MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001988	GGATA	2	10	86	95	40 %	20 %	40 %	0 %	15004706
2	NC_001988	GCTTA	2	10	366	375	20 %	40 %	20 %	20 %	15004706
3	NC_001988	AATTA	2	10	705	714	60 %	40 %	0 %	0 %	15004706
4	NC_001988	AGTAT	2	10	1986	1995	40 %	40 %	20 %	0 %	15004707
5	NC_001988	TAGTT	2	10	2576	2585	20 %	60 %	20 %	0 %	15004707
6	NC_001988	TTAGA	2	10	3076	3085	40 %	40 %	20 %	0 %	15004707
7	NC_001988	AAAGT	2	10	3463	3472	60 %	20 %	20 %	0 %	15004707
8	NC_001988	ATATT	2	10	10166	10175	40 %	60 %	0 %	0 %	15004714
9	NC_001988	AAAGG	2	10	10495	10504	60 %	0 %	40 %	0 %	15004714
10	NC_001988	ACTTC	2	10	11263	11272	20 %	40 %	0 %	40 %	15004715
11	NC_001988	ATTTT	2	10	15238	15247	20 %	80 %	0 %	0 %	15004718
12	NC_001988	AAAAT	2	10	18490	18499	80 %	20 %	0 %	0 %	15004721
13	NC_001988	TACGT	2	10	20673	20682	20 %	40 %	20 %	20 %	15004724
14	NC_001988	ATCTA	2	10	21141	21150	40 %	40 %	0 %	20 %	15004724
15	NC_001988	TAAAC	2	10	21196	21205	60 %	20 %	0 %	20 %	15004724
16	NC_001988	TGGTT	2	10	21590	21599	0 %	60 %	40 %	0 %	15004724
17	NC_001988	TTTTC	2	10	21605	21614	0 %	80 %	0 %	20 %	15004724
18	NC_001988	CTTTT	2	10	22296	22305	0 %	80 %	0 %	20 %	15004726
19	NC_001988	TAAAG	2	10	23333	23342	60 %	20 %	20 %	0 %	15004726
20	NC_001988	CTTTT	2	10	23704	23713	0 %	80 %	0 %	20 %	15004727
21	NC_001988	TGAAT	2	10	25106	25115	40 %	40 %	20 %	0 %	15004729
22	NC_001988	TATCT	2	10	27755	27764	20 %	60 %	0 %	20 %	15004731
23	NC_001988	ATAAA	2	10	29436	29445	80 %	20 %	0 %	0 %	15004732
24	NC_001988	ACAGC	2	10	30455	30464	40 %	0 %	20 %	40 %	15004733
25	NC_001988	TAAAG	2	10	32279	32288	60 %	20 %	20 %	0 %	15004735
26	NC_001988	TTAAT	2	10	32473	32482	40 %	60 %	0 %	0 %	15004736
27	NC_001988	TTATT	2	10	34807	34816	20 %	80 %	0 %	0 %	15004739
28	NC_001988	TTTTA	2	10	35456	35465	20 %	80 %	0 %	0 %	15004739
29	NC_001988	TTTAT	2	10	37513	37522	20 %	80 %	0 %	0 %	15004741
30	NC_001988	AAATT	2	10	38127	38136	60 %	40 %	0 %	0 %	15004741
31	NC_001988	TTTAT	2	10	38414	38423	20 %	80 %	0 %	0 %	15004742
32	NC_001988	ATTAT	2	10	44285	44294	40 %	60 %	0 %	0 %	15004748
33	NC_001988	TAGAA	2	10	46241	46250	60 %	20 %	20 %	0 %	15004750
34	NC_001988	AAAGA	2	10	48093	48102	80 %	0 %	20 %	0 %	15004752
35	NC_001988	TATAA	2	10	49037	49046	60 %	40 %	0 %	0 %	15004752
36	NC_001988	TTTTC	2	10	52380	52389	0 %	80 %	0 %	20 %	15004755
37	NC_001988	TAGGT	2	10	52758	52767	20 %	40 %	40 %	0 %	15004755
38	NC_001988	TTCTT	2	10	52920	52929	0 %	80 %	0 %	20 %	15004755
39	NC_001988	TATTC	2	10	53039	53048	20 %	60 %	0 %	20 %	15004756
40	NC_001988	TTATT	2	10	53469	53478	20 %	80 %	0 %	0 %	15004756
41	NC_001988	TGAGT	2	10	53804	53813	20 %	40 %	40 %	0 %	15004757
42	NC_001988	CAATC	2	10	54084	54093	40 %	20 %	0 %	40 %	15004757
43	NC_001988	AGTAT	2	10	58456	58465	40 %	40 %	20 %	0 %	15004761
44	NC_001988	CATTT	2	10	61111	61120	20 %	60 %	0 %	20 %	15004763
45	NC_001988	GATAT	2	10	61733	61742	40 %	40 %	20 %	0 %	15004764
46	NC_001988	TCATA	2	10	63069	63078	40 %	40 %	0 %	20 %	15004766
47	NC_001988	TAAGT	2	10	63636	63645	40 %	40 %	20 %	0 %	15004767
48	NC_001988	GCCAG	2	10	64198	64207	20 %	0 %	40 %	40 %	15004767
