MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp26

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001903	CTTT	2	8	182	189	0 %	75 %	0 %	25 %	364556794
2	NC_001903	AAAT	2	8	621	628	75 %	25 %	0 %	0 %	11497029
3	NC_001903	AGAC	2	8	1310	1317	50 %	0 %	25 %	25 %	11497028
4	NC_001903	AATT	2	8	1445	1452	50 %	50 %	0 %	0 %	11497028
5	NC_001903	AATT	2	8	1685	1692	50 %	50 %	0 %	0 %	11497028
6	NC_001903	ACAA	2	8	1777	1784	75 %	0 %	0 %	25 %	11497028
7	NC_001903	TTTC	2	8	2075	2082	0 %	75 %	0 %	25 %	11497028
8	NC_001903	TAAA	2	8	2377	2384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001903	TAAT	2	8	3835	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001903	TAAT	2	8	3901	3908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001903	TAAT	2	8	3937	3944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001903	TAAA	2	8	4059	4066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001903	ATCA	2	8	4286	4293	50 %	25 %	0 %	25 %	11497018
14	NC_001903	AATG	2	8	4694	4701	50 %	25 %	25 %	0 %	364556792
15	NC_001903	CAAT	2	8	4723	4730	50 %	25 %	0 %	25 %	364556792
16	NC_001903	AAGG	2	8	4756	4763	50 %	0 %	50 %	0 %	364556792
17	NC_001903	GAAA	2	8	4771	4778	75 %	0 %	25 %	0 %	11497016
18	NC_001903	ATAA	2	8	5150	5157	75 %	25 %	0 %	0 %	11497016
19	NC_001903	GAAA	2	8	5347	5354	75 %	0 %	25 %	0 %	11497016
20	NC_001903	ATAA	2	8	5859	5866	75 %	25 %	0 %	0 %	11497016
21	NC_001903	ATCC	2	8	6727	6734	25 %	25 %	0 %	50 %	11497026
22	NC_001903	ACTA	2	8	7021	7028	50 %	25 %	0 %	25 %	11497026
23	NC_001903	ATTA	2	8	8063	8070	50 %	50 %	0 %	0 %	11497015
24	NC_001903	TACT	2	8	8111	8118	25 %	50 %	0 %	25 %	11497015
25	NC_001903	AATA	2	8	8123	8130	75 %	25 %	0 %	0 %	11497015
26	NC_001903	ATAC	2	8	8676	8683	50 %	25 %	0 %	25 %	11497015
27	NC_001903	ATAA	2	8	8871	8878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001903	ATTT	2	8	8959	8966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001903	AGAA	2	8	9197	9204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001903	CAAG	2	8	9410	9417	50 %	0 %	25 %	25 %	11497013
31	NC_001903	GAAA	2	8	9601	9608	75 %	0 %	25 %	0 %	11497013
32	NC_001903	TAAA	2	8	10111	10118	75 %	25 %	0 %	0 %	11497012
33	NC_001903	GAAA	2	8	10196	10203	75 %	0 %	25 %	0 %	11497012
34	NC_001903	AATT	2	8	10408	10415	50 %	50 %	0 %	0 %	11497012
35	NC_001903	AAAT	2	8	10619	10626	75 %	25 %	0 %	0 %	11497012
36	NC_001903	ATTT	2	8	10879	10886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001903	AAAT	2	8	10895	10902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001903	TCCA	2	8	11169	11176	25 %	25 %	0 %	50 %	11497011
39	NC_001903	TTTA	2	8	11286	11293	25 %	75 %	0 %	0 %	11497011
40	NC_001903	ATTT	2	8	11724	11731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001903	TAAA	2	8	11754	11761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001903	ATAA	2	8	11778	11785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001903	AGCA	2	8	11829	11836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_001903	TATT	2	8	13785	13792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001903	GTTA	2	8	13859	13866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001903	ATTT	2	8	13965	13972	25 %	75 %	0 %	0 %	11497009
