MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp26

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001903	AC	3	6	409	414	50 %	0 %	0 %	50 %	11497029
2	NC_001903	TA	3	6	758	763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001903	AT	3	6	801	806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001903	TA	3	6	882	887	50 %	50 %	0 %	0 %	11497028
5	NC_001903	AT	3	6	1028	1033	50 %	50 %	0 %	0 %	11497028
6	NC_001903	AT	3	6	1960	1965	50 %	50 %	0 %	0 %	11497028
7	NC_001903	TA	3	6	2257	2262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001903	TA	3	6	2274	2279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001903	CT	3	6	2423	2428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_001903	TC	3	6	3873	3878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_001903	AT	3	6	3971	3976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001903	AT	3	6	4001	4006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001903	AT	3	6	4029	4034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001903	TA	3	6	4097	4102	50 %	50 %	0 %	0 %	11497018
15	NC_001903	CA	3	6	4268	4273	50 %	0 %	0 %	50 %	11497018
16	NC_001903	AT	3	6	5807	5812	50 %	50 %	0 %	0 %	11497016
17	NC_001903	CT	3	6	5945	5950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_001903	AT	3	6	5981	5986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001903	AT	3	6	6545	6550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001903	TA	3	6	6650	6655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001903	AT	3	6	7150	7155	50 %	50 %	0 %	0 %	11497026
22	NC_001903	AT	3	6	7631	7636	50 %	50 %	0 %	0 %	11497026
23	NC_001903	CT	3	6	7952	7957	0 %	50 %	0 %	50 %	11497015
24	NC_001903	CA	3	6	8850	8855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_001903	AT	3	6	8926	8931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001903	AT	3	6	9438	9443	50 %	50 %	0 %	0 %	11497013
27	NC_001903	AT	4	8	9477	9484	50 %	50 %	0 %	0 %	11497013
28	NC_001903	AT	3	6	10361	10366	50 %	50 %	0 %	0 %	11497012
29	NC_001903	AT	3	6	10428	10433	50 %	50 %	0 %	0 %	11497012
30	NC_001903	TA	3	6	10724	10729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001903	TA	3	6	10736	10741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001903	AT	3	6	11581	11586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001903	AT	3	6	11957	11962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001903	AG	3	6	12973	12978	50 %	0 %	50 %	0 %	11497010
35	NC_001903	AT	3	6	13246	13251	50 %	50 %	0 %	0 %	11497010
36	NC_001903	GA	4	8	13418	13425	50 %	0 %	50 %	0 %	11497010
37	NC_001903	AT	3	6	13743	13748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001903	AT	3	6	15844	15849	50 %	50 %	0 %	0 %	364556791
39	NC_001903	TA	3	6	16668	16673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001903	AC	3	6	17325	17330	50 %	0 %	0 %	50 %	11497024
41	NC_001903	GA	3	6	18022	18027	50 %	0 %	50 %	0 %	11497023
42	NC_001903	AT	3	6	18218	18223	50 %	50 %	0 %	0 %	11497023
43	NC_001903	AT	3	6	18686	18691	50 %	50 %	0 %	0 %	11497023
44	NC_001903	AT	3	6	19400	19405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001903	AT	3	6	19683	19688	50 %	50 %	0 %	0 %	364556795
46	NC_001903	AT	3	6	20151	20156	50 %	50 %	0 %	0 %	364556795
47	NC_001903	AT	3	6	20680	20685	50 %	50 %	0 %	0 %	364556795
48	NC_001903	AT	3	6	21201	21206	50 %	50 %	0 %	0 %	11497034
49	NC_001903	AT	3	6	21592	21597	50 %	50 %	0 %	0 %	364556796
50	NC_001903	TA	3	6	21952	21957	50 %	50 %	0 %	0 %	11497032
51	NC_001903	AT	3	6	22071	22076	50 %	50 %	0 %	0 %	11497032
52	NC_001903	TA	4	8	22097	22104	50 %	50 %	0 %	0 %	11497032
53	NC_001903	TA	3	6	22624	22629	50 %	50 %	0 %	0 %	11497031
54	NC_001903	TA	3	6	22854	22859	50 %	50 %	0 %	0 %	11497031
55	NC_001903	TA	3	6	23589	23594	50 %	50 %	0 %	0 %	11497030
56	NC_001903	TC	3	6	25297	25302	0 %	50 %	0 %	50 %	11497021
57	NC_001903	AT	3	6	25675	25680	50 %	50 %	0 %	0 %	11497021
58	NC_001903	TA	3	6	25937	25942	50 %	50 %	0 %	0 %	11497021
59	NC_001903	AC	3	6	25974	25979	50 %	0 %	0 %	50 %	11497021

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.