49	NC_001988	TTGAA	2	10	65992	66001	40 %	40 %	20 %	0 %	15004768
50	NC_001988	TCTCA	2	10	66026	66035	20 %	40 %	0 %	40 %	15004768
51	NC_001988	AGAAA	2	10	66978	66987	80 %	0 %	20 %	0 %	15004769
52	NC_001988	ATATT	2	10	68485	68494	40 %	60 %	0 %	0 %	15004769
53	NC_001988	GTTAA	2	10	72011	72020	40 %	40 %	20 %	0 %	15004772
54	NC_001988	TTGTT	2	10	77296	77305	0 %	80 %	20 %	0 %	15004777
55	NC_001988	TTATT	2	10	77662	77671	20 %	80 %	0 %	0 %	15004777
56	NC_001988	TTATG	2	10	78427	78436	20 %	60 %	20 %	0 %	15004777
57	NC_001988	AATGG	2	10	79019	79028	40 %	20 %	40 %	0 %	15004778
58	NC_001988	TTATT	2	10	81015	81024	20 %	80 %	0 %	0 %	15004781
59	NC_001988	ATTAA	2	10	81920	81929	60 %	40 %	0 %	0 %	15004781
60	NC_001988	CTCTT	2	10	82697	82706	0 %	60 %	0 %	40 %	15004782
61	NC_001988	GATAT	2	10	84799	84808	40 %	40 %	20 %	0 %	15004784
62	NC_001988	ATCAA	2	10	86903	86912	60 %	20 %	0 %	20 %	15004787
63	NC_001988	AAAAT	2	10	88131	88140	80 %	20 %	0 %	0 %	15004789
64	NC_001988	TGAAC	2	10	89539	89548	40 %	20 %	20 %	20 %	15004790
65	NC_001988	GAAAT	2	10	91087	91096	60 %	20 %	20 %	0 %	15004791
66	NC_001988	TATTC	2	10	91990	91999	20 %	60 %	0 %	20 %	15004792
67	NC_001988	CTTCT	2	10	92487	92496	0 %	60 %	0 %	40 %	15004792
68	NC_001988	CAAGC	2	10	93441	93450	40 %	0 %	20 %	40 %	15004793
69	NC_001988	CAATA	2	10	95758	95767	60 %	20 %	0 %	20 %	15004797
70	NC_001988	GTTCT	2	10	95887	95896	0 %	60 %	20 %	20 %	15004797
71	NC_001988	AGAAT	2	10	97290	97299	60 %	20 %	20 %	0 %	15004798
72	NC_001988	GCTTG	2	10	101539	101548	0 %	40 %	40 %	20 %	15004801
73	NC_001988	TTTTG	2	10	101597	101606	0 %	80 %	20 %	0 %	15004801
74	NC_001988	TTTAG	2	10	103920	103929	20 %	60 %	20 %	0 %	15004802
75	NC_001988	CATAT	2	10	103971	103980	40 %	40 %	0 %	20 %	15004802
76	NC_001988	TTATT	2	10	106611	106620	20 %	80 %	0 %	0 %	15004805
77	NC_001988	GTATT	2	10	107205	107214	20 %	60 %	20 %	0 %	15004805
78	NC_001988	AATTT	2	10	107229	107238	40 %	60 %	0 %	0 %	15004805
79	NC_001988	TAGAT	2	10	107830	107839	40 %	40 %	20 %	0 %	15004805
80	NC_001988	ATAAA	2	10	109023	109032	80 %	20 %	0 %	0 %	15004805
81	NC_001988	TTTCA	2	10	113482	113491	20 %	60 %	0 %	20 %	15004809
82	NC_001988	AATTA	2	10	114369	114378	60 %	40 %	0 %	0 %	15004811
83	NC_001988	AGAGA	2	10	114569	114578	60 %	0 %	40 %	0 %	15004811
84	NC_001988	TTTAT	2	10	114912	114921	20 %	80 %	0 %	0 %	15004812
85	NC_001988	GATAC	2	10	117984	117993	40 %	20 %	20 %	20 %	15004815
86	NC_001988	TTACA	2	10	120557	120566	40 %	40 %	0 %	20 %	15004817
87	NC_001988	AAAGA	2	10	120603	120612	80 %	0 %	20 %	0 %	15004817
88	NC_001988	TTACA	2	10	121310	121319	40 %	40 %	0 %	20 %	15004818
89	NC_001988	ACCAT	2	10	124050	124059	40 %	20 %	0 %	40 %	15004820
90	NC_001988	TTTAA	2	10	128612	128621	40 %	60 %	0 %	0 %	15004822
91	NC_001988	TTCAG	2	10	132109	132118	20 %	40 %	20 %	20 %	15004824
92	NC_001988	CTACA	2	10	132594	132603	40 %	20 %	0 %	40 %	15004824
93	NC_001988	ATTAC	2	10	132776	132785	40 %	40 %	0 %	20 %	15004825
94	NC_001988	CTTGC	2	10	135357	135366	0 %	40 %	20 %	40 %	15004827
95	NC_001988	ATCTT	2	10	136723	136732	20 %	60 %	0 %	20 %	15004829
