MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	AGGAA	2	10	2752	2761	60 %	0 %	40 %	0 %	10957045
2	NC_001880	TTTCC	2	10	4698	4707	0 %	60 %	0 %	40 %	10957046
3	NC_001880	AGTGG	2	10	4863	4872	20 %	20 %	60 %	0 %	10957046
4	NC_001880	TGGAG	2	10	7771	7780	20 %	20 %	60 %	0 %	10957048
5	NC_001880	GAAGA	2	10	8926	8935	60 %	0 %	40 %	0 %	10957049
6	NC_001880	CAACA	2	10	12650	12659	60 %	0 %	0 %	40 %	10957052
7	NC_001880	TTCTG	2	10	13000	13009	0 %	60 %	20 %	20 %	10957053
8	NC_001880	TGAGA	2	10	13264	13273	40 %	20 %	40 %	0 %	10957053
9	NC_001880	AGCAG	2	10	17680	17689	40 %	0 %	40 %	20 %	10957056
10	NC_001880	GATTT	2	10	18189	18198	20 %	60 %	20 %	0 %	10957056
11	NC_001880	ACAGG	2	10	18777	18786	40 %	0 %	40 %	20 %	10957057
12	NC_001880	ATTTT	2	10	18911	18920	20 %	80 %	0 %	0 %	10957058
13	NC_001880	CTTTT	2	10	19659	19668	0 %	80 %	0 %	20 %	10957058
14	NC_001880	CTTTT	2	10	21736	21745	0 %	80 %	0 %	20 %	10957060
15	NC_001880	AGGTA	2	10	24489	24498	40 %	20 %	40 %	0 %	10957061
16	NC_001880	TAGTA	2	10	25498	25507	40 %	40 %	20 %	0 %	10957062
17	NC_001880	TTTTC	2	10	26621	26630	0 %	80 %	0 %	20 %	10957064
18	NC_001880	CCTGG	2	10	27025	27034	0 %	20 %	40 %	40 %	10957064
19	NC_001880	TGAAG	2	10	27649	27658	40 %	20 %	40 %	0 %	10957065
20	NC_001880	GAAAG	2	10	35275	35284	60 %	0 %	40 %	0 %	10957071

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.