MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1

Total Repeats: 528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001988	TA	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	15004706
2	NC_001988	TA	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	15004706
3	NC_001988	CA	3	6	676	681	50 %	0 %	0 %	50 %	15004706
4	NC_001988	TA	3	6	822	827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001988	TA	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
6	NC_001988	AT	3	6	2902	2907	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
7	NC_001988	TA	3	6	3128	3133	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
8	NC_001988	AT	3	6	3414	3419	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
9	NC_001988	TA	3	6	3420	3425	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
10	NC_001988	AT	3	6	3438	3443	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
11	NC_001988	TA	5	10	3501	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
12	NC_001988	TA	4	8	3756	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
13	NC_001988	AT	4	8	3852	3859	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
14	NC_001988	TA	4	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
15	NC_001988	TA	4	8	3977	3984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001988	TA	3	6	4012	4017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001988	TA	3	6	4040	4045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001988	TA	3	6	5616	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
19	NC_001988	TA	3	6	5678	5683	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
20	NC_001988	AT	3	6	6174	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
21	NC_001988	AT	3	6	6586	6591	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
22	NC_001988	TG	3	6	7961	7966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001988	AT	3	6	8194	8199	50 %	50 %	0 %	0 %	15004710
24	NC_001988	TA	3	6	8325	8330	50 %	50 %	0 %	0 %	15004710
25	NC_001988	TA	4	8	8387	8394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001988	TA	3	6	8673	8678	50 %	50 %	0 %	0 %	15004711
27	NC_001988	TA	3	6	8754	8759	50 %	50 %	0 %	0 %	15004711
28	NC_001988	TA	3	6	9006	9011	50 %	50 %	0 %	0 %	15004711
29	NC_001988	AG	3	6	9164	9169	50 %	0 %	50 %	0 %	15004711
30	NC_001988	AT	3	6	9800	9805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001988	TA	3	6	10526	10531	50 %	50 %	0 %	0 %	15004714
32	NC_001988	AT	3	6	11696	11701	50 %	50 %	0 %	0 %	15004715
33	NC_001988	AT	3	6	11818	11823	50 %	50 %	0 %	0 %	15004715
34	NC_001988	TA	3	6	12441	12446	50 %	50 %	0 %	0 %	15004715
35	NC_001988	TG	3	6	12621	12626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001988	AT	3	6	12633	12638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001988	AT	3	6	13672	13677	50 %	50 %	0 %	0 %	15004717
38	NC_001988	AT	3	6	13806	13811	50 %	50 %	0 %	0 %	15004717
39	NC_001988	TA	3	6	14558	14563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001988	TA	3	6	15623	15628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001988	TA	3	6	15965	15970	50 %	50 %	0 %	0 %	15004719
42	NC_001988	AT	3	6	16162	16167	50 %	50 %	0 %	0 %	15004719
43	NC_001988	AT	3	6	16412	16417	50 %	50 %	0 %	0 %	15004719
44	NC_001988	AT	3	6	17755	17760	50 %	50 %	0 %	0 %	15004721
45	NC_001988	AT	4	8	17764	17771	50 %	50 %	0 %	0 %	15004721
46	NC_001988	TA	4	8	17779	17786	50 %	50 %	0 %	0 %	15004721
47	NC_001988	AT	3	6	18877	18882	50 %	50 %	0 %	0 %	15004722
48	NC_001988	AG	3	6	18974	18979	50 %	0 %	50 %	0 %	15004722
49	NC_001988	AT	3	6	19170	19175	50 %	50 %	0 %	0 %	15004723
50	NC_001988	AT	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	15004723
51	NC_001988	CT	3	6	19867	19872	0 %	50 %	0 %	50 %	15004723
52	NC_001988	AT	3	6	20481	20486	50 %	50 %	0 %	0 %	15004724
53	NC_001988	AT	3	6	21091	21096	50 %	50 %	0 %	0 %	15004724
54	NC_001988	AT	3	6	21103	21108	50 %	50 %	0 %	0 %	15004724
55	NC_001988	AT	3	6	21206	21211	50 %	50 %	0 %	0 %	15004724
56	NC_001988	TC	3	6	21319	21324	0 %	50 %	0 %	50 %	15004724
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58	NC_001988	AT	3	6	21955	21960	50 %	50 %	0 %	0 %	15004725
59	NC_001988	AT	3	6	22337	22342	50 %	50 %	0 %	0 %	15004726
60	NC_001988	TG	3	6	23383	23388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001988	AT	3	6	23751	23756	50 %	50 %	0 %	0 %	15004727
62	NC_001988	TA	3	6	23964	23969	50 %	50 %	0 %	0 %	15004727
63	NC_001988	TA	3	6	24012	24017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001988	AT	3	6	24142	24147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001988	TA	3	6	24221	24226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001988	TA	3	6	25062	25067	50 %	50 %	0 %	0 %	15004729
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69	NC_001988	TA	3	6	26389	26394	50 %	50 %	0 %	0 %	15004729
70	NC_001988	AT	3	6	26909	26914	50 %	50 %	0 %	0 %	15004730
71	NC_001988	TA	3	6	27802	27807	50 %	50 %	0 %	0 %	15004731
