MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002128	GC	3	6	2773	2778	0 %	0 %	50 %	50 %	10955267
2	NC_002128	GC	3	6	6373	6378	0 %	0 %	50 %	50 %	10955269
3	NC_002128	GC	3	6	6510	6515	0 %	0 %	50 %	50 %	10955269
4	NC_002128	CG	3	6	7120	7125	0 %	0 %	50 %	50 %	10955270
5	NC_002128	CG	3	6	7738	7743	0 %	0 %	50 %	50 %	10955270
6	NC_002128	CA	3	6	8033	8038	50 %	0 %	0 %	50 %	10955270
7	NC_002128	AG	3	6	9694	9699	50 %	0 %	50 %	0 %	10955274
8	NC_002128	GC	3	6	10023	10028	0 %	0 %	50 %	50 %	10955274
9	NC_002128	AG	3	6	13398	13403	50 %	0 %	50 %	0 %	10955278
10	NC_002128	TA	3	6	14130	14135	50 %	50 %	0 %	0 %	10955279
11	NC_002128	TC	3	6	15157	15162	0 %	50 %	0 %	50 %	10955281
12	NC_002128	CT	3	6	16225	16230	0 %	50 %	0 %	50 %	10955282
13	NC_002128	AT	3	6	16298	16303	50 %	50 %	0 %	0 %	10955282
14	NC_002128	TA	3	6	16399	16404	50 %	50 %	0 %	0 %	10955282
15	NC_002128	TC	3	6	17004	17009	0 %	50 %	0 %	50 %	10955283
16	NC_002128	AT	3	6	17436	17441	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
17	NC_002128	CT	3	6	17934	17939	0 %	50 %	0 %	50 %	10955283
18	NC_002128	AT	3	6	18075	18080	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
19	NC_002128	AT	3	6	18267	18272	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
20	NC_002128	TA	3	6	18556	18561	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
21	NC_002128	AT	3	6	18776	18781	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
22	NC_002128	TA	3	6	18859	18864	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
23	NC_002128	AG	3	6	19208	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	10955283
24	NC_002128	GA	3	6	19370	19375	50 %	0 %	50 %	0 %	10955283
25	NC_002128	TA	3	6	19420	19425	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
26	NC_002128	TA	3	6	19547	19552	50 %	50 %	0 %	0 %	10955283
27	NC_002128	CA	3	6	19575	19580	50 %	0 %	0 %	50 %	10955283
28	NC_002128	CA	4	8	19766	19773	50 %	0 %	0 %	50 %	10955284
29	NC_002128	TA	3	6	19907	19912	50 %	50 %	0 %	0 %	10955284
30	NC_002128	TC	3	6	20304	20309	0 %	50 %	0 %	50 %	10955284
31	NC_002128	GA	3	6	20403	20408	50 %	0 %	50 %	0 %	10955284
32	NC_002128	GA	3	6	20865	20870	50 %	0 %	50 %	0 %	10955284
33	NC_002128	TA	3	6	21212	21217	50 %	50 %	0 %	0 %	10955284
34	NC_002128	CA	3	6	21639	21644	50 %	0 %	0 %	50 %	10955284
35	NC_002128	CA	3	6	21712	21717	50 %	0 %	0 %	50 %	10955284
36	NC_002128	CA	3	6	21860	21865	50 %	0 %	0 %	50 %	10955285
37	NC_002128	GA	3	6	21880	21885	50 %	0 %	50 %	0 %	10955285
38	NC_002128	AT	3	6	23463	23468	50 %	50 %	0 %	0 %	41223294
39	NC_002128	AT	3	6	23595	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	10955286
40	NC_002128	AT	3	6	23728	23733	50 %	50 %	0 %	0 %	10955286
41	NC_002128	CT	3	6	25684	25689	0 %	50 %	0 %	50 %	41223296
42	NC_002128	CA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	0 %	50 %	41223296
43	NC_002128	TC	4	8	27361	27368	0 %	50 %	0 %	50 %	10955291
44	NC_002128	CG	3	6	27711	27716	0 %	0 %	50 %	50 %	10955292
45	NC_002128	CG	3	6	27860	27865	0 %	0 %	50 %	50 %	10955292
46	NC_002128	CG	3	6	27990	27995	0 %	0 %	50 %	50 %	10955292
47	NC_002128	AG	4	8	28929	28936	50 %	0 %	50 %	0 %	10955294
48	NC_002128	CT	3	6	29607	29612	0 %	50 %	0 %	50 %	10955295
49	NC_002128	TC	4	8	31464	31471	0 %	50 %	0 %	50 %	10955296
50	NC_002128	GC	3	6	33561	33566	0 %	0 %	50 %	50 %	10955299
51	NC_002128	GC	3	6	34105	34110	0 %	0 %	50 %	50 %	10955300
52	NC_002128	TA	3	6	36613	36618	50 %	50 %	0 %	0 %	10955301
53	NC_002128	AT	3	6	36857	36862	50 %	50 %	0 %	0 %	10955301
54	NC_002128	CA	3	6	37227	37232	50 %	0 %	0 %	50 %	10955301
55	NC_002128	CA	3	6	37927	37932	50 %	0 %	0 %	50 %	10955301
56	NC_002128	AC	3	6	38306	38311	50 %	0 %	0 %	50 %	10955302
57	NC_002128	TG	3	6	38494	38499	0 %	50 %	50 %	0 %	10955302
58	NC_002128	TG	3	6	38511	38516	0 %	50 %	50 %	0 %	10955302
59	NC_002128	CA	3	6	39842	39847	50 %	0 %	0 %	50 %	10955304
60	NC_002128	TG	3	6	39894	39899	0 %	50 %	50 %	0 %	10955304
61	NC_002128	TG	3	6	40105	40110	0 %	50 %	50 %	0 %	41223298
62	NC_002128	GC	3	6	40438	40443	0 %	0 %	50 %	50 %	10955305
63	NC_002128	CA	3	6	40698	40703	50 %	0 %	0 %	50 %	10955305
64	NC_002128	CA	3	6	43532	43537	50 %	0 %	0 %	50 %	10955310
65	NC_002128	CG	3	6	44376	44381	0 %	0 %	50 %	50 %	10955312
66	NC_002128	GA	3	6	44551	44556	50 %	0 %	50 %	0 %	10955312
67	NC_002128	GC	3	6	45759	45764	0 %	0 %	50 %	50 %	10955313
68	NC_002128	TG	3	6	45950	45955	0 %	50 %	50 %	0 %	10955313
69	NC_002128	GC	3	6	47353	47358	0 %	0 %	50 %	50 %	10955315
70	NC_002128	AG	3	6	47872	47877	50 %	0 %	50 %	0 %	41223299
71	NC_002128	CG	3	6	48555	48560	0 %	0 %	50 %	50 %	10955316
