MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002128	GATGG	2	10	1235	1244	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002128	GCTGA	2	10	1588	1597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_002128	GTTTT	2	10	2815	2824	0 %	80 %	20 %	0 %	10955267
4	NC_002128	GTCAG	2	10	6627	6636	20 %	20 %	40 %	20 %	10955269
5	NC_002128	CCCTT	2	10	7558	7567	0 %	40 %	0 %	60 %	10955270
6	NC_002128	GAGGT	2	10	9060	9069	20 %	20 %	60 %	0 %	10955272
7	NC_002128	GAGGT	2	10	11515	11524	20 %	20 %	60 %	0 %	10955276
8	NC_002128	AGTGG	2	10	12475	12484	20 %	20 %	60 %	0 %	10955277
9	NC_002128	CGCTT	2	10	12802	12811	0 %	40 %	20 %	40 %	10955277
10	NC_002128	TTTCG	2	10	13478	13487	0 %	60 %	20 %	20 %	10955278
11	NC_002128	GGTTA	2	10	13503	13512	20 %	40 %	40 %	0 %	10955278
12	NC_002128	TATAA	2	10	15898	15907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002128	TGTTA	2	10	20564	20573	20 %	60 %	20 %	0 %	10955284
14	NC_002128	CAGGT	2	10	20907	20916	20 %	20 %	40 %	20 %	10955284
15	NC_002128	AGAAC	2	10	21615	21624	60 %	0 %	20 %	20 %	10955284
16	NC_002128	TCTCT	2	10	21992	22001	0 %	60 %	0 %	40 %	10955285
17	NC_002128	CAGAA	2	10	22379	22388	60 %	0 %	20 %	20 %	10955285
18	NC_002128	AATGG	2	10	23336	23345	40 %	20 %	40 %	0 %	41223294
19	NC_002128	CACAC	2	10	24837	24846	40 %	0 %	0 %	60 %	10955287
20	NC_002128	ACATA	2	10	25100	25109	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_002128	CAGCT	2	10	25216	25225	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_002128	CAGCA	2	10	28324	28333	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_002128	GGCGT	2	10	38259	38268	0 %	20 %	60 %	20 %	10955302
24	NC_002128	CGCGG	2	10	39063	39072	0 %	0 %	60 %	40 %	10955303
25	NC_002128	ACGGG	2	10	39115	39124	20 %	0 %	60 %	20 %	10955303
26	NC_002128	GCTGG	2	10	39761	39770	0 %	20 %	60 %	20 %	10955304
27	NC_002128	CCGCC	2	10	41434	41443	0 %	0 %	20 %	80 %	10955306
28	NC_002128	GGCAC	2	10	41904	41913	20 %	0 %	40 %	40 %	10955307
29	NC_002128	ACCGT	2	10	42194	42203	20 %	20 %	20 %	40 %	10955308
30	NC_002128	TGTAC	2	10	42429	42438	20 %	40 %	20 %	20 %	10955309
31	NC_002128	GGAAG	2	10	43105	43114	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002128	GGCGG	2	10	43295	43304	0 %	0 %	80 %	20 %	10955310
33	NC_002128	CCGGG	2	10	44517	44526	0 %	0 %	60 %	40 %	10955312
34	NC_002128	GGCGG	2	10	46588	46597	0 %	0 %	80 %	20 %	10955314
35	NC_002128	AAGTG	2	10	48645	48654	40 %	20 %	40 %	0 %	10955316
36	NC_002128	CCGCC	2	10	49909	49918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_002128	ACTGA	2	10	49957	49966	40 %	20 %	20 %	20 %	10955317
38	NC_002128	TTACG	2	10	52873	52882	20 %	40 %	20 %	20 %	10955320
39	NC_002128	AAGGT	2	10	54568	54577	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002128	TCTAC	2	10	56365	56374	20 %	40 %	0 %	40 %	10955324
41	NC_002128	GACTT	2	10	57221	57230	20 %	40 %	20 %	20 %	10955324
42	NC_002128	ATCAG	2	10	57453	57462	40 %	20 %	20 %	20 %	10955324
43	NC_002128	AAACG	2	10	59197	59206	60 %	0 %	20 %	20 %	10955324
44	NC_002128	TGCAT	2	10	60123	60132	20 %	40 %	20 %	20 %	10955324
45	NC_002128	GAAAG	2	10	60279	60288	60 %	0 %	40 %	0 %	10955324
46	NC_002128	AAAAT	2	10	60971	60980	80 %	20 %	0 %	0 %	10955324
47	NC_002128	CATTC	2	10	61159	61168	20 %	40 %	0 %	40 %	10955324
48	NC_002128	AATTA	2	10	61719	61728	60 %	40 %	0 %	0 %	10955324
49	NC_002128	ATATT	2	10	63038	63047	40 %	60 %	0 %	0 %	10955324
50	NC_002128	GATGT	2	10	63131	63140	20 %	40 %	40 %	0 %	10955324
51	NC_002128	TTTAT	2	10	63363	63372	20 %	80 %	0 %	0 %	10955324
52	NC_002128	TAAAT	2	10	63804	63813	60 %	40 %	0 %	0 %	10955324
53	NC_002128	AGAAA	2	10	63816	63825	80 %	0 %	20 %	0 %	10955324
54	NC_002128	ATTGT	2	10	64690	64699	20 %	60 %	20 %	0 %	10955324
55	NC_002128	TGATT	2	10	65040	65049	20 %	60 %	20 %	0 %	10955324
56	NC_002128	CGCCC	2	10	66608	66617	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
57	NC_002128	ACCGG	2	10	66877	66886	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_002128	ACCTG	2	10	67486	67495	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_002128	CTGGT	2	10	67824	67833	0 %	40 %	40 %	20 %	10955328
60	NC_002128	GAACG	2	10	68275	68284	40 %	0 %	40 %	20 %	10955328
61	NC_002128	CCGGG	2	10	70984	70993	0 %	0 %	60 %	40 %	10955331
62	NC_002128	CCTGT	2	10	73753	73762	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_002128	GCCCC	2	10	73909	73918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_002128	GGGTT	2	10	74435	74444	0 %	40 %	60 %	0 %	10955335
65	NC_002128	GAAGA	2	10	77429	77438	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002128	GTCTT	2	10	81856	81865	0 %	60 %	20 %	20 %	10955344
67	NC_002128	AAAAC	2	10	82580	82589	80 %	0 %	0 %	20 %	10955344
68	NC_002128	ATGCG	2	10	83479	83488	20 %	20 %	40 %	20 %	10955344
69	NC_002128	TGGTA	2	10	88480	88489	20 %	40 %	40 %	0 %	10955346
70	NC_002128	GTTCC	2	10	90319	90328	0 %	40 %	20 %	40 %	10955347
71	NC_002128	GTTTT	2	10	92209	92218	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.