MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	GAAAA	2	10	1031	1040	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001880	AAATA	2	10	1675	1684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001880	AAAGG	2	10	5486	5495	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001880	CCTTC	2	10	10340	10349	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_001880	CCAGA	2	10	13802	13811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_001880	TTCCT	2	10	14445	14454	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_001880	AGGAA	2	10	14762	14771	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001880	GGCTT	2	10	14837	14846	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_001880	TTTAA	2	10	17443	17452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001880	TTTAT	2	10	20426	20435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001880	CATAT	2	10	22658	22667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_001880	TAATA	2	10	28313	28322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001880	AAAAG	2	10	29281	29290	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001880	CTCTT	2	10	29398	29407	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_001880	ACTTA	2	10	29707	29716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.