72	NC_002128	GT	4	8	49111	49118	0 %	50 %	50 %	0 %	10955316
73	NC_002128	TG	3	6	49832	49837	0 %	50 %	50 %	0 %	10955316
74	NC_002128	AC	3	6	50047	50052	50 %	0 %	0 %	50 %	10955317
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76	NC_002128	GT	4	8	51404	51411	0 %	50 %	50 %	0 %	10955319
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80	NC_002128	GC	4	8	52827	52834	0 %	0 %	50 %	50 %	10955320
81	NC_002128	TG	3	6	53323	53328	0 %	50 %	50 %	0 %	10955320
82	NC_002128	AT	3	6	53592	53597	50 %	50 %	0 %	0 %	10955320
83	NC_002128	AT	3	6	53788	53793	50 %	50 %	0 %	0 %	10955321
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85	NC_002128	GA	3	6	55697	55702	50 %	0 %	50 %	0 %	10955323
86	NC_002128	AG	3	6	56070	56075	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
87	NC_002128	AT	3	6	56835	56840	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
88	NC_002128	GA	3	6	57360	57365	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
89	NC_002128	AT	3	6	57473	57478	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
90	NC_002128	AT	3	6	58088	58093	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
91	NC_002128	TA	3	6	58834	58839	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
92	NC_002128	AT	3	6	58968	58973	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
93	NC_002128	AG	3	6	58977	58982	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
94	NC_002128	TA	3	6	59001	59006	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
95	NC_002128	AT	3	6	59175	59180	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
96	NC_002128	AT	3	6	59258	59263	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
97	NC_002128	AT	3	6	59492	59497	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
98	NC_002128	TA	4	8	59799	59806	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
99	NC_002128	GA	3	6	59848	59853	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
100	NC_002128	AT	3	6	60832	60837	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
101	NC_002128	TA	3	6	61018	61023	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
102	NC_002128	TA	3	6	61598	61603	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
103	NC_002128	GT	3	6	61660	61665	0 %	50 %	50 %	0 %	10955324
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105	NC_002128	AT	4	8	61809	61816	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
106	NC_002128	GA	3	6	62100	62105	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
107	NC_002128	AG	3	6	62182	62187	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
108	NC_002128	TA	3	6	62943	62948	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
109	NC_002128	AT	5	10	63007	63016	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
110	NC_002128	AG	3	6	63100	63105	50 %	0 %	50 %	0 %	10955324
111	NC_002128	AT	3	6	63733	63738	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
112	NC_002128	AT	4	8	64448	64455	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
113	NC_002128	AT	3	6	64495	64500	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
114	NC_002128	AT	3	6	65103	65108	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
115	NC_002128	TA	3	6	65163	65168	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
116	NC_002128	AT	4	8	65303	65310	50 %	50 %	0 %	0 %	10955324
117	NC_002128	TC	3	6	65428	65433	0 %	50 %	0 %	50 %	10955324
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121	NC_002128	CA	3	6	66136	66141	50 %	0 %	0 %	50 %	10955326
122	NC_002128	CT	3	6	68575	68580	0 %	50 %	0 %	50 %	10955329
123	NC_002128	GA	3	6	68975	68980	50 %	0 %	50 %	0 %	10955329
124	NC_002128	GA	3	6	68992	68997	50 %	0 %	50 %	0 %	10955329
125	NC_002128	AG	3	6	69195	69200	50 %	0 %	50 %	0 %	10955329
126	NC_002128	GA	3	6	69566	69571	50 %	0 %	50 %	0 %	10955330
127	NC_002128	TG	3	6	69917	69922	0 %	50 %	50 %	0 %	10955330
128	NC_002128	AT	3	6	70675	70680	50 %	50 %	0 %	0 %	10955331
129	NC_002128	TG	3	6	70716	70721	0 %	50 %	50 %	0 %	10955331
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132	NC_002128	CA	3	6	74864	74869	50 %	0 %	0 %	50 %	10955336
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134	NC_002128	AG	4	8	79840	79847	50 %	0 %	50 %	0 %	10955343
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140	NC_002128	AT	3	6	83088	83093	50 %	50 %	0 %	0 %	10955344
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143	NC_002128	TG	3	6	88038	88043	0 %	50 %	50 %	0 %	10955346
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151	NC_002128	GA	3	6	90835	90840	50 %	0 %	50 %	0 %	10955348

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.