MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002128	AAG	2	6	26	31	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002128	CTG	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002128	TGA	2	6	96	101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002128	GAT	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002128	AAT	2	6	136	141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002128	TCC	2	6	168	173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_002128	TCA	2	6	175	180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002128	GGT	2	6	220	225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002128	AAT	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002128	TGG	2	6	341	346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002128	TCT	2	6	501	506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002128	AAT	2	6	553	558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002128	TGT	2	6	695	700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002128	TAA	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002128	TGG	2	6	894	899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002128	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002128	TGG	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002128	AAC	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002128	AAT	2	6	1306	1311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002128	CTG	2	6	1379	1384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002128	ATC	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002128	TCC	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_002128	GTC	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_002128	ATA	2	6	1679	1684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002128	GAC	2	6	1869	1874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002128	TGG	2	6	1877	1882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002128	GAT	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002128	AAG	2	6	2012	2017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002128	AAC	2	6	2053	2058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002128	TTG	2	6	2306	2311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002128	TGC	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002128	AAT	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002128	TAA	2	6	3625	3630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002128	CTT	2	6	8166	8171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002128	AAG	2	6	9185	9190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002128	GGA	2	6	11160	11165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002128	TGC	2	6	11360	11365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002128	TCT	2	6	11370	11375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002128	AGC	2	6	11402	11407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002128	TTC	2	6	11420	11425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002128	GGT	2	6	11454	11459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002128	AGG	2	6	12868	12873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002128	AGT	2	6	12881	12886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002128	TTG	2	6	12914	12919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002128	CGT	2	6	12970	12975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002128	TAA	2	6	13732	13737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002128	TGT	2	6	13762	13767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002128	GTG	2	6	14288	14293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002128	ATG	2	6	14303	14308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002128	TAT	2	6	15699	15704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002128	TAA	2	6	15826	15831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002128	TAT	3	9	15944	15952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002128	TGT	2	6	15959	15964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002128	CTT	2	6	16012	16017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002128	AGG	2	6	19618	19623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002128	AGG	2	6	19637	19642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002128	AAT	2	6	23266	23271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002128	TAT	2	6	23884	23889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002128	CAG	2	6	25089	25094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002128	GCA	2	6	25230	25235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_002128	ATA	2	6	25287	25292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002128	TGG	2	6	28277	28282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002128	TGT	2	6	28368	28373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002128	ATG	2	6	28423	28428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002128	GGT	2	6	28438	28443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002128	ATA	2	6	28592	28597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002128	ATT	2	6	30157	30162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002128	AGT	2	6	30194	30199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002128	ATG	2	6	30208	30213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002128	AAC	2	6	30318	30323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002128	ATG	2	6	30341	30346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002128	AGT	2	6	30369	30374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002128	CGC	2	6	30378	30383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_002128	ATT	2	6	30518	30523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002128	TCT	2	6	30541	30546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002128	AGA	2	6	30614	30619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002128	CCG	3	9	32105	32113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_002128	CAG	2	6	32144	32149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_002128	GCC	2	6	32188	32193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_002128	GAC	2	6	32195	32200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002128	GAC	2	6	32237	32242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002128	GGT	2	6	32278	32283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002128	TCA	2	6	32471	32476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002128	TGA	2	6	32478	32483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002128	TTA	2	6	32501	32506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002128	TCT	2	6	32566	32571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002128	TTC	2	6	32605	32610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002128	GCG	2	6	32655	32660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002128	ATA	2	6	32671	32676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002128	CTT	2	6	32696	32701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002128	AAC	2	6	32732	32737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002128	TGT	2	6	32767	32772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002128	TAA	2	6	32797	32802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002128	TCG	2	6	35086	35091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002128	TCG	2	6	35129	35134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_002128	ATT	2	6	35140	35145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002128	GTC	2	6	35325	35330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002128	CTG	2	6	35373	35378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002128	TGC	2	6	35384	35389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002128	CCT	2	6	35509	35514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_002128	TCG	2	6	35529	35534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002128	TCC	3	9	35536	35544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_002128	GAG	2	6	35632	35637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002128	AAT	2	6	35686	35691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002128	TCA	2	6	35735	35740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002128	GGA	2	6	35860	35865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002128	CTG	2	6	35901	35906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002128	CGT	2	6	35910	35915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_002128	CTC	2	6	35974	35979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_002128	ACC	2	6	36007	36012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_002128	TGT	2	6	36039	36044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002128	AAG	2	6	36128	36133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002128	CGC	2	6	40723	40728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_002128	GGC	2	6	42393	42398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_002128	GCC	2	6	42402	42407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_002128	CGT	2	6	42910	42915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002128	CAC	2	6	42936	42941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_002128	TTG	2	6	42950	42955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002128	CAG	2	6	42982	42987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002128	GCA	2	6	43022	43027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002128	GCC	2	6	43058	43063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_002128	CGT	2	6	43130	43135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002128	GCG	2	6	43700	43705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002128	CAG	3	9	43745	43753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_002128	AGG	2	6	43900	43905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002128	GCC	2	6	44273	44278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_002128	GGC	2	6	44287	44292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_002128	GGA	2	6	46304	46309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002128	GCG	2	6	46994	46999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002128	GAT	2	6	47090	47095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002128	ATT	2	6	47910	47915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002128	GCA	2	6	49931	49936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002128	ATG	2	6	51196	51201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002128	GGT	2	6	51239	51244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002128	ACA	2	6	51325	51330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002128	GAA	2	6	51365	51370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002128	GCT	2	6	51611	51616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_002128	GAG	2	6	53693	53698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002128	AGA	2	6	54214	54219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002128	AAT	2	6	54612	54617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002128	TGG	2	6	54710	54715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002128	ACA	2	6	54733	54738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_002128	GAT	2	6	87039	87044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_002128	CGG	2	6	88766	88771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_002128	AGG	2	6	90609	90614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_002128	CTG	2	6	90627	90632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_002128	CAA	2	6	92022	92027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_002128	TGT	2	6	92233	92238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_002128	ATA	3	9	92369	92377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_002128	GCT	2	6	92629	92634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_002128	ATA	2	6	92636	92641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.