MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp26

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001903	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556794
2	NC_001903	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556794
3	NC_001903	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556794
4	NC_001903	ATT	2	6	222	227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556794
5	NC_001903	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556794
6	NC_001903	CTG	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497029
7	NC_001903	TTA	2	6	769	774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001903	ATT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
9	NC_001903	ATC	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497028
10	NC_001903	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497028
11	NC_001903	TAT	2	6	1139	1144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
12	NC_001903	GTT	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497028
13	NC_001903	AAT	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497028
14	NC_001903	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
15	NC_001903	TAT	2	6	1361	1366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
16	NC_001903	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497028
17	NC_001903	AAC	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497028
18	NC_001903	ATT	2	6	1500	1505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
19	NC_001903	GAC	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497028
20	NC_001903	ATT	2	6	1663	1668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
21	NC_001903	TCA	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497028
22	NC_001903	TTC	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497028
23	NC_001903	TAT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
24	NC_001903	ATT	2	6	1972	1977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
25	NC_001903	ATT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497028
26	NC_001903	ATA	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001903	TTA	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001903	ATA	2	6	2359	2364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001903	TAA	2	6	2517	2522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
30	NC_001903	AAT	3	9	2552	2560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
31	NC_001903	AAT	2	6	2656	2661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
32	NC_001903	CAA	2	6	2685	2690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556793
33	NC_001903	ATA	2	6	2762	2767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
34	NC_001903	CAT	2	6	2842	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556793
35	NC_001903	CAC	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556793
36	NC_001903	AAG	2	6	2992	2997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556793
37	NC_001903	AAT	2	6	3001	3006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
38	NC_001903	ATA	2	6	3036	3041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
39	NC_001903	ATT	2	6	3119	3124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556793
40	NC_001903	CAA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556793
41	NC_001903	CAG	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556793
42	NC_001903	AGC	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556793
43	NC_001903	AAT	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
44	NC_001903	AGC	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556793
45	NC_001903	TCC	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	364556793
46	NC_001903	ACA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556793
47	NC_001903	ATA	2	6	3542	3547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556793
48	NC_001903	AGT	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556793
49	NC_001903	TCC	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_001903	TAT	2	6	3856	3861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001903	TAA	2	6	3924	3929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001903	ATA	2	6	3952	3957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001903	TAA	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001903	ATT	2	6	3987	3992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001903	ATA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001903	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001903	AGA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497018
58	NC_001903	TGT	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497018
59	NC_001903	ATA	2	6	4279	4284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497018
60	NC_001903	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497018
61	NC_001903	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497018
62	NC_001903	TAC	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_001903	CAA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556792
64	NC_001903	GTT	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556792
65	NC_001903	GTT	2	6	4587	4592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556792
66	NC_001903	CAC	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556792
67	NC_001903	TAA	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556792
68	NC_001903	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556792
69	NC_001903	AAT	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556792
70	NC_001903	ATT	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
71	NC_001903	TAT	2	6	4954	4959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
72	NC_001903	ATT	2	6	5031	5036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
73	NC_001903	GAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497016
74	NC_001903	AAT	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
75	NC_001903	ACA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497016
76	NC_001903	ATT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
77	NC_001903	TTA	2	6	5310	5315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497016
78	NC_001903	TAA	2	6	5320	5325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
79	NC_001903	AGA	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497016
80	NC_001903	AAG	2	6	5355	5360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497016
81	NC_001903	AAG	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497016
82	NC_001903	AAT	2	6	5560	5565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
83	NC_001903	TAC	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497016
84	NC_001903	AAT	2	6	5642	5647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
85	NC_001903	TTC	2	6	5704	5709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497016
86	NC_001903	AAT	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
87	NC_001903	ATG	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497016
88	NC_001903	ATA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497016
89	NC_001903	TAA	2	6	5873	5878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001903	ATA	3	9	5921	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001903	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001903	ATT	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001903	GTC	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_001903	ATA	2	6	6075	6080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001903	TAA	2	6	6233	6238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001903	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001903	AAT	2	6	6313	6318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001903	TTA	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001903	TAA	2	6	6436	6441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001903	GAA	2	6	6447	6452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001903	TAA	2	6	6481	6486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001903	TAA	2	6	6594	6599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001903	ATT	2	6	6620	6625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001903	AAG	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497026
105	NC_001903	ATA	2	6	6803	6808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
106	NC_001903	ATA	2	6	6822	6827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
107	NC_001903	TCA	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497026
108	NC_001903	GAA	2	6	6941	6946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497026
109	NC_001903	ATT	2	6	6954	6959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497026
110	NC_001903	TAA	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
111	NC_001903	TAA	2	6	7129	7134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
112	NC_001903	ATA	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497026
113	NC_001903	ATT	2	6	7272	7277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497026
114	NC_001903	ATT	2	6	7303	7308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497026
115	NC_001903	ATT	2	6	7359	7364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497026
116	NC_001903	ATG	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497026
117	NC_001903	CCT	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497026
118	NC_001903	CTT	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497026
119	NC_001903	AAG	2	6	7662	7667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497026
120	NC_001903	CAA	2	6	7750	7755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_001903	CAA	2	6	7853	7858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497015
122	NC_001903	TAA	2	6	7868	7873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
123	NC_001903	AGT	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497015
124	NC_001903	ACT	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497015
125	NC_001903	TGT	2	6	7964	7969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497015
126	NC_001903	ATA	2	6	8235	8240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
127	NC_001903	GAA	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
128	NC_001903	TAA	2	6	8294	8299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
129	NC_001903	AGA	2	6	8337	8342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
130	NC_001903	AGA	2	6	8417	8422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
131	NC_001903	GAA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
132	NC_001903	GAA	2	6	8508	8513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497015
133	NC_001903	TAA	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
134	NC_001903	TAA	2	6	8725	8730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497015
135	NC_001903	ATA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001903	CAA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_001903	ATT	2	6	8841	8846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001903	TAA	3	9	8933	8941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_001903	TAA	2	6	17307	17312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497024
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277	NC_001903	TAA	2	6	17713	17718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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396	NC_001903	ATG	2	6	26193	26198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497021
397	NC_001903	GGA	2	6	26253	26258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497021
398	NC_001903	ATA	2	6	26263	26268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497021
399	NC_001903	GGA	2	6	26406	26411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497021
400	NC_001903	ATA	2	6	26419	26424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497021

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.