96	NC_001988	AAAGA	2	10	138751	138760	80 %	0 %	20 %	0 %	15004831
97	NC_001988	ATAAA	2	10	139335	139344	80 %	20 %	0 %	0 %	15004831
98	NC_001988	TTGGA	2	10	140570	140579	20 %	40 %	40 %	0 %	15004832
99	NC_001988	TTATT	2	10	141910	141919	20 %	80 %	0 %	0 %	15004834
100	NC_001988	TATTT	2	10	143319	143328	20 %	80 %	0 %	0 %	15004836
101	NC_001988	CTCTT	2	10	148207	148216	0 %	60 %	0 %	40 %	15004840
102	NC_001988	CTATC	2	10	148239	148248	20 %	40 %	0 %	40 %	15004840
103	NC_001988	ATGTT	2	10	148832	148841	20 %	60 %	20 %	0 %	15004841
104	NC_001988	TTTCT	2	10	149131	149140	0 %	80 %	0 %	20 %	15004841
105	NC_001988	TTTCC	2	10	149243	149252	0 %	60 %	0 %	40 %	15004841
106	NC_001988	GGCTT	2	10	150800	150809	0 %	40 %	40 %	20 %	15004843
107	NC_001988	TTACT	2	10	151384	151393	20 %	60 %	0 %	20 %	15004843
108	NC_001988	TCTTA	2	10	151860	151869	20 %	60 %	0 %	20 %	15004843
109	NC_001988	AATAT	2	10	152329	152338	60 %	40 %	0 %	0 %	15004844
110	NC_001988	ATTTT	2	10	152616	152625	20 %	80 %	0 %	0 %	15004844
111	NC_001988	AATGG	2	10	152767	152776	40 %	20 %	40 %	0 %	15004844
112	NC_001988	AACAT	2	10	154556	154565	60 %	20 %	0 %	20 %	15004846
113	NC_001988	TATCA	2	10	156672	156681	40 %	40 %	0 %	20 %	15004849
114	NC_001988	TTCAA	2	10	156816	156825	40 %	40 %	0 %	20 %	15004849
115	NC_001988	TGTAA	2	10	157225	157234	40 %	40 %	20 %	0 %	15004850
116	NC_001988	GATAT	2	10	162103	162112	40 %	40 %	20 %	0 %	15004853
117	NC_001988	TCAAT	2	10	165255	165264	40 %	40 %	0 %	20 %	15004855
118	NC_001988	ATAAG	2	10	168011	168020	60 %	20 %	20 %	0 %	15004859
119	NC_001988	CTTAT	2	10	168030	168039	20 %	60 %	0 %	20 %	15004860
120	NC_001988	AACAA	2	10	169429	169438	80 %	0 %	0 %	20 %	15004861
121	NC_001988	AACAA	2	10	169558	169567	80 %	0 %	0 %	20 %	15004861
122	NC_001988	CAAAT	2	10	169689	169698	60 %	20 %	0 %	20 %	15004861
123	NC_001988	ATTTT	2	10	170573	170582	20 %	80 %	0 %	0 %	15004862
124	NC_001988	TTAAA	2	10	173808	173817	60 %	40 %	0 %	0 %	15004863
125	NC_001988	TCAAA	2	10	174273	174282	60 %	20 %	0 %	20 %	15004864
126	NC_001988	ATTAA	2	10	174463	174472	60 %	40 %	0 %	0 %	15004864
127	NC_001988	TTTTC	2	10	176210	176219	0 %	80 %	0 %	20 %	15004865
128	NC_001988	ATTAT	2	10	176503	176512	40 %	60 %	0 %	0 %	15004865
129	NC_001988	TAGAA	2	10	180889	180898	60 %	20 %	20 %	0 %	15004869
130	NC_001988	TTAAA	2	10	181538	181547	60 %	40 %	0 %	0 %	15004870
131	NC_001988	AATGT	2	10	181771	181780	40 %	40 %	20 %	0 %	15004871
132	NC_001988	TTAAA	2	10	182608	182617	60 %	40 %	0 %	0 %	15004871
133	NC_001988	GATTT	2	10	183100	183109	20 %	60 %	20 %	0 %	15004871
134	NC_001988	GAAAT	2	10	184538	184547	60 %	20 %	20 %	0 %	15004872
135	NC_001988	TAAAA	2	10	184649	184658	80 %	20 %	0 %	0 %	15004873
136	NC_001988	TCACA	2	10	184771	184780	40 %	20 %	0 %	40 %	15004873
137	NC_001988	TAAAA	2	10	185346	185355	80 %	20 %	0 %	0 %	15004874
138	NC_001988	GGATG	2	10	187267	187276	20 %	20 %	60 %	0 %	15004877
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140	NC_001988	CAATT	2	10	189267	189276	40 %	40 %	0 %	20 %	15004878
141	NC_001988	TAAAA	2	10	189499	189508	80 %	20 %	0 %	0 %	15004878

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.