MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001988	GGATA	2	10	86	95	40 %	20 %	40 %	0 %	15004706
2	NC_001988	GCTTA	2	10	366	375	20 %	40 %	20 %	20 %	15004706
3	NC_001988	AATTA	2	10	705	714	60 %	40 %	0 %	0 %	15004706
4	NC_001988	AGTAT	2	10	1986	1995	40 %	40 %	20 %	0 %	15004707
5	NC_001988	TAGTT	2	10	2576	2585	20 %	60 %	20 %	0 %	15004707
6	NC_001988	TTAGA	2	10	3076	3085	40 %	40 %	20 %	0 %	15004707
7	NC_001988	AAAGT	2	10	3463	3472	60 %	20 %	20 %	0 %	15004707
8	NC_001988	AATGT	2	10	8401	8410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001988	TTCAT	2	10	9822	9831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_001988	ATATT	2	10	10166	10175	40 %	60 %	0 %	0 %	15004714
11	NC_001988	AAAGG	2	10	10495	10504	60 %	0 %	40 %	0 %	15004714
12	NC_001988	ACTTC	2	10	11263	11272	20 %	40 %	0 %	40 %	15004715
13	NC_001988	ATTTT	2	10	15238	15247	20 %	80 %	0 %	0 %	15004718
14	NC_001988	TACAG	2	10	17284	17293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_001988	TAAAA	2	10	17616	17625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001988	AAAAT	2	10	18490	18499	80 %	20 %	0 %	0 %	15004721
17	NC_001988	TACGT	2	10	20673	20682	20 %	40 %	20 %	20 %	15004724
18	NC_001988	ATCTA	2	10	21141	21150	40 %	40 %	0 %	20 %	15004724
19	NC_001988	TAAAC	2	10	21196	21205	60 %	20 %	0 %	20 %	15004724
20	NC_001988	TGGTT	2	10	21590	21599	0 %	60 %	40 %	0 %	15004724
21	NC_001988	TTTTC	2	10	21605	21614	0 %	80 %	0 %	20 %	15004724
22	NC_001988	CTTTT	2	10	22296	22305	0 %	80 %	0 %	20 %	15004726
23	NC_001988	TAAAG	2	10	23333	23342	60 %	20 %	20 %	0 %	15004726
24	NC_001988	CTTTT	2	10	23704	23713	0 %	80 %	0 %	20 %	15004727
25	NC_001988	ATATT	2	10	24097	24106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001988	TGAAT	2	10	25106	25115	40 %	40 %	20 %	0 %	15004729
27	NC_001988	TATCT	2	10	27755	27764	20 %	60 %	0 %	20 %	15004731
28	NC_001988	ATAAA	2	10	29436	29445	80 %	20 %	0 %	0 %	15004732
29	NC_001988	ACAGC	2	10	30455	30464	40 %	0 %	20 %	40 %	15004733
30	NC_001988	TAAAG	2	10	32279	32288	60 %	20 %	20 %	0 %	15004735
31	NC_001988	TTAAT	2	10	32473	32482	40 %	60 %	0 %	0 %	15004736
32	NC_001988	AAATA	2	10	32739	32748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001988	TTATT	2	10	34807	34816	20 %	80 %	0 %	0 %	15004739
34	NC_001988	TTTTA	2	10	35456	35465	20 %	80 %	0 %	0 %	15004739
35	NC_001988	ATTTT	2	10	36501	36510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001988	TTTAT	2	10	37513	37522	20 %	80 %	0 %	0 %	15004741
37	NC_001988	AAATT	2	10	38127	38136	60 %	40 %	0 %	0 %	15004741
38	NC_001988	ATAAC	2	10	38187	38196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_001988	TTTAT	2	10	38414	38423	20 %	80 %	0 %	0 %	15004742
40	NC_001988	AAATT	2	10	41060	41069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001988	ATTAT	2	10	44285	44294	40 %	60 %	0 %	0 %	15004748
42	NC_001988	TAGAA	2	10	46241	46250	60 %	20 %	20 %	0 %	15004750
43	NC_001988	AAAGA	2	10	48093	48102	80 %	0 %	20 %	0 %	15004752
44	NC_001988	TATAA	2	10	49037	49046	60 %	40 %	0 %	0 %	15004752
45	NC_001988	TTTTC	2	10	52380	52389	0 %	80 %	0 %	20 %	15004755
46	NC_001988	TAGGT	2	10	52758	52767	20 %	40 %	40 %	0 %	15004755
47	NC_001988	TTCTT	2	10	52920	52929	0 %	80 %	0 %	20 %	15004755
