MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	GTC	2	6	78	83	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_001880	CTT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_001880	AAG	2	6	533	538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001880	CTT	2	6	556	561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_001880	AGA	2	6	609	614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001880	CAC	2	6	769	774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_001880	ATA	2	6	785	790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001880	TCA	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_001880	GTT	2	6	821	826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001880	GAA	2	6	941	946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001880	AGA	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001880	AGA	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001880	CAA	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_001880	TTA	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001880	GAA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001880	TCA	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_001880	TTC	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_001880	AGA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001880	AAG	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001880	CTC	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_001880	TTG	2	6	3795	3800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001880	AAG	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001880	GAC	2	6	5127	5132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_001880	GAA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001880	GAA	2	6	5323	5328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001880	GAA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001880	GAA	3	9	5422	5430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001880	TAA	2	6	5530	5535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001880	TGG	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001880	ATA	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001880	ATT	2	6	5678	5683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001880	AGG	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001880	TCT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_001880	AAG	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001880	ACT	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_001880	TAC	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_001880	TTC	2	6	7006	7011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_001880	AAG	2	6	7274	7279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001880	GTT	2	6	7311	7316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001880	TTG	2	6	7352	7357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001880	ATT	2	6	8036	8041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001880	AGT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001880	TTC	2	6	8131	8136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_001880	AGT	2	6	8191	8196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001880	TTA	2	6	8260	8265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001880	TTC	2	6	8270	8275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_001880	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001880	TGT	2	6	8507	8512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001880	ACA	2	6	8543	8548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_001880	GTT	2	6	8696	8701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001880	ATT	2	6	8761	8766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001880	CTA	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_001880	ATG	2	6	10011	10016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001880	AGA	2	6	10034	10039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001880	ATT	2	6	10048	10053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001880	AGT	2	6	10105	10110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001880	GAG	2	6	10158	10163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001880	AAG	2	6	10200	10205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001880	GAG	2	6	10329	10334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001880	TGT	2	6	10358	10363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001880	GAA	2	6	10983	10988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001880	TTA	2	6	11003	11008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001880	AAG	2	6	11430	11435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001880	CCT	2	6	11441	11446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_001880	CTT	2	6	11510	11515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_001880	TCC	2	6	11533	11538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_001880	AAG	2	6	11556	11561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001880	CTT	2	6	11574	11579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_001880	CCT	2	6	11605	11610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_001880	GTA	2	6	11703	11708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001880	TAA	2	6	12886	12891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001880	AAG	2	6	12934	12939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001880	AAG	2	6	13692	13697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001880	TGT	2	6	13770	13775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001880	ACA	2	6	13793	13798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_001880	TAT	2	6	13938	13943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001880	TTA	2	6	14015	14020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001880	TGT	2	6	14068	14073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001880	CTT	2	6	14178	14183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_001880	AAT	2	6	14208	14213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001880	ATG	2	6	14228	14233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001880	AGA	2	6	14310	14315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001880	AAG	2	6	14341	14346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001880	GTT	2	6	14437	14442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001880	CTA	2	6	14573	14578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_001880	TGA	2	6	14753	14758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001880	CAC	2	6	14822	14827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_001880	CTT	2	6	14851	14856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_001880	TGA	2	6	14877	14882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001880	GTT	2	6	14943	14948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001880	AGG	2	6	15209	15214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001880	GAT	2	6	15352	15357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001880	CTA	2	6	15522	15527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_001880	CTC	2	6	16013	16018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_001880	TTC	2	6	16069	16074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_001880	CTG	2	6	16085	16090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_001880	TCC	2	6	16108	16113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_001880	AAG	2	6	16234	16239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001880	CTG	2	6	16264	16269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_001880	CTT	2	6	16291	16296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_001880	TAA	2	6	16341	16346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001880	ATT	2	6	16355	16360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001880	ATA	2	6	16367	16372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001880	AGT	2	6	16455	16460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001880	AGG	2	6	18269	18274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001880	TCT	2	6	18808	18813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_001880	TCT	2	6	18832	18837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_001880	GAT	2	6	20146	20151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001880	TCT	2	6	20190	20195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_001880	CCT	2	6	20307	20312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_001880	TAT	2	6	20313	20318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001880	TCT	2	6	20345	20350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_001880	TAA	2	6	20379	20384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001880	ATT	2	6	20387	20392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001880	AAT	2	6	20411	20416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001880	CAC	2	6	20466	20471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_001880	AAG	2	6	20503	20508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001880	TTC	2	6	20542	20547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_001880	TCA	2	6	20602	20607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_001880	AAG	2	6	20611	20616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001880	CTT	2	6	20717	20722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_001880	AAG	2	6	20771	20776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001880	TTA	2	6	20799	20804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001880	TAG	2	6	20893	20898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001880	GAA	2	6	20924	20929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001880	TTA	2	6	20992	20997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001880	CTC	2	6	21003	21008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_001880	TCT	2	6	21137	21142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_001880	TCC	2	6	21178	21183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_001880	ATT	2	6	21203	21208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001880	TAA	2	6	21250	21255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001880	CAG	2	6	21267	21272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_001880	TAC	2	6	21335	21340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_001880	TTC	2	6	21507	21512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_001880	TTC	2	6	21543	21548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_001880	TAA	2	6	21630	21635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001880	ATT	2	6	21681	21686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001880	CTT	2	6	22442	22447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_001880	GAA	2	6	22707	22712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001880	AAG	2	6	22815	22820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001880	GAA	3	9	22935	22943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001880	AAC	2	6	22962	22967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_001880	TTA	2	6	23009	23014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001880	TTA	2	6	23103	23108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001880	AAG	2	6	23130	23135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_001880	AAG	2	6	23406	23411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001880	CAT	2	6	23419	23424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_001880	TCC	2	6	23434	23439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_001880	AAG	2	6	23469	23474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_001880	TTA	2	6	24016	24021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_001880	CCT	2	6	24216	24221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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167	NC_001880	TAC	2	6	25568	25573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_001880	TTA	2	6	25663	25668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_001880	TAA	2	6	29802	29807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_001880	TAA	2	6	31966	31971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_001880	TTA	2	6	31981	31986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.