MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1

Total Repeats: 383

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001988	TA	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	15004706
2	NC_001988	TA	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	15004706
3	NC_001988	CA	3	6	676	681	50 %	0 %	0 %	50 %	15004706
4	NC_001988	TA	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
5	NC_001988	AT	3	6	2902	2907	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
6	NC_001988	TA	3	6	3128	3133	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
7	NC_001988	AT	3	6	3414	3419	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
8	NC_001988	TA	3	6	3420	3425	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
9	NC_001988	AT	3	6	3438	3443	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
10	NC_001988	TA	5	10	3501	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
11	NC_001988	TA	4	8	3756	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
12	NC_001988	AT	4	8	3852	3859	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
13	NC_001988	TA	4	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	15004707
14	NC_001988	TA	3	6	5616	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
15	NC_001988	TA	3	6	5678	5683	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
16	NC_001988	AT	3	6	6174	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
17	NC_001988	AT	3	6	6586	6591	50 %	50 %	0 %	0 %	15004708
18	NC_001988	AT	3	6	8194	8199	50 %	50 %	0 %	0 %	15004710
19	NC_001988	TA	3	6	8325	8330	50 %	50 %	0 %	0 %	15004710
20	NC_001988	TA	3	6	8673	8678	50 %	50 %	0 %	0 %	15004711
21	NC_001988	TA	3	6	8754	8759	50 %	50 %	0 %	0 %	15004711
22	NC_001988	TA	3	6	9006	9011	50 %	50 %	0 %	0 %	15004711
23	NC_001988	AG	3	6	9164	9169	50 %	0 %	50 %	0 %	15004711
24	NC_001988	TA	3	6	10526	10531	50 %	50 %	0 %	0 %	15004714
25	NC_001988	AT	3	6	11696	11701	50 %	50 %	0 %	0 %	15004715
26	NC_001988	AT	3	6	11818	11823	50 %	50 %	0 %	0 %	15004715
27	NC_001988	TA	3	6	12441	12446	50 %	50 %	0 %	0 %	15004715
28	NC_001988	AT	3	6	13672	13677	50 %	50 %	0 %	0 %	15004717
29	NC_001988	AT	3	6	13806	13811	50 %	50 %	0 %	0 %	15004717
30	NC_001988	TA	3	6	15965	15970	50 %	50 %	0 %	0 %	15004719
31	NC_001988	AT	3	6	16162	16167	50 %	50 %	0 %	0 %	15004719
32	NC_001988	AT	3	6	16412	16417	50 %	50 %	0 %	0 %	15004719
33	NC_001988	AT	3	6	17755	17760	50 %	50 %	0 %	0 %	15004721
34	NC_001988	AT	4	8	17764	17771	50 %	50 %	0 %	0 %	15004721
35	NC_001988	TA	4	8	17779	17786	50 %	50 %	0 %	0 %	15004721
36	NC_001988	AT	3	6	18877	18882	50 %	50 %	0 %	0 %	15004722
37	NC_001988	AG	3	6	18974	18979	50 %	0 %	50 %	0 %	15004722
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39	NC_001988	AT	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	15004723
40	NC_001988	CT	3	6	19867	19872	0 %	50 %	0 %	50 %	15004723
41	NC_001988	AT	3	6	20481	20486	50 %	50 %	0 %	0 %	15004724
42	NC_001988	AT	3	6	21091	21096	50 %	50 %	0 %	0 %	15004724
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44	NC_001988	AT	3	6	21206	21211	50 %	50 %	0 %	0 %	15004724
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50	NC_001988	TA	3	6	23964	23969	50 %	50 %	0 %	0 %	15004727
51	NC_001988	TA	3	6	25062	25067	50 %	50 %	0 %	0 %	15004729
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64	NC_001988	AT	3	6	32573	32578	50 %	50 %	0 %	0 %	15004736
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70	NC_001988	TA	3	6	33734	33739	50 %	50 %	0 %	0 %	15004739
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76	NC_001988	TA	4	8	36069	36076	50 %	50 %	0 %	0 %	15004739
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80	NC_001988	AT	3	6	37164	37169	50 %	50 %	0 %	0 %	15004740
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104	NC_001988	AT	3	6	43521	43526	50 %	50 %	0 %	0 %	15004747
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112	NC_001988	TA	3	6	46597	46602	50 %	50 %	0 %	0 %	15004750
113	NC_001988	TA	3	6	46674	46679	50 %	50 %	0 %	0 %	15004750
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.