15	NC_002128	ACCGGA	2	12	40987	40998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10955306
16	NC_002128	TCCTCT	2	12	43229	43240	0 %	50 %	0 %	50 %	10955310
17	NC_002128	TCAGCA	2	12	45158	45169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	10955312
18	NC_002128	GCAGAA	2	12	45564	45575	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10955312
19	NC_002128	TACCGC	2	12	45588	45599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	10955312
20	NC_002128	TGCTAC	7	42	46468	46509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10955314
21	NC_002128	TCAGCC	2	12	47519	47530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	10955315
22	NC_002128	GGCGCT	2	12	48531	48542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	10955316
23	NC_002128	CAGGTG	2	12	48562	48573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10955316
24	NC_002128	GCCGGA	2	12	48903	48914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	10955316
25	NC_002128	CACTGG	2	12	50297	50308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	10955317
26	NC_002128	TGGCAG	2	12	50973	50984	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10955318
27	NC_002128	GGAAAA	2	12	53994	54005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10955321
28	NC_002128	TGGATT	2	12	62753	62764	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10955324
29	NC_002128	ATAAAA	2	12	63284	63295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10955324
30	NC_002128	CGTATT	2	12	65069	65080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10955324
31	NC_002128	AACACG	2	12	67761	67772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	10955328
32	NC_002128	TGGGGA	2	12	68028	68039	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	10955328
33	NC_002128	ATAGAT	2	12	75129	75140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10955337
34	NC_002128	GCAGAA	2	12	80520	80531	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10955343
35	NC_002128	AAAGCA	2	12	82914	82925	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	10955344
36	NC_002128	AAGGAC	2	12	84339	84350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10955344

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.