MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp26

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001903	ATTTG	2	10	1822	1831	20 %	60 %	20 %	0 %	11497028
2	NC_001903	TTAAA	2	10	2263	2272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001903	TAAAA	2	10	3664	3673	80 %	20 %	0 %	0 %	364556793
4	NC_001903	TATAA	2	10	4009	4018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001903	TTTTA	2	10	4323	4332	20 %	80 %	0 %	0 %	11497018
6	NC_001903	ATTAG	2	10	5060	5069	40 %	40 %	20 %	0 %	11497016
7	NC_001903	TAAAA	2	10	6296	6305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001903	AAAAT	2	10	6492	6501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001903	AAATT	2	10	6632	6641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001903	ACTTT	2	10	7757	7766	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_001903	GAAAT	2	10	10153	10162	60 %	20 %	20 %	0 %	11497012
12	NC_001903	TATGC	2	10	10434	10443	20 %	40 %	20 %	20 %	11497012
13	NC_001903	TTCTG	2	10	11191	11200	0 %	60 %	20 %	20 %	11497011
14	NC_001903	TTTAG	2	10	11681	11690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001903	ATTTT	2	10	11900	11909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001903	AATTT	2	10	12056	12065	40 %	60 %	0 %	0 %	11497010
17	NC_001903	ATCTT	2	10	12358	12367	20 %	60 %	0 %	20 %	11497010
18	NC_001903	GCAAA	2	10	12450	12459	60 %	0 %	20 %	20 %	11497010
19	NC_001903	TACAA	2	10	13142	13151	60 %	20 %	0 %	20 %	11497010
20	NC_001903	ATTTA	2	10	13573	13582	40 %	60 %	0 %	0 %	11497010
21	NC_001903	TTATG	2	10	13893	13902	20 %	60 %	20 %	0 %	11497009
22	NC_001903	TCTTT	2	10	14860	14869	0 %	80 %	0 %	20 %	11497009
23	NC_001903	CTCTT	2	10	17674	17683	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_001903	ATTTT	2	10	19339	19348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001903	TCTTT	2	10	19499	19508	0 %	80 %	0 %	20 %	364556795
26	NC_001903	TAGTA	2	10	20583	20592	40 %	40 %	20 %	0 %	364556795
27	NC_001903	TAACA	2	10	21651	21660	60 %	20 %	0 %	20 %	364556796
28	NC_001903	TTATA	2	10	21859	21868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001903	ATAAA	2	10	22418	22427	80 %	20 %	0 %	0 %	11497032
30	NC_001903	AAGAT	2	10	22789	22798	60 %	20 %	20 %	0 %	11497031
31	NC_001903	TTTTA	2	10	22999	23008	20 %	80 %	0 %	0 %	11497031
32	NC_001903	TAAAG	2	10	23185	23194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001903	ATAAA	2	10	23502	23511	80 %	20 %	0 %	0 %	11497030
34	NC_001903	ATTTA	2	10	24571	24580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001903	GAAGA	2	10	26164	26173	60 %	0 %	40 %	0 %	11497021
36	NC_001903	ATATA	2	10	26464	26473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.