MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002128	AC	3	6	1524	1529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002128	CA	3	6	2106	2111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002128	TA	3	6	2492	2497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002128	GC	3	6	2773	2778	0 %	0 %	50 %	50 %	10955267
5	NC_002128	GC	3	6	6373	6378	0 %	0 %	50 %	50 %	10955269
6	NC_002128	GC	3	6	6510	6515	0 %	0 %	50 %	50 %	10955269
7	NC_002128	CG	3	6	7120	7125	0 %	0 %	50 %	50 %	10955270
8	NC_002128	CG	3	6	7738	7743	0 %	0 %	50 %	50 %	10955270
9	NC_002128	CA	3	6	8033	8038	50 %	0 %	0 %	50 %	10955270
10	NC_002128	AG	3	6	9694	9699	50 %	0 %	50 %	0 %	10955274
11	NC_002128	GC	3	6	10023	10028	0 %	0 %	50 %	50 %	10955274
12	NC_002128	TG	3	6	12875	12880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002128	AG	3	6	13398	13403	50 %	0 %	50 %	0 %	10955278
14	NC_002128	TA	3	6	14130	14135	50 %	50 %	0 %	0 %	10955279
15	NC_002128	TC	3	6	15157	15162	0 %	50 %	0 %	50 %	10955281
16	NC_002128	AG	3	6	15647	15652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002128	AT	3	6	15941	15946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002128	GA	3	6	15974	15979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002128	TA	3	6	16046	16051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002128	CT	3	6	16225	16230	0 %	50 %	0 %	50 %	10955282
21	NC_002128	AT	3	6	16298	16303	50 %	50 %	0 %	0 %	10955282
22	NC_002128	TA	3	6	16399	16404	50 %	50 %	0 %	0 %	10955282
23	NC_002128	TC	3	6	17004	17009	0 %	50 %	0 %	50 %	10955283
24	NC_002128	AT	3	6	17436	17441	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
25	NC_002128	CT	3	6	17934	17939	0 %	50 %	0 %	50 %	10955283
26	NC_002128	AT	3	6	18075	18080	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
27	NC_002128	AT	3	6	18267	18272	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
28	NC_002128	TA	3	6	18556	18561	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
29	NC_002128	AT	3	6	18776	18781	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
30	NC_002128	TA	3	6	18859	18864	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
31	NC_002128	AG	3	6	19208	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	10955283
32	NC_002128	GA	3	6	19370	19375	50 %	0 %	50 %	0 %	10955283
33	NC_002128	TA	3	6	19420	19425	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
34	NC_002128	TA	3	6	19547	19552	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
35	NC_002128	CA	3	6	19575	19580	50 %	0 %	0 %	50 %	10955283
36	NC_002128	CA	4	8	19766	19773	50 %	0 %	0 %	50 %	10955284
37	NC_002128	TA	3	6	19907	19912	50 %	50 %	0 %	0 %	10955284
38	NC_002128	TC	3	6	20304	20309	0 %	50 %	0 %	50 %	10955284
39	NC_002128	GA	3	6	20403	20408	50 %	0 %	50 %	0 %	10955284
40	NC_002128	GA	3	6	20865	20870	50 %	0 %	50 %	0 %	10955284
41	NC_002128	TA	3	6	21212	21217	50 %	50 %	0 %	0 %	10955284
42	NC_002128	CA	3	6	21639	21644	50 %	0 %	0 %	50 %	10955284
43	NC_002128	CA	3	6	21712	21717	50 %	0 %	0 %	50 %	10955284
44	NC_002128	CA	3	6	21860	21865	50 %	0 %	0 %	50 %	10955285
45	NC_002128	GA	3	6	21880	21885	50 %	0 %	50 %	0 %	10955285
46	NC_002128	TA	3	6	23222	23227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002128	AT	3	6	23463	23468	50 %	50 %	0 %	0 %	41223294
48	NC_002128	AT	3	6	23595	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	10955286
49	NC_002128	AT	3	6	23728	23733	50 %	50 %	0 %	0 %	10955286
50	NC_002128	TA	3	6	23852	23857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002128	TA	3	6	25074	25079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002128	TA	3	6	25122	25127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002128	CT	3	6	25684	25689	0 %	50 %	0 %	50 %	41223296
54	NC_002128	CA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	0 %	50 %	41223296
55	NC_002128	GT	3	6	26404	26409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002128	TC	4	8	27361	27368	0 %	50 %	0 %	50 %	10955291
57	NC_002128	CG	3	6	27711	27716	0 %	0 %	50 %	50 %	10955292
58	NC_002128	CG	3	6	27860	27865	0 %	0 %	50 %	50 %	10955292
59	NC_002128	CG	3	6	27990	27995	0 %	0 %	50 %	50 %	10955292
60	NC_002128	GC	3	6	28610	28615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002128	AT	3	6	28635	28640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002128	AG	4	8	28929	28936	50 %	0 %	50 %	0 %	10955294
63	NC_002128	CT	3	6	29607	29612	0 %	50 %	0 %	50 %	10955295
64	NC_002128	TA	3	6	30441	30446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002128	AC	3	6	30455	30460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002128	TC	4	8	31464	31471	0 %	50 %	0 %	50 %	10955296
67	NC_002128	TC	3	6	32035	32040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002128	GT	3	6	32526	32531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002128	GC	3	6	33561	33566	0 %	0 %	50 %	50 %	10955299
70	NC_002128	GC	3	6	34105	34110	0 %	0 %	50 %	50 %	10955300
71	NC_002128	TC	3	6	35058	35063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002128	GT	3	6	35491	35496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002128	GA	3	6	36237	36242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002128	TA	3	6	36613	36618	50 %	50 %	0 %	0 %	10955301
75	NC_002128	AT	3	6	36857	36862	50 %	50 %	0 %	0 %	10955301
76	NC_002128	CA	3	6	37227	37232	50 %	0 %	0 %	50 %	10955301