47	NC_001903	TGCA	2	8	14702	14709	25 %	25 %	25 %	25 %	11497009
48	NC_001903	ATTA	2	8	15204	15211	50 %	50 %	0 %	0 %	364556791
49	NC_001903	TTCA	2	8	15576	15583	25 %	50 %	0 %	25 %	364556791
50	NC_001903	AATT	2	8	16082	16089	50 %	50 %	0 %	0 %	364556791
51	NC_001903	TGGA	2	8	16158	16165	25 %	25 %	50 %	0 %	364556791
52	NC_001903	TTTG	2	8	16293	16300	0 %	75 %	25 %	0 %	364556791
53	NC_001903	TAAA	2	8	16680	16687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001903	ATAA	2	8	16878	16885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001903	TGCT	2	8	17471	17478	0 %	50 %	25 %	25 %	11497024
56	NC_001903	TTAA	2	8	17532	17539	50 %	50 %	0 %	0 %	11497024
57	NC_001903	AAGA	2	8	17604	17611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001903	ATAA	2	8	17950	17957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001903	ATAA	2	8	17975	17982	75 %	25 %	0 %	0 %	11497023
60	NC_001903	AATT	2	8	18178	18185	50 %	50 %	0 %	0 %	11497023
61	NC_001903	AATA	2	8	18257	18264	75 %	25 %	0 %	0 %	11497023
62	NC_001903	AAAT	2	8	18512	18519	75 %	25 %	0 %	0 %	11497023
63	NC_001903	TAAA	2	8	18787	18794	75 %	25 %	0 %	0 %	11497023
64	NC_001903	AATG	2	8	18806	18813	50 %	25 %	25 %	0 %	11497023
65	NC_001903	CCAA	2	8	18822	18829	50 %	0 %	0 %	50 %	11497023
66	NC_001903	ATTC	2	8	19028	19035	25 %	50 %	0 %	25 %	11497023
67	NC_001903	GATT	2	8	19311	19318	25 %	50 %	25 %	0 %	11497023
68	NC_001903	TATT	2	8	19371	19378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001903	ATAA	2	8	19440	19447	75 %	25 %	0 %	0 %	364556795
70	NC_001903	AAAT	2	8	19977	19984	75 %	25 %	0 %	0 %	364556795
71	NC_001903	TAAA	2	8	20252	20259	75 %	25 %	0 %	0 %	364556795
72	NC_001903	CCAA	2	8	20287	20294	50 %	0 %	0 %	50 %	364556795
73	NC_001903	AATT	2	8	21191	21198	50 %	50 %	0 %	0 %	11497034
74	NC_001903	TAAA	2	8	21461	21468	75 %	25 %	0 %	0 %	364556796
75	NC_001903	ACTA	2	8	21561	21568	50 %	25 %	0 %	25 %	364556796
76	NC_001903	AATT	2	8	21609	21616	50 %	50 %	0 %	0 %	364556796
77	NC_001903	ATGA	2	8	21898	21905	50 %	25 %	25 %	0 %	11497032
78	NC_001903	TAAA	2	8	22082	22089	75 %	25 %	0 %	0 %	11497032
79	NC_001903	TCTA	2	8	22191	22198	25 %	50 %	0 %	25 %	11497032
80	NC_001903	ATTT	2	8	22375	22382	25 %	75 %	0 %	0 %	11497032
81	NC_001903	TAAT	2	8	22394	22401	50 %	50 %	0 %	0 %	11497032
82	NC_001903	ATTT	2	8	22747	22754	25 %	75 %	0 %	0 %	11497031
83	NC_001903	TAAA	2	8	22871	22878	75 %	25 %	0 %	0 %	11497031
84	NC_001903	ATTT	2	8	23062	23069	25 %	75 %	0 %	0 %	11497031
85	NC_001903	TAAA	2	8	23195	23202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001903	CAAA	2	8	23657	23664	75 %	0 %	0 %	25 %	11497030
87	NC_001903	ATTT	2	8	24559	24566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001903	ATTA	2	8	24776	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001903	TAAT	3	12	24787	24798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001903	TACA	2	8	25182	25189	50 %	25 %	0 %	25 %	11497021
91	NC_001903	TCTT	2	8	25348	25355	0 %	75 %	0 %	25 %	11497021
92	NC_001903	ATTT	2	8	25469	25476	25 %	75 %	0 %	0 %	11497021
93	NC_001903	AAAT	2	8	25642	25649	75 %	25 %	0 %	0 %	11497021
94	NC_001903	TACA	2	8	26270	26277	50 %	25 %	0 %	25 %	11497021

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.