48	NC_001988	TATTC	2	10	53039	53048	20 %	60 %	0 %	20 %	15004756
49	NC_001988	TTATT	2	10	53469	53478	20 %	80 %	0 %	0 %	15004756
50	NC_001988	TGAGT	2	10	53804	53813	20 %	40 %	40 %	0 %	15004757
51	NC_001988	CAATC	2	10	54084	54093	40 %	20 %	0 %	40 %	15004757
52	NC_001988	TAAAA	2	10	57956	57965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001988	AGTAT	2	10	58456	58465	40 %	40 %	20 %	0 %	15004761
54	NC_001988	CATTT	2	10	61111	61120	20 %	60 %	0 %	20 %	15004763
55	NC_001988	GATAT	2	10	61733	61742	40 %	40 %	20 %	0 %	15004764
56	NC_001988	TCATA	2	10	63069	63078	40 %	40 %	0 %	20 %	15004766
57	NC_001988	TAAGT	2	10	63636	63645	40 %	40 %	20 %	0 %	15004767
58	NC_001988	GCCAG	2	10	64198	64207	20 %	0 %	40 %	40 %	15004767
59	NC_001988	TGTGC	2	10	65110	65119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_001988	TAAAA	2	10	65225	65234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001988	TTGAA	2	10	65992	66001	40 %	40 %	20 %	0 %	15004768
62	NC_001988	TCTCA	2	10	66026	66035	20 %	40 %	0 %	40 %	15004768
63	NC_001988	ATTTT	2	10	66218	66227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001988	ATTTA	2	10	66258	66267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001988	AGAAA	2	10	66978	66987	80 %	0 %	20 %	0 %	15004769
66	NC_001988	ATATT	2	10	68485	68494	40 %	60 %	0 %	0 %	15004769
67	NC_001988	GGTAA	2	10	69085	69094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001988	GTTAA	2	10	72011	72020	40 %	40 %	20 %	0 %	15004772
69	NC_001988	TTTAA	2	10	72333	72342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001988	GACAA	2	10	73956	73965	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_001988	AATAA	2	10	76323	76332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001988	TTGTT	2	10	77296	77305	0 %	80 %	20 %	0 %	15004777
73	NC_001988	TTATT	2	10	77662	77671	20 %	80 %	0 %	0 %	15004777
74	NC_001988	TTATG	2	10	78427	78436	20 %	60 %	20 %	0 %	15004777
75	NC_001988	AATGG	2	10	79019	79028	40 %	20 %	40 %	0 %	15004778
76	NC_001988	TTATT	2	10	81015	81024	20 %	80 %	0 %	0 %	15004781
77	NC_001988	ATTAA	2	10	81920	81929	60 %	40 %	0 %	0 %	15004781
78	NC_001988	CTCTT	2	10	82697	82706	0 %	60 %	0 %	40 %	15004782
79	NC_001988	TTTAA	2	10	83931	83940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001988	GATAT	2	10	84799	84808	40 %	40 %	20 %	0 %	15004784
81	NC_001988	AAAAG	2	10	85289	85298	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001988	GTCTT	2	10	86409	86418	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_001988	ATCAA	2	10	86903	86912	60 %	20 %	0 %	20 %	15004787
84	NC_001988	AAAAT	2	10	88131	88140	80 %	20 %	0 %	0 %	15004789
85	NC_001988	TGAAC	2	10	89539	89548	40 %	20 %	20 %	20 %	15004790
86	NC_001988	GATGT	2	10	89964	89973	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001988	GAAAT	2	10	91087	91096	60 %	20 %	20 %	0 %	15004791
88	NC_001988	TATTC	2	10	91990	91999	20 %	60 %	0 %	20 %	15004792
89	NC_001988	CTTCT	2	10	92487	92496	0 %	60 %	0 %	40 %	15004792
90	NC_001988	CAAGC	2	10	93441	93450	40 %	0 %	20 %	40 %	15004793
91	NC_001988	CAATA	2	10	95758	95767	60 %	20 %	0 %	20 %	15004797
92	NC_001988	GTTCT	2	10	95887	95896	0 %	60 %	20 %	20 %	15004797
