MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001869	GTTAC	2	10	59	68	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_001869	AGTAA	2	10	8723	8732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001869	CGCTG	2	10	9064	9073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_001869	AAATG	2	10	9076	9085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001869	CGCTT	2	10	13613	13622	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_001869	TCGAG	2	10	32976	32985	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_001869	AACAG	2	10	33379	33388	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_001869	GTCCG	2	10	34335	34344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_001869	GAACT	2	10	70880	70889	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_001869	GAAGA	2	10	74706	74715	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001869	AGTTC	2	10	74975	74984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_001869	AAGCG	2	10	82419	82428	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_001869	TCAGG	2	10	92275	92284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_001869	GTGAG	2	10	97007	97016	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001869	ATCGA	2	10	102373	102382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_001869	TCGAG	2	10	106503	106512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_001869	AACAG	2	10	106906	106915	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_001869	GGGGT	2	10	114892	114901	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001869	CGACG	2	10	124121	124130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_001869	ACGAA	2	10	128037	128046	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_001869	AGAAC	2	10	141369	141378	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_001869	CGGCG	2	10	142831	142840	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_001869	TCGAT	2	10	142970	142979	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_001869	GGGCC	2	10	148026	148035	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_001869	CTCCG	2	10	148059	148068	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_001869	TCGCT	2	10	148072	148081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_001869	GAAGA	2	10	150306	150315	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001869	AGTTC	2	10	150575	150584	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_001869	TCGAG	2	10	151809	151818	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_001869	GAACT	2	10	153729	153738	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_001869	TCTGT	2	10	190000	190009	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_001869	CGGCG	2	10	190266	190275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_001869	CTCGA	2	10	190404	190413	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.