MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	GTC	2	6	78	83	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_001880	CTC	2	6	95	100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957042
3	NC_001880	CCG	2	6	167	172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957042
4	NC_001880	TTA	2	6	249	254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957042
5	NC_001880	CTT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_001880	AAG	2	6	533	538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001880	CTT	2	6	556	561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_001880	AGA	2	6	609	614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001880	CAC	2	6	769	774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_001880	ATA	2	6	785	790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001880	TCA	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_001880	GTT	2	6	821	826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001880	GAA	2	6	941	946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001880	AGA	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001880	AGA	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001880	CAA	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_001880	TAG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957043
18	NC_001880	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957043
19	NC_001880	AAG	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957043
20	NC_001880	TCT	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957043
21	NC_001880	TTA	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957043
22	NC_001880	TAT	2	6	1293	1298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957043
23	NC_001880	TTA	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001880	TTC	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957044
25	NC_001880	TAG	2	6	1856	1861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957044
26	NC_001880	AAG	2	6	2001	2006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957044
27	NC_001880	GAA	2	6	2071	2076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957044
28	NC_001880	CTC	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957044
29	NC_001880	TAG	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957044
30	NC_001880	GAC	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957044
31	NC_001880	GAA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001880	TAA	2	6	2321	2326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957045
33	NC_001880	TAC	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957045
34	NC_001880	AGA	2	6	2381	2386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
35	NC_001880	TAA	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957045
36	NC_001880	GAG	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957045
37	NC_001880	GAA	2	6	2565	2570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
38	NC_001880	TAG	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957045
39	NC_001880	AAG	2	6	2767	2772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
40	NC_001880	AGA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
41	NC_001880	AAG	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
42	NC_001880	GTT	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957045
43	NC_001880	AAG	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
44	NC_001880	CAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957045
45	NC_001880	TTC	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957045
46	NC_001880	TCA	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_001880	TTC	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_001880	AGA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001880	AAG	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001880	CTC	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_001880	TTG	2	6	3795	3800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001880	AAG	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001880	GAC	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957046
54	NC_001880	GAA	3	9	4188	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
55	NC_001880	TCT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957046
56	NC_001880	CAA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957046
57	NC_001880	AAG	2	6	4340	4345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
58	NC_001880	AAG	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
59	NC_001880	AAG	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
60	NC_001880	AGA	2	6	4587	4592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
61	NC_001880	AAG	2	6	4618	4623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
62	NC_001880	ATA	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957046
63	NC_001880	GAA	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
64	NC_001880	GAA	2	6	4762	4767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
65	NC_001880	CTT	2	6	4780	4785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957046
66	NC_001880	GAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
67	NC_001880	AAG	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
68	NC_001880	TTG	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957046
69	NC_001880	ACT	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957046
70	NC_001880	GAC	2	6	5127	5132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_001880	GAA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001880	GAA	2	6	5323	5328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001880	GAA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001880	GAA	3	9	5422	5430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001880	TAA	2	6	5530	5535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001880	TGG	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001880	ATA	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001880	ATT	2	6	5678	5683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001880	AGG	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001880	TCT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_001880	AAG	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001880	AAT	2	6	5873	5878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957047
83	NC_001880	TCT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957047
84	NC_001880	ATT	2	6	5974	5979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957047
85	NC_001880	TCT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957047
86	NC_001880	AAG	2	6	6079	6084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
87	NC_001880	AAG	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
88	NC_001880	AGA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
89	NC_001880	TAC	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957047
90	NC_001880	GAA	2	6	6384	6389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
91	NC_001880	GAA	2	6	6393	6398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
92	NC_001880	ACT	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957047
93	NC_001880	ACT	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_001880	TAC	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_001880	TTC	2	6	7006	7011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_001880	AAG	2	6	7274	7279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001880	GTT	2	6	7311	7316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001880	TTG	2	6	7352	7357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001880	GAA	2	6	7502	7507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957048
100	NC_001880	CTT	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957048
101	NC_001880	CTT	2	6	7598	7603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957048
102	NC_001880	GAA	2	6	7625	7630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957048
103	NC_001880	AAG	2	6	7651	7656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957048
104	NC_001880	AGA	2	6	7664	7669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957048
105	NC_001880	CTT	2	6	7699	7704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957048
106	NC_001880	GAG	2	6	7860	7865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957048
107	NC_001880	ATT	2	6	8036	8041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001880	AGT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001880	TTC	2	6	8131	8136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_001880	AGT	2	6	8191	8196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001880	TTA	2	6	8260	8265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001880	TTC	2	6	8270	8275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_001880	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001880	TGT	2	6	8507	8512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001880	ACA	2	6	8543	8548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_001880	GTT	2	6	8696	8701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001880	ATT	2	6	8761	8766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001880	GAA	2	6	8867	8872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
119	NC_001880	TAA	2	6	9077	9082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957049
120	NC_001880	AAG	2	6	9207	9212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
121	NC_001880	CTT	2	6	9253	9258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957049
122	NC_001880	GAA	3	9	9289	9297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
123	NC_001880	AGA	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
124	NC_001880	GAA	2	6	9550	9555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
125	NC_001880	GAA	2	6	9624	9629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
126	NC_001880	AAG	2	6	9692	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957049
127	NC_001880	CTA	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_001880	ATG	2	6	10011	10016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001880	AGA	2	6	10034	10039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001880	ATT	2	6	10048	10053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001880	AGT	2	6	10105	10110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001880	GAG	2	6	10158	10163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001880	AAG	2	6	10200	10205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001880	GAG	2	6	10329	10334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001880	TGT	2	6	10358	10363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001880	AGG	2	6	10408	10413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957050
137	NC_001880	AGA	2	6	10444	10449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957050
138	NC_001880	AAG	2	6	10519	10524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957050
139	NC_001880	TTG	2	6	10536	10541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957050
140	NC_001880	CTT	2	6	10615	10620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957050
141	NC_001880	GAA	2	6	10737	10742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957050
142	NC_001880	GAA	2	6	10983	10988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001880	TTA	2	6	11003	11008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_001880	CTT	2	6	11510	11515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_001880	TCC	2	6	11533	11538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_001880	AAG	2	6	11556	11561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001880	CTT	2	6	11574	11579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_001880	CCT	2	6	11605	11610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_001880	GTA	2	6	11703	11708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_001880	AAG	2	6	12934	12939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_001880	ATT	2	6	20387	20392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_001880	AAT	2	6	20411	20416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_001880	CAC	2	6	20466	20471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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271	NC_001880	TTC	2	6	20542	20547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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