93	NC_001988	AGAAT	2	10	97290	97299	60 %	20 %	20 %	0 %	15004798
94	NC_001988	TAAAT	2	10	100559	100568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001988	ATATT	2	10	100735	100744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001988	GCTTG	2	10	101539	101548	0 %	40 %	40 %	20 %	15004801
97	NC_001988	TTTTG	2	10	101597	101606	0 %	80 %	20 %	0 %	15004801
98	NC_001988	ATTCA	2	10	102870	102879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_001988	TTTAG	2	10	103920	103929	20 %	60 %	20 %	0 %	15004802
100	NC_001988	CATAT	2	10	103971	103980	40 %	40 %	0 %	20 %	15004802
101	NC_001988	TAAAA	2	10	104864	104873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001988	TTATT	2	10	106611	106620	20 %	80 %	0 %	0 %	15004805
103	NC_001988	GTATT	2	10	107205	107214	20 %	60 %	20 %	0 %	15004805
104	NC_001988	AATTT	2	10	107229	107238	40 %	60 %	0 %	0 %	15004805
105	NC_001988	TAGAT	2	10	107830	107839	40 %	40 %	20 %	0 %	15004805
106	NC_001988	ATAAA	2	10	109023	109032	80 %	20 %	0 %	0 %	15004805
107	NC_001988	TTTCA	2	10	113482	113491	20 %	60 %	0 %	20 %	15004809
108	NC_001988	AATTA	2	10	114369	114378	60 %	40 %	0 %	0 %	15004811
109	NC_001988	AGAGA	2	10	114569	114578	60 %	0 %	40 %	0 %	15004811
110	NC_001988	TTTAT	2	10	114912	114921	20 %	80 %	0 %	0 %	15004812
111	NC_001988	GATAC	2	10	117984	117993	40 %	20 %	20 %	20 %	15004815
112	NC_001988	TTACA	2	10	120557	120566	40 %	40 %	0 %	20 %	15004817
113	NC_001988	AAAGA	2	10	120603	120612	80 %	0 %	20 %	0 %	15004817
114	NC_001988	TTACA	2	10	121310	121319	40 %	40 %	0 %	20 %	15004818
115	NC_001988	ACCAT	2	10	124050	124059	40 %	20 %	0 %	40 %	15004820
116	NC_001988	TTTAA	2	10	128612	128621	40 %	60 %	0 %	0 %	15004822
117	NC_001988	TTCAG	2	10	132109	132118	20 %	40 %	20 %	20 %	15004824
118	NC_001988	CTACA	2	10	132594	132603	40 %	20 %	0 %	40 %	15004824
119	NC_001988	ATTAC	2	10	132776	132785	40 %	40 %	0 %	20 %	15004825
120	NC_001988	CTTGC	2	10	135357	135366	0 %	40 %	20 %	40 %	15004827
121	NC_001988	ATCTT	2	10	136723	136732	20 %	60 %	0 %	20 %	15004829
122	NC_001988	TTAAT	2	10	137363	137372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001988	AAAGA	2	10	138751	138760	80 %	0 %	20 %	0 %	15004831
124	NC_001988	ATAAA	2	10	139335	139344	80 %	20 %	0 %	0 %	15004831
125	NC_001988	TTGGA	2	10	140570	140579	20 %	40 %	40 %	0 %	15004832
126	NC_001988	TTATT	2	10	141910	141919	20 %	80 %	0 %	0 %	15004834
127	NC_001988	TATTT	2	10	143319	143328	20 %	80 %	0 %	0 %	15004836
128	NC_001988	TAAAT	2	10	144136	144145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001988	CTCTT	2	10	148207	148216	0 %	60 %	0 %	40 %	15004840
130	NC_001988	CTATC	2	10	148239	148248	20 %	40 %	0 %	40 %	15004840
131	NC_001988	ATGTT	2	10	148832	148841	20 %	60 %	20 %	0 %	15004841
132	NC_001988	TTTCT	2	10	149131	149140	0 %	80 %	0 %	20 %	15004841
133	NC_001988	TTTCC	2	10	149243	149252	0 %	60 %	0 %	40 %	15004841
134	NC_001988	AATAA	2	10	150306	150315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001988	GGCTT	2	10	150800	150809	0 %	40 %	40 %	20 %	15004843
136	NC_001988	TTACT	2	10	151384	151393	20 %	60 %	0 %	20 %	15004843
137	NC_001988	TCTTA	2	10	151860	151869	20 %	60 %	0 %	20 %	15004843
138	NC_001988	AATAT	2	10	152329	152338	60 %	40 %	0 %	0 %	15004844
