MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	TC	3	6	99	104	0 %	50 %	0 %	50 %	10957042
2	NC_001880	CA	3	6	274	279	50 %	0 %	0 %	50 %	10957042
3	NC_001880	GA	3	6	284	289	50 %	0 %	50 %	0 %	10957042
4	NC_001880	AT	3	6	448	453	50 %	50 %	0 %	0 %	10957042
5	NC_001880	GA	3	6	1554	1559	50 %	0 %	50 %	0 %	10957043
6	NC_001880	CA	3	6	1944	1949	50 %	0 %	0 %	50 %	10957044
7	NC_001880	GA	3	6	2815	2820	50 %	0 %	50 %	0 %	10957045
8	NC_001880	GA	3	6	2912	2917	50 %	0 %	50 %	0 %	10957045
9	NC_001880	TC	3	6	2921	2926	0 %	50 %	0 %	50 %	10957045
10	NC_001880	AG	3	6	4413	4418	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
11	NC_001880	GA	3	6	4773	4778	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
12	NC_001880	GA	3	6	6444	6449	50 %	0 %	50 %	0 %	10957047
13	NC_001880	AG	3	6	7409	7414	50 %	0 %	50 %	0 %	10957048
14	NC_001880	AG	3	6	7779	7784	50 %	0 %	50 %	0 %	10957048
15	NC_001880	TC	3	6	9640	9645	0 %	50 %	0 %	50 %	10957049
16	NC_001880	TA	3	6	11122	11127	50 %	50 %	0 %	0 %	10957051
17	NC_001880	AT	3	6	11189	11194	50 %	50 %	0 %	0 %	10957051
18	NC_001880	GA	3	6	16632	16637	50 %	0 %	50 %	0 %	10957055
19	NC_001880	CT	3	6	16667	16672	0 %	50 %	0 %	50 %	10957055
20	NC_001880	AT	3	6	17227	17232	50 %	50 %	0 %	0 %	10957055
21	NC_001880	AG	3	6	19071	19076	50 %	0 %	50 %	0 %	10957058
22	NC_001880	CA	3	6	20005	20010	50 %	0 %	0 %	50 %	10957059
23	NC_001880	CT	4	8	22304	22311	0 %	50 %	0 %	50 %	10957060
24	NC_001880	AG	3	6	24278	24283	50 %	0 %	50 %	0 %	10957061
25	NC_001880	AG	3	6	24660	24665	50 %	0 %	50 %	0 %	10957061
26	NC_001880	TA	3	6	25208	25213	50 %	50 %	0 %	0 %	10957062
27	NC_001880	AG	3	6	26033	26038	50 %	0 %	50 %	0 %	10957063
28	NC_001880	AT	3	6	26519	26524	50 %	50 %	0 %	0 %	10957064
29	NC_001880	GA	3	6	26611	26616	50 %	0 %	50 %	0 %	10957064
30	NC_001880	CT	3	6	26805	26810	0 %	50 %	0 %	50 %	10957064
31	NC_001880	AG	3	6	26984	26989	50 %	0 %	50 %	0 %	10957064
32	NC_001880	TA	3	6	27154	27159	50 %	50 %	0 %	0 %	10957065
33	NC_001880	TC	3	6	27383	27388	0 %	50 %	0 %	50 %	10957065
34	NC_001880	AT	3	6	27474	27479	50 %	50 %	0 %	0 %	10957065
35	NC_001880	AT	3	6	28932	28937	50 %	50 %	0 %	0 %	10957066
36	NC_001880	CT	3	6	30190	30195	0 %	50 %	0 %	50 %	10957067
37	NC_001880	CT	3	6	30881	30886	0 %	50 %	0 %	50 %	10957067
38	NC_001880	TC	3	6	31377	31382	0 %	50 %	0 %	50 %	10957068
39	NC_001880	TA	3	6	31436	31441	50 %	50 %	0 %	0 %	10957068
40	NC_001880	GA	3	6	31763	31768	50 %	0 %	50 %	0 %	10957068
41	NC_001880	GA	3	6	33237	33242	50 %	0 %	50 %	0 %	10957069
42	NC_001880	GA	3	6	33488	33493	50 %	0 %	50 %	0 %	10957069
43	NC_001880	AG	3	6	34438	34443	50 %	0 %	50 %	0 %	10957070
44	NC_001880	AT	3	6	34446	34451	50 %	50 %	0 %	0 %	10957070
45	NC_001880	GA	3	6	34461	34466	50 %	0 %	50 %	0 %	10957070
46	NC_001880	TG	3	6	35827	35832	0 %	50 %	50 %	0 %	10957071

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.