MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001988	AATATA	2	12	50	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004706
2	NC_001988	GATAAA	2	12	5958	5969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15004708
3	NC_001988	TAAAAA	2	12	6317	6328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15004708
4	NC_001988	AAATTG	2	12	6981	6992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15004709
5	NC_001988	ATATTA	2	12	8413	8424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001988	AGGGTT	2	12	8445	8456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001988	TAACCC	2	12	8469	8480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_001988	TATTAA	2	12	9607	9618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001988	GAAAAA	2	12	13018	13029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15004716
10	NC_001988	TTATAT	2	12	17593	17604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001988	TAAAAC	2	12	18885	18896	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15004722
12	NC_001988	AATTTT	2	12	21814	21825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004724
13	NC_001988	CAAATA	2	12	23320	23331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15004726
14	NC_001988	TTCTTT	2	12	24752	24763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15004728
15	NC_001988	AAAAGA	2	12	26078	26089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15004729
16	NC_001988	TAGTGC	2	12	27891	27902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15004731
17	NC_001988	TTATAG	2	12	27956	27967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15004731
18	NC_001988	TAGAAA	2	12	31340	31351	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15004734
19	NC_001988	GATTTA	2	12	31657	31668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15004734
20	NC_001988	ATATCT	2	12	35619	35630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15004739
21	NC_001988	TTCATT	2	12	42517	42528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15004747
22	NC_001988	AAAATT	2	12	43547	43558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004747
23	NC_001988	AAGTGA	2	12	47364	47375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15004751
24	NC_001988	ATATGT	2	12	47782	47793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001988	CTTAAA	2	12	47860	47871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_001988	TGAATT	2	12	50015	50026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15004753
27	NC_001988	CAAAGG	2	12	51348	51359	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15004754
28	NC_001988	TAAAAA	2	12	55598	55609	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001988	TAGCAA	2	12	55769	55780	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15004759
30	NC_001988	GTTAAC	2	12	56776	56787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_001988	TAATTT	2	12	57795	57806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004760
32	NC_001988	TATGAT	2	12	67651	67662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15004769
33	NC_001988	GCTAAT	2	12	67822	67833	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15004769
34	NC_001988	AGTTAA	2	12	69915	69926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15004770
35	NC_001988	TTCCAT	2	12	70630	70641	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15004771
36	NC_001988	GCTATT	2	12	70843	70854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15004771
37	NC_001988	TTTAGC	2	12	71250	71261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15004771
38	NC_001988	AATTAA	2	12	71388	71399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15004772
39	NC_001988	GCTTTA	2	12	73278	73289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15004774
40	NC_001988	GTAAAA	2	12	79007	79018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15004778
41	NC_001988	ATGTAT	2	12	79148	79159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001988	TTTCCA	2	12	81106	81117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15004781
43	NC_001988	TTACTA	2	12	83197	83208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15004782
44	NC_001988	TAAAAA	2	12	87332	87343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15004787
45	NC_001988	ATTATA	2	12	87631	87642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001988	CATTTT	2	12	89059	89070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15004790
47	NC_001988	TAAAAA	2	12	93058	93069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001988	ACTTAA	2	12	93744	93755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15004793
49	NC_001988	ATTTTA	2	12	98572	98583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001988	ACTTTA	2	12	99463	99474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15004799
51	NC_001988	CTACTT	2	12	100705	100716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_001988	ATAATT	2	12	103259	103270	50 %	50 %	0 %	0 %	15004802
53	NC_001988	TATTTA	2	12	105196	105207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001988	ATCAGC	2	12	107470	107481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15004805
55	NC_001988	GTTGCA	2	12	111178	111189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15004807
56	NC_001988	TATGAA	2	12	112821	112832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15004809
57	NC_001988	ATCATT	2	12	113023	113034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15004809
58	NC_001988	CAGAAG	2	12	117313	117324	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15004814
59	NC_001988	CCACTG	2	12	120075	120086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15004817
60	NC_001988	CTTTTA	2	12	121481	121492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15004818
61	NC_001988	CCTTCT	2	12	125002	125013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_001988	CCTGAA	2	12	125419	125430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15004821
63	NC_001988	CCTGAA	2	12	127202	127213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15004822
64	NC_001988	AACATA	2	12	131334	131345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15004824
65	NC_001988	ATTTAT	2	12	134138	134149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004826
66	NC_001988	ACCTCC	2	12	134534	134545	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15004827
67	NC_001988	TTTAAT	2	12	136803	136814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004829
68	NC_001988	GTACTA	2	12	138441	138452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15004831
69	NC_001988	TACATT	2	12	140832	140843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_001988	TTGGCT	2	12	142699	142710	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15004834
71	NC_001988	TAATTG	2	12	144884	144895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15004837
72	NC_001988	GCATTA	2	12	145526	145537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15004838
73	NC_001988	GTCTAA	2	12	150469	150480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_001988	CAATTT	2	12	152825	152836	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15004844
75	NC_001988	ACAAAA	2	12	153669	153680	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15004845
76	NC_001988	CTTACT	2	12	157869	157880	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15004851
77	NC_001988	GTTAAC	2	12	158755	158766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_001988	TTTGGT	2	12	161739	161750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15004853
79	NC_001988	CTTTTG	2	12	163372	163383	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15004854
80	NC_001988	AAAGGA	2	12	166084	166095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15004857
81	NC_001988	AAATGC	2	12	167933	167944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15004859
82	NC_001988	CTTTAA	2	12	171036	171047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15004863
83	NC_001988	TATTGT	2	12	172756	172767	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15004863
84	NC_001988	ATGGCA	2	12	178990	179001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15004866
85	NC_001988	ATACCT	2	12	183300	183311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15004871
86	NC_001988	AAATTA	2	12	183884	183895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001988	AAACTA	2	12	184822	184833	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15004873
88	NC_001988	AGTATT	2	12	184882	184893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001988	TAACCC	2	12	184894	184905	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_001988	TAAAAA	2	12	185900	185911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15004876
91	NC_001988	ATTAGT	2	12	187314	187325	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15004877
92	NC_001988	TTAATT	2	12	187402	187413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15004877
93	NC_001988	AACCCC	2	12	187977	187988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_001988	AACTAT	2	12	189820	189831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_001988	ATATTA	2	12	190575	190586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001988	AAGATT	2	12	190824	190835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15004880
97	NC_001988	AAAATC	2	12	190998	191009	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15004880
98	NC_001988	ATATTA	2	12	191560	191571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001988	TAACTC	2	12	191989	192000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.