139	NC_001988	ATTTT	2	10	152616	152625	20 %	80 %	0 %	0 %	15004844
140	NC_001988	AATGG	2	10	152767	152776	40 %	20 %	40 %	0 %	15004844
141	NC_001988	AACAT	2	10	154556	154565	60 %	20 %	0 %	20 %	15004846
142	NC_001988	TATCA	2	10	156672	156681	40 %	40 %	0 %	20 %	15004849
143	NC_001988	TTCAA	2	10	156816	156825	40 %	40 %	0 %	20 %	15004849
144	NC_001988	TGTAA	2	10	157225	157234	40 %	40 %	20 %	0 %	15004850
145	NC_001988	ATATA	2	10	157717	157726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001988	TTTAC	2	10	160399	160408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_001988	GATAT	2	10	162103	162112	40 %	40 %	20 %	0 %	15004853
148	NC_001988	TCAAT	2	10	165255	165264	40 %	40 %	0 %	20 %	15004855
149	NC_001988	CATAA	2	10	165599	165608	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_001988	TGTAA	2	10	167023	167032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001988	ATAAG	2	10	168011	168020	60 %	20 %	20 %	0 %	15004859
152	NC_001988	CTTAT	2	10	168030	168039	20 %	60 %	0 %	20 %	15004860
153	NC_001988	TTAAA	2	10	168876	168885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_001988	AACAA	2	10	169429	169438	80 %	0 %	0 %	20 %	15004861
155	NC_001988	AACAA	2	10	169558	169567	80 %	0 %	0 %	20 %	15004861
156	NC_001988	CAAAT	2	10	169689	169698	60 %	20 %	0 %	20 %	15004861
157	NC_001988	ATTTT	2	10	170573	170582	20 %	80 %	0 %	0 %	15004862
158	NC_001988	TTAAA	2	10	173808	173817	60 %	40 %	0 %	0 %	15004863
159	NC_001988	TTGCA	2	10	173947	173956	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_001988	TCAAA	2	10	174273	174282	60 %	20 %	0 %	20 %	15004864
161	NC_001988	ATTAA	2	10	174463	174472	60 %	40 %	0 %	0 %	15004864
162	NC_001988	TTGTT	2	10	175685	175694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_001988	TTTTC	2	10	176210	176219	0 %	80 %	0 %	20 %	15004865
164	NC_001988	ATTAT	2	10	176503	176512	40 %	60 %	0 %	0 %	15004865
165	NC_001988	TAGAA	2	10	180889	180898	60 %	20 %	20 %	0 %	15004869
166	NC_001988	TTAAA	2	10	181538	181547	60 %	40 %	0 %	0 %	15004870
167	NC_001988	AATGT	2	10	181771	181780	40 %	40 %	20 %	0 %	15004871
168	NC_001988	TTAAA	2	10	182608	182617	60 %	40 %	0 %	0 %	15004871
169	NC_001988	GATTT	2	10	183100	183109	20 %	60 %	20 %	0 %	15004871
170	NC_001988	GAAAT	2	10	184538	184547	60 %	20 %	20 %	0 %	15004872
171	NC_001988	TAAAA	2	10	184649	184658	80 %	20 %	0 %	0 %	15004873
172	NC_001988	TCACA	2	10	184771	184780	40 %	20 %	0 %	40 %	15004873
173	NC_001988	AGTAT	2	10	185037	185046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_001988	TAAAA	2	10	185346	185355	80 %	20 %	0 %	0 %	15004874
175	NC_001988	GGATG	2	10	187267	187276	20 %	20 %	60 %	0 %	15004877
176	NC_001988	ATTTT	2	10	187336	187345	20 %	80 %	0 %	0 %	15004877
177	NC_001988	TAAAT	2	10	187556	187565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_001988	TCTTT	2	10	187876	187885	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_001988	CAATT	2	10	189267	189276	40 %	40 %	0 %	20 %	15004878
180	NC_001988	TAAAA	2	10	189499	189508	80 %	20 %	0 %	0 %	15004878
181	NC_001988	GTTAA	2	10	190507	190516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_001988	ACCTA	2	10	191392	191401	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.