MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	GAAA	2	8	3764	3771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001880	TTAT	3	12	5406	5417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001880	TTTC	2	8	7106	7113	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_001880	AGAA	2	8	7172	7179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001880	TCTT	2	8	7243	7250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_001880	GAAG	2	8	8001	8008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001880	CTTA	2	8	9761	9768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_001880	AGGT	2	8	10829	10836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001880	ATTC	2	8	11661	11668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_001880	TATC	2	8	13817	13824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_001880	TGAC	2	8	14557	14564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_001880	GGCT	2	8	14596	14603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_001880	CATA	2	8	15233	15240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_001880	GGAA	2	8	15314	15321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001880	GCCC	2	8	15437	15444	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_001880	TACA	2	8	16032	16039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_001880	TTTA	2	8	16124	16131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001880	CGGA	2	8	16216	16223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_001880	ACTA	2	8	16317	16324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_001880	TAAA	3	12	17520	17531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001880	AAAG	2	8	17537	17544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001880	AAAC	2	8	18215	18222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_001880	TTTC	2	8	18225	18232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_001880	GAGG	2	8	18838	18845	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001880	TAAA	2	8	20238	20245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001880	TACC	2	8	21319	21326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_001880	TTAC	2	8	21356	21363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_001880	TGTT	2	8	21427	21434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001880	TTTC	2	8	21533	21540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_001880	TCTA	2	8	22519	22526	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_001880	CAAA	2	8	22715	22722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_001880	TTAT	2	8	22980	22987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001880	GTAA	2	8	23490	23497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001880	ATAA	2	8	23893	23900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001880	GTTT	2	8	23978	23985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001880	GTAA	2	8	24153	24160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001880	ACTT	2	8	26257	26264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_001880	TTTA	2	8	26304	26311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001880	CTTT	2	8	29484	29491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_001880	CCTT	2	8	29575	29582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_001880	CCTT	2	8	31020	31027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_001880	TTAT	2	8	31851	31858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001880	CTAA	2	8	31886	31893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_001880	TTAG	2	8	32002	32009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001880	TCCA	2	8	32950	32957	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_001880	CTTC	2	8	33058	33065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_001880	AGGT	2	8	33165	33172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001880	TATT	2	8	33185	33192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001880	AAGA	2	8	35144	35151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001880	ATAG	2	8	36977	36984	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001880	TAAG	2	8	38143	38150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001880	AAAT	2	8	38875	38882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001880	TTCT	2	8	39076	39083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_001880	GGGA	2	8	39288	39295	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.