MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp26

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001903	CTTT	2	8	182	189	0 %	75 %	0 %	25 %	364556794
2	NC_001903	AAAT	2	8	621	628	75 %	25 %	0 %	0 %	11497029
3	NC_001903	AGAC	2	8	1310	1317	50 %	0 %	25 %	25 %	11497028
4	NC_001903	AATT	2	8	1445	1452	50 %	50 %	0 %	0 %	11497028
5	NC_001903	AATT	2	8	1685	1692	50 %	50 %	0 %	0 %	11497028
6	NC_001903	ACAA	2	8	1777	1784	75 %	0 %	0 %	25 %	11497028
7	NC_001903	TTTC	2	8	2075	2082	0 %	75 %	0 %	25 %	11497028
8	NC_001903	ATCA	2	8	4286	4293	50 %	25 %	0 %	25 %	11497018
9	NC_001903	AATG	2	8	4694	4701	50 %	25 %	25 %	0 %	364556792
10	NC_001903	CAAT	2	8	4723	4730	50 %	25 %	0 %	25 %	364556792
11	NC_001903	AAGG	2	8	4756	4763	50 %	0 %	50 %	0 %	364556792
12	NC_001903	GAAA	2	8	4771	4778	75 %	0 %	25 %	0 %	11497016
13	NC_001903	ATAA	2	8	5150	5157	75 %	25 %	0 %	0 %	11497016
14	NC_001903	GAAA	2	8	5347	5354	75 %	0 %	25 %	0 %	11497016
15	NC_001903	ATAA	2	8	5859	5866	75 %	25 %	0 %	0 %	11497016
16	NC_001903	ATCC	2	8	6727	6734	25 %	25 %	0 %	50 %	11497026
17	NC_001903	ACTA	2	8	7021	7028	50 %	25 %	0 %	25 %	11497026
18	NC_001903	ATTA	2	8	8063	8070	50 %	50 %	0 %	0 %	11497015
19	NC_001903	TACT	2	8	8111	8118	25 %	50 %	0 %	25 %	11497015
20	NC_001903	AATA	2	8	8123	8130	75 %	25 %	0 %	0 %	11497015
21	NC_001903	ATAC	2	8	8676	8683	50 %	25 %	0 %	25 %	11497015
22	NC_001903	CAAG	2	8	9410	9417	50 %	0 %	25 %	25 %	11497013
23	NC_001903	GAAA	2	8	9601	9608	75 %	0 %	25 %	0 %	11497013
24	NC_001903	TAAA	2	8	10111	10118	75 %	25 %	0 %	0 %	11497012
25	NC_001903	GAAA	2	8	10196	10203	75 %	0 %	25 %	0 %	11497012
26	NC_001903	AATT	2	8	10408	10415	50 %	50 %	0 %	0 %	11497012
27	NC_001903	AAAT	2	8	10619	10626	75 %	25 %	0 %	0 %	11497012
28	NC_001903	TCCA	2	8	11169	11176	25 %	25 %	0 %	50 %	11497011
29	NC_001903	TTTA	2	8	11286	11293	25 %	75 %	0 %	0 %	11497011
30	NC_001903	ATTT	2	8	13965	13972	25 %	75 %	0 %	0 %	11497009
31	NC_001903	TGCA	2	8	14702	14709	25 %	25 %	25 %	25 %	11497009
32	NC_001903	ATTA	2	8	15204	15211	50 %	50 %	0 %	0 %	364556791
33	NC_001903	TTCA	2	8	15576	15583	25 %	50 %	0 %	25 %	364556791
34	NC_001903	AATT	2	8	16082	16089	50 %	50 %	0 %	0 %	364556791
35	NC_001903	TGGA	2	8	16158	16165	25 %	25 %	50 %	0 %	364556791
36	NC_001903	TTTG	2	8	16293	16300	0 %	75 %	25 %	0 %	364556791
37	NC_001903	TGCT	2	8	17471	17478	0 %	50 %	25 %	25 %	11497024
38	NC_001903	TTAA	2	8	17532	17539	50 %	50 %	0 %	0 %	11497024
39	NC_001903	ATAA	2	8	17975	17982	75 %	25 %	0 %	0 %	11497023
40	NC_001903	AATT	2	8	18178	18185	50 %	50 %	0 %	0 %	11497023
41	NC_001903	AATA	2	8	18257	18264	75 %	25 %	0 %	0 %	11497023
42	NC_001903	AAAT	2	8	18512	18519	75 %	25 %	0 %	0 %	11497023
43	NC_001903	TAAA	2	8	18787	18794	75 %	25 %	0 %	0 %	11497023
44	NC_001903	AATG	2	8	18806	18813	50 %	25 %	25 %	0 %	11497023
45	NC_001903	CCAA	2	8	18822	18829	50 %	0 %	0 %	50 %	11497023
46	NC_001903	ATTC	2	8	19028	19035	25 %	50 %	0 %	25 %	11497023
47	NC_001903	GATT	2	8	19311	19318	25 %	50 %	25 %	0 %	11497023
48	NC_001903	ATAA	2	8	19440	19447	75 %	25 %	0 %	0 %	364556795
49	NC_001903	AAAT	2	8	19977	19984	75 %	25 %	0 %	0 %	364556795
50	NC_001903	TAAA	2	8	20252	20259	75 %	25 %	0 %	0 %	364556795
51	NC_001903	CCAA	2	8	20287	20294	50 %	0 %	0 %	50 %	364556795
52	NC_001903	AATT	2	8	21191	21198	50 %	50 %	0 %	0 %	11497034
53	NC_001903	TAAA	2	8	21461	21468	75 %	25 %	0 %	0 %	364556796
54	NC_001903	ACTA	2	8	21561	21568	50 %	25 %	0 %	25 %	364556796
55	NC_001903	AATT	2	8	21609	21616	50 %	50 %	0 %	0 %	364556796
56	NC_001903	ATGA	2	8	21898	21905	50 %	25 %	25 %	0 %	11497032
57	NC_001903	TAAA	2	8	22082	22089	75 %	25 %	0 %	0 %	11497032
58	NC_001903	TCTA	2	8	22191	22198	25 %	50 %	0 %	25 %	11497032
59	NC_001903	ATTT	2	8	22375	22382	25 %	75 %	0 %	0 %	11497032
60	NC_001903	TAAT	2	8	22394	22401	50 %	50 %	0 %	0 %	11497032
61	NC_001903	ATTT	2	8	22747	22754	25 %	75 %	0 %	0 %	11497031
62	NC_001903	TAAA	2	8	22871	22878	75 %	25 %	0 %	0 %	11497031
63	NC_001903	ATTT	2	8	23062	23069	25 %	75 %	0 %	0 %	11497031
64	NC_001903	CAAA	2	8	23657	23664	75 %	0 %	0 %	25 %	11497030
65	NC_001903	TACA	2	8	25182	25189	50 %	25 %	0 %	25 %	11497021
66	NC_001903	TCTT	2	8	25348	25355	0 %	75 %	0 %	25 %	11497021
67	NC_001903	ATTT	2	8	25469	25476	25 %	75 %	0 %	0 %	11497021
68	NC_001903	AAAT	2	8	25642	25649	75 %	25 %	0 %	0 %	11497021
69	NC_001903	TACA	2	8	26270	26277	50 %	25 %	0 %	25 %	11497021

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.