MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	T	6	6	318	323	0 %	100 %	0 %	0 %	10957042
2	NC_001880	A	6	6	1466	1471	100 %	0 %	0 %	0 %	10957043
3	NC_001880	A	6	6	1764	1769	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
4	NC_001880	A	6	6	1834	1839	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
5	NC_001880	A	6	6	2058	2063	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
6	NC_001880	A	7	7	2388	2394	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
7	NC_001880	A	6	6	2471	2476	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
8	NC_001880	A	6	6	2623	2628	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
9	NC_001880	A	6	6	4686	4691	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
10	NC_001880	A	6	6	4799	4804	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
11	NC_001880	A	6	6	4838	4843	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
12	NC_001880	A	6	6	4946	4951	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
13	NC_001880	A	6	6	6507	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	10957047
14	NC_001880	A	6	6	9032	9037	100 %	0 %	0 %	0 %	10957049
15	NC_001880	T	6	6	9420	9425	0 %	100 %	0 %	0 %	10957049
16	NC_001880	T	6	6	16783	16788	0 %	100 %	0 %	0 %	10957055
17	NC_001880	T	6	6	16917	16922	0 %	100 %	0 %	0 %	10957055
18	NC_001880	T	7	7	16990	16996	0 %	100 %	0 %	0 %	10957055
19	NC_001880	A	7	7	17588	17594	100 %	0 %	0 %	0 %	10957056
20	NC_001880	A	6	6	17942	17947	100 %	0 %	0 %	0 %	10957056
21	NC_001880	A	7	7	18162	18168	100 %	0 %	0 %	0 %	10957056
22	NC_001880	A	6	6	18369	18374	100 %	0 %	0 %	0 %	10957057
23	NC_001880	A	6	6	18709	18714	100 %	0 %	0 %	0 %	10957057
24	NC_001880	A	7	7	18768	18774	100 %	0 %	0 %	0 %	10957057
25	NC_001880	T	6	6	19047	19052	0 %	100 %	0 %	0 %	10957058
26	NC_001880	A	6	6	19338	19343	100 %	0 %	0 %	0 %	10957058
27	NC_001880	T	7	7	19988	19994	0 %	100 %	0 %	0 %	10957059
28	NC_001880	T	8	8	21861	21868	0 %	100 %	0 %	0 %	10957060
29	NC_001880	T	7	7	22023	22029	0 %	100 %	0 %	0 %	10957060
30	NC_001880	A	7	7	22061	22067	100 %	0 %	0 %	0 %	10957060
31	NC_001880	A	6	6	22193	22198	100 %	0 %	0 %	0 %	10957060
32	NC_001880	T	6	6	24701	24706	0 %	100 %	0 %	0 %	10957061
33	NC_001880	T	6	6	24988	24993	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
34	NC_001880	A	6	6	25288	25293	100 %	0 %	0 %	0 %	10957062
35	NC_001880	T	7	7	25442	25448	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
36	NC_001880	T	6	6	25524	25529	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
37	NC_001880	A	8	8	25745	25752	100 %	0 %	0 %	0 %	10957063
38	NC_001880	A	6	6	26166	26171	100 %	0 %	0 %	0 %	10957063
39	NC_001880	T	6	6	27423	27428	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
40	NC_001880	A	6	6	27600	27605	100 %	0 %	0 %	0 %	10957065
41	NC_001880	A	6	6	27667	27672	100 %	0 %	0 %	0 %	10957065
42	NC_001880	T	6	6	27864	27869	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
43	NC_001880	T	6	6	27886	27891	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
44	NC_001880	T	7	7	28708	28714	0 %	100 %	0 %	0 %	10957066
45	NC_001880	A	7	7	30022	30028	100 %	0 %	0 %	0 %	10957067
46	NC_001880	A	6	6	30090	30095	100 %	0 %	0 %	0 %	10957067
47	NC_001880	A	7	7	30260	30266	100 %	0 %	0 %	0 %	10957067
48	NC_001880	A	6	6	30551	30556	100 %	0 %	0 %	0 %	10957067
49	NC_001880	T	6	6	31265	31270	0 %	100 %	0 %	0 %	10957068
50	NC_001880	A	7	7	33320	33326	100 %	0 %	0 %	0 %	10957069
51	NC_001880	T	6	6	35559	35564	0 %	100 %	0 %	0 %	10957071
52	NC_001880	T	6	6	35742	35747	0 %	100 %	0 %	0 %	10957071
53	NC_001880	T	6	6	35920	35925	0 %	100 %	0 %	0 %	10957071

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.