72	NC_001988	GA	3	6	28358	28363	50 %	0 %	50 %	0 %	15004731
73	NC_001988	CA	3	6	28953	28958	50 %	0 %	0 %	50 %	15004731
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75	NC_001988	TA	3	6	29407	29412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001988	TA	3	6	29847	29852	50 %	50 %	0 %	0 %	15004732
77	NC_001988	AT	3	6	31082	31087	50 %	50 %	0 %	0 %	15004733
78	NC_001988	AT	4	8	31833	31840	50 %	50 %	0 %	0 %	15004734
79	NC_001988	TA	3	6	31972	31977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001988	TA	3	6	32363	32368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001988	GA	3	6	32457	32462	50 %	0 %	50 %	0 %	15004736
82	NC_001988	AT	3	6	32573	32578	50 %	50 %	0 %	0 %	15004736
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85	NC_001988	AG	3	6	33002	33007	50 %	0 %	50 %	0 %	15004737
86	NC_001988	TA	3	6	33133	33138	50 %	50 %	0 %	0 %	15004737
87	NC_001988	AT	3	6	33188	33193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001988	TA	3	6	33515	33520	50 %	50 %	0 %	0 %	15004738
89	NC_001988	TA	3	6	33734	33739	50 %	50 %	0 %	0 %	15004739
90	NC_001988	AT	3	6	34922	34927	50 %	50 %	0 %	0 %	15004739
91	NC_001988	TA	4	8	35186	35193	50 %	50 %	0 %	0 %	15004739
92	NC_001988	GT	3	6	35202	35207	0 %	50 %	50 %	0 %	15004739
93	NC_001988	TA	3	6	35396	35401	50 %	50 %	0 %	0 %	15004739
94	NC_001988	TA	3	6	35486	35491	50 %	50 %	0 %	0 %	15004739
95	NC_001988	TA	4	8	36069	36076	50 %	50 %	0 %	0 %	15004739
96	NC_001988	TC	3	6	36246	36251	0 %	50 %	0 %	50 %	15004739
97	NC_001988	TA	3	6	36300	36305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001988	AC	3	6	36379	36384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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100	NC_001988	TA	3	6	37059	37064	50 %	50 %	0 %	0 %	15004740
101	NC_001988	AT	3	6	37164	37169	50 %	50 %	0 %	0 %	15004740
102	NC_001988	AT	4	8	37598	37605	50 %	50 %	0 %	0 %	15004741
103	NC_001988	TA	3	6	37830	37835	50 %	50 %	0 %	0 %	15004741
104	NC_001988	AT	3	6	37917	37922	50 %	50 %	0 %	0 %	15004741
105	NC_001988	CA	3	6	38229	38234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_001988	AT	3	6	38342	38347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001988	AT	3	6	38694	38699	50 %	50 %	0 %	0 %	15004742
108	NC_001988	TA	3	6	39210	39215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001988	CT	3	6	39282	39287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_001988	AG	3	6	39301	39306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001988	AT	3	6	39549	39554	50 %	50 %	0 %	0 %	15004744
112	NC_001988	TA	4	8	39701	39708	50 %	50 %	0 %	0 %	15004744
113	NC_001988	AT	4	8	39723	39730	50 %	50 %	0 %	0 %	15004744
114	NC_001988	AT	4	8	40023	40030	50 %	50 %	0 %	0 %	15004744
115	NC_001988	TC	3	6	40537	40542	0 %	50 %	0 %	50 %	15004744
116	NC_001988	TA	3	6	40551	40556	50 %	50 %	0 %	0 %	15004744
117	NC_001988	TA	3	6	41114	41119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001988	AT	3	6	41123	41128	50 %	50 %	0 %	0 %	15004745
119	NC_001988	AT	3	6	41332	41337	50 %	50 %	0 %	0 %	15004745
120	NC_001988	TA	3	6	41374	41379	50 %	50 %	0 %	0 %	15004745
121	NC_001988	TA	3	6	41438	41443	50 %	50 %	0 %	0 %	15004745
122	NC_001988	TA	3	6	41688	41693	50 %	50 %	0 %	0 %	15004746
123	NC_001988	AT	3	6	41767	41772	50 %	50 %	0 %	0 %	15004746
124	NC_001988	TA	3	6	42116	42121	50 %	50 %	0 %	0 %	15004746
125	NC_001988	AT	4	8	42140	42147	50 %	50 %	0 %	0 %	15004746
126	NC_001988	TA	3	6	42187	42192	50 %	50 %	0 %	0 %	15004746
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128	NC_001988	AT	3	6	42958	42963	50 %	50 %	0 %	0 %	15004747
129	NC_001988	AT	3	6	43085	43090	50 %	50 %	0 %	0 %	15004747
130	NC_001988	TA	3	6	43479	43484	50 %	50 %	0 %	0 %	15004747
131	NC_001988	AT	3	6	43521	43526	50 %	50 %	0 %	0 %	15004747
132	NC_001988	AT	3	6	43697	43702	50 %	50 %	0 %	0 %	15004748
133	NC_001988	TA	3	6	44008	44013	50 %	50 %	0 %	0 %	15004748
134	NC_001988	TA	3	6	44436	44441	50 %	50 %	0 %	0 %	15004748
135	NC_001988	AT	3	6	44573	44578	50 %	50 %	0 %	0 %	15004748
136	NC_001988	TA	3	6	44711	44716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001988	AT	3	6	45122	45127	50 %	50 %	0 %	0 %	15004749
138	NC_001988	TA	3	6	45346	45351	50 %	50 %	0 %	0 %	15004749
139	NC_001988	AT	4	8	46120	46127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001988	TA	3	6	46197	46202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001988	GA	3	6	46471	46476	50 %	0 %	50 %	0 %	15004750
142	NC_001988	TA	3	6	46597	46602	50 %	50 %	0 %	0 %	15004750
143	NC_001988	TA	3	6	46674	46679	50 %	50 %	0 %	0 %	15004750
144	NC_001988	TA	3	6	47453	47458	50 %	50 %	0 %	0 %	15004751
145	NC_001988	AT	3	6	47577	47582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001988	TA	3	6	47776	47781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001988	TG	3	6	47930	47935	0 %	50 %	50 %	0 %	15004752
148	NC_001988	AT	3	6	48032	48037	50 %	50 %	0 %	0 %	15004752
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