77	NC_002128	CA	3	6	37927	37932	50 %	0 %	0 %	50 %	10955301
78	NC_002128	AC	3	6	38306	38311	50 %	0 %	0 %	50 %	10955302
79	NC_002128	TG	3	6	38494	38499	0 %	50 %	50 %	0 %	10955302
80	NC_002128	TG	3	6	38511	38516	0 %	50 %	50 %	0 %	10955302
81	NC_002128	CA	3	6	39842	39847	50 %	0 %	0 %	50 %	10955304
82	NC_002128	TG	3	6	39894	39899	0 %	50 %	50 %	0 %	10955304
83	NC_002128	TG	3	6	40105	40110	0 %	50 %	50 %	0 %	41223298
84	NC_002128	GC	3	6	40438	40443	0 %	0 %	50 %	50 %	10955305
85	NC_002128	CA	3	6	40698	40703	50 %	0 %	0 %	50 %	10955305
86	NC_002128	TC	3	6	42003	42008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002128	CA	3	6	43532	43537	50 %	0 %	0 %	50 %	10955310
88	NC_002128	GT	3	6	43670	43675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002128	CG	3	6	44376	44381	0 %	0 %	50 %	50 %	10955312
90	NC_002128	GA	3	6	44551	44556	50 %	0 %	50 %	0 %	10955312
91	NC_002128	GC	3	6	45759	45764	0 %	0 %	50 %	50 %	10955313
92	NC_002128	TG	3	6	45950	45955	0 %	50 %	50 %	0 %	10955313
93	NC_002128	CG	3	6	46342	46347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002128	GC	3	6	47353	47358	0 %	0 %	50 %	50 %	10955315
95	NC_002128	GA	3	6	47628	47633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002128	AG	3	6	47872	47877	50 %	0 %	50 %	0 %	41223299
97	NC_002128	CG	3	6	48555	48560	0 %	0 %	50 %	50 %	10955316
98	NC_002128	GT	4	8	49111	49118	0 %	50 %	50 %	0 %	10955316
99	NC_002128	TG	3	6	49832	49837	0 %	50 %	50 %	0 %	10955316
100	NC_002128	AC	3	6	50047	50052	50 %	0 %	0 %	50 %	10955317
101	NC_002128	TG	3	6	51257	51262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002128	CT	3	6	51392	51397	0 %	50 %	0 %	50 %	10955319
103	NC_002128	GT	4	8	51404	51411	0 %	50 %	50 %	0 %	10955319
104	NC_002128	GT	3	6	51417	51422	0 %	50 %	50 %	0 %	10955319
105	NC_002128	AT	3	6	51702	51707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002128	GT	3	6	52217	52222	0 %	50 %	50 %	0 %	10955320
107	NC_002128	AT	3	6	52688	52693	50 %	50 %	0 %	0 %	10955320
108	NC_002128	GC	4	8	52827	52834	0 %	0 %	50 %	50 %	10955320
109	NC_002128	TG	3	6	53323	53328	0 %	50 %	50 %	0 %	10955320
110	NC_002128	AT	3	6	53592	53597	50 %	50 %	0 %	0 %	10955320
111	NC_002128	AT	3	6	53788	53793	50 %	50 %	0 %	0 %	10955321
112	NC_002128	AT	3	6	54676	54681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002128	AG	3	6	55311	55316	50 %	0 %	50 %	0 %	10955323
114	NC_002128	GA	3	6	55697	55702	50 %	0 %	50 %	0 %	10955323
115	NC_002128	TA	3	6	55902	55907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002128	AG	3	6	56070	56075	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
117	NC_002128	AT	3	6	56835	56840	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
118	NC_002128	GA	3	6	57360	57365	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
119	NC_002128	AT	3	6	57473	57478	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
120	NC_002128	AT	3	6	58088	58093	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
121	NC_002128	TA	3	6	58834	58839	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
122	NC_002128	AT	3	6	58968	58973	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
123	NC_002128	AG	3	6	58977	58982	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
124	NC_002128	TA	3	6	59001	59006	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
125	NC_002128	AT	3	6	59175	59180	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
126	NC_002128	AT	3	6	59258	59263	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
127	NC_002128	AT	3	6	59492	59497	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
128	NC_002128	TA	4	8	59799	59806	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
129	NC_002128	GA	3	6	59848	59853	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
130	NC_002128	AT	3	6	60832	60837	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
131	NC_002128	TA	3	6	61018	61023	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
132	NC_002128	TA	3	6	61598	61603	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
133	NC_002128	GT	3	6	61660	61665	0 %	50 %	50 %	0 %	10955324
134	NC_002128	CA	3	6	61797	61802	50 %	0 %	0 %	50 %	10955324
135	NC_002128	AT	4	8	61809	61816	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
136	NC_002128	GA	3	6	62100	62105	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
137	NC_002128	AG	3	6	62182	62187	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
138	NC_002128	TA	3	6	62943	62948	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
139	NC_002128	AT	5	10	63007	63016	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
140	NC_002128	AG	3	6	63100	63105	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
141	NC_002128	AT	3	6	63733	63738	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
142	NC_002128	AT	4	8	64448	64455	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
143	NC_002128	AT	3	6	64495	64500	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
144	NC_002128	AT	3	6	65103	65108	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
145	NC_002128	TA	3	6	65163	65168	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
146	NC_002128	AT	4	8	65303	65310	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
147	NC_002128	TC	3	6	65428	65433	0 %	50 %	0 %	50 %	10955324
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.