MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	T	6	6	318	323	0 %	100 %	0 %	0 %	10957042
2	NC_001880	A	7	7	931	937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001880	A	6	6	1069	1074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001880	A	6	6	1466	1471	100 %	0 %	0 %	0 %	10957043
5	NC_001880	A	7	7	1653	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001880	A	6	6	1764	1769	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
7	NC_001880	A	6	6	1834	1839	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
8	NC_001880	A	6	6	2058	2063	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
9	NC_001880	A	7	7	2388	2394	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
10	NC_001880	A	6	6	2471	2476	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
11	NC_001880	A	6	6	2623	2628	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
12	NC_001880	A	7	7	3505	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001880	A	7	7	3552	3558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001880	A	7	7	3589	3595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001880	T	7	7	3985	3991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001880	A	6	6	4686	4691	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
17	NC_001880	A	6	6	4799	4804	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
18	NC_001880	A	6	6	4838	4843	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
19	NC_001880	A	6	6	4946	4951	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
20	NC_001880	A	9	9	5089	5097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001880	A	6	6	5137	5142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001880	A	7	7	5446	5452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001880	A	6	6	6507	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	10957047
24	NC_001880	T	6	6	6879	6884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001880	T	6	6	8310	8315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001880	A	6	6	9032	9037	100 %	0 %	0 %	0 %	10957049
27	NC_001880	T	6	6	9420	9425	0 %	100 %	0 %	0 %	10957049
28	NC_001880	A	6	6	11774	11779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001880	T	6	6	14496	14501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001880	A	6	6	16156	16161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001880	T	6	6	16783	16788	0 %	100 %	0 %	0 %	10957055
32	NC_001880	T	6	6	16917	16922	0 %	100 %	0 %	0 %	10957055
33	NC_001880	T	7	7	16990	16996	0 %	100 %	0 %	0 %	10957055
34	NC_001880	A	6	6	17529	17534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001880	A	6	6	17550	17555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001880	A	7	7	17588	17594	100 %	0 %	0 %	0 %	10957056
37	NC_001880	A	6	6	17942	17947	100 %	0 %	0 %	0 %	10957056
38	NC_001880	A	7	7	18162	18168	100 %	0 %	0 %	0 %	10957056
39	NC_001880	A	6	6	18256	18261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001880	A	6	6	18369	18374	100 %	0 %	0 %	0 %	10957057
41	NC_001880	A	6	6	18709	18714	100 %	0 %	0 %	0 %	10957057
42	NC_001880	A	7	7	18768	18774	100 %	0 %	0 %	0 %	10957057
43	NC_001880	T	6	6	19047	19052	0 %	100 %	0 %	0 %	10957058
44	NC_001880	A	6	6	19338	19343	100 %	0 %	0 %	0 %	10957058
45	NC_001880	T	7	7	19988	19994	0 %	100 %	0 %	0 %	10957059
46	NC_001880	T	8	8	21861	21868	0 %	100 %	0 %	0 %	10957060
47	NC_001880	T	7	7	22023	22029	0 %	100 %	0 %	0 %	10957060
48	NC_001880	A	7	7	22061	22067	100 %	0 %	0 %	0 %	10957060
49	NC_001880	A	6	6	22193	22198	100 %	0 %	0 %	0 %	10957060
50	NC_001880	T	6	6	22416	22421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001880	T	6	6	22431	22436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001880	A	6	6	22720	22725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001880	A	6	6	22750	22755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001880	T	6	6	22915	22920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001880	T	7	7	23962	23968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001880	T	6	6	24110	24115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001880	T	6	6	24701	24706	0 %	100 %	0 %	0 %	10957061
58	NC_001880	T	6	6	24988	24993	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
59	NC_001880	A	6	6	25288	25293	100 %	0 %	0 %	0 %	10957062
60	NC_001880	T	7	7	25442	25448	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
61	NC_001880	T	6	6	25524	25529	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
62	NC_001880	T	6	6	25641	25646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001880	A	8	8	25745	25752	100 %	0 %	0 %	0 %	10957063
64	NC_001880	A	6	6	26166	26171	100 %	0 %	0 %	0 %	10957063
65	NC_001880	T	6	6	27423	27428	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
66	NC_001880	A	6	6	27600	27605	100 %	0 %	0 %	0 %	10957065
67	NC_001880	A	6	6	27667	27672	100 %	0 %	0 %	0 %	10957065
68	NC_001880	T	6	6	27864	27869	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
69	NC_001880	T	6	6	27886	27891	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
70	NC_001880	T	7	7	28708	28714	0 %	100 %	0 %	0 %	10957066
71	NC_001880	A	7	7	29027	29033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001880	T	6	6	29124	29129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001880	T	6	6	29157	29162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001880	T	6	6	29260	29265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001880	A	6	6	29590	29595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001880	T	6	6	29883	29888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001880	A	7	7	29959	29965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001880	A	7	7	30022	30028	100 %	0 %	0 %	0 %	10957067
79	NC_001880	A	6	6	30090	30095	100 %	0 %	0 %	0 %	10957067
80	NC_001880	A	7	7	30260	30266	100 %	0 %	0 %	0 %	10957067
81	NC_001880	A	6	6	30551	30556	100 %	0 %	0 %	0 %	10957067
82	NC_001880	T	7	7	31145	31151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001880	T	6	6	31265	31270	0 %	100 %	0 %	0 %	10957068
84	NC_001880	A	6	6	32284	32289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001880	T	7	7	32301	32307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001880	A	6	6	32499	32504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001880	A	6	6	32556	32561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001880	T	7	7	32566	32572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001880	T	6	6	32666	32671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001880	A	6	6	33024	33029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001880	A	7	7	33320	33326	100 %	0 %	0 %	0 %	10957069
92	NC_001880	A	6	6	35211	35216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001880	T	6	6	35559	35564	0 %	100 %	0 %	0 %	10957071
94	NC_001880	T	6	6	35742	35747	0 %	100 %	0 %	0 %	10957071
95	NC_001880	T	6	6	35920	35925	0 %	100 %	0 %	0 %	10957071
96	NC_001880	T	6	6	36526	36531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001880	A	6	6	37056	37061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001880	T	6	6	38040	38045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001880	T	6	6	39272	39277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001880	T	6	6	39410	39415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.