MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001869	GCGA	2	8	102	109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_001869	GCTG	2	8	558	565	0 %	25 %	50 %	25 %	10803548
3	NC_001869	GGTG	2	8	1158	1165	0 %	25 %	75 %	0 %	10803549
4	NC_001869	GTCT	2	8	1584	1591	0 %	50 %	25 %	25 %	10803550
5	NC_001869	GAAA	2	8	1770	1777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001869	CGGG	2	8	1910	1917	0 %	0 %	75 %	25 %	10803551
7	NC_001869	CCAC	2	8	2216	2223	25 %	0 %	0 %	75 %	10803551
8	NC_001869	CGCT	2	8	2715	2722	0 %	25 %	25 %	50 %	10803551
9	NC_001869	TCGC	2	8	2948	2955	0 %	25 %	25 %	50 %	10803551
10	NC_001869	GCGG	2	8	3856	3863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_001869	TGAA	2	8	5687	5694	50 %	25 %	25 %	0 %	10803556
12	NC_001869	CTTG	2	8	5911	5918	0 %	50 %	25 %	25 %	10803556
13	NC_001869	CATT	2	8	6887	6894	25 %	50 %	0 %	25 %	10803556
14	NC_001869	TTGA	2	8	7606	7613	25 %	50 %	25 %	0 %	10803556
15	NC_001869	GACA	2	8	8566	8573	50 %	0 %	25 %	25 %	10803557
16	NC_001869	ACTA	2	8	8693	8700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_001869	TGCA	2	8	9399	9406	25 %	25 %	25 %	25 %	10803558
18	NC_001869	CACG	3	12	9593	9604	25 %	0 %	25 %	50 %	10803558
19	NC_001869	GCAG	2	8	10307	10314	25 %	0 %	50 %	25 %	10803558
20	NC_001869	ATCC	2	8	10455	10462	25 %	25 %	0 %	50 %	10803558
21	NC_001869	CAAG	2	8	10509	10516	50 %	0 %	25 %	25 %	10803558
22	NC_001869	GAGG	2	8	10544	10551	25 %	0 %	75 %	0 %	10803558
23	NC_001869	ATTC	2	8	11280	11287	25 %	50 %	0 %	25 %	10803558
24	NC_001869	CGAC	2	8	12215	12222	25 %	0 %	25 %	50 %	10803558
25	NC_001869	CGGT	2	8	12871	12878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_001869	CCGT	2	8	13228	13235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_001869	GTAC	2	8	13240	13247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_001869	CTTG	2	8	13344	13351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_001869	AAGA	2	8	13444	13451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001869	GTGA	2	8	13623	13630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001869	TGCT	2	8	13993	14000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_001869	AGCA	2	8	14020	14027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_001869	GGAA	2	8	14254	14261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001869	GACT	2	8	15491	15498	25 %	25 %	25 %	25 %	10803559
35	NC_001869	CGCT	2	8	15545	15552	0 %	25 %	25 %	50 %	10803559
36	NC_001869	GAGC	2	8	15609	15616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_001869	GGAT	2	8	16177	16184	25 %	25 %	50 %	0 %	10803560
38	NC_001869	CACG	2	8	16207	16214	25 %	0 %	25 %	50 %	10803560
39	NC_001869	TTCT	2	8	16855	16862	0 %	75 %	0 %	25 %	10803563
40	NC_001869	TCCG	2	8	16961	16968	0 %	25 %	25 %	50 %	10803563
41	NC_001869	GATT	2	8	17124	17131	25 %	50 %	25 %	0 %	10803563
42	NC_001869	TCGC	2	8	17270	17277	0 %	25 %	25 %	50 %	10803563
43	NC_001869	CCGT	2	8	17490	17497	0 %	25 %	25 %	50 %	10803563
44	NC_001869	CGAA	2	8	18078	18085	50 %	0 %	25 %	25 %	10803565
45	NC_001869	CCGG	2	8	18750	18757	0 %	0 %	50 %	50 %	10803567
46	NC_001869	CTCG	2	8	18768	18775	0 %	25 %	25 %	50 %	10803567
47	NC_001869	TGCT	2	8	19278	19285	0 %	50 %	25 %	25 %	10803568
48	NC_001869	GTCG	2	8	19959	19966	0 %	25 %	50 %	25 %	10803569
49	NC_001869	CTTG	2	8	20843	20850	0 %	50 %	25 %	25 %	10803571
50	NC_001869	GCCC	2	8	21020	21027	0 %	0 %	25 %	75 %	10803571
51	NC_001869	ACAA	2	8	23126	23133	75 %	0 %	0 %	25 %	10803573
52	NC_001869	CGTT	2	8	23528	23535	0 %	50 %	25 %	25 %	10803573
53	NC_001869	GCCG	2	8	23700	23707	0 %	0 %	50 %	50 %	10803573
54	NC_001869	ACGA	2	8	23952	23959	50 %	0 %	25 %	25 %	10803573
55	NC_001869	GTTC	2	8	24116	24123	0 %	50 %	25 %	25 %	10803574
56	NC_001869	CGAT	2	8	25034	25041	25 %	25 %	25 %	25 %	10803575
57	NC_001869	ATTC	2	8	25114	25121	25 %	50 %	0 %	25 %	10803575
58	NC_001869	ATGG	2	8	25737	25744	25 %	25 %	50 %	0 %	10803576
59	NC_001869	CGAA	2	8	26154	26161	50 %	0 %	25 %	25 %	10803576
60	NC_001869	CCCA	2	8	26754	26761	25 %	0 %	0 %	75 %	10803577
61	NC_001869	TGCT	2	8	28429	28436	0 %	50 %	25 %	25 %	10803577
62	NC_001869	GATT	2	8	29323	29330	25 %	50 %	25 %	0 %	10803577
63	NC_001869	CGAG	2	8	29448	29455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_001869	TACA	2	8	29570	29577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_001869	GGAC	2	8	29598	29605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_001869	GTCG	2	8	30199	30206	0 %	25 %	50 %	25 %	10803578
67	NC_001869	TCAC	2	8	30505	30512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_001869	AGCG	2	8	30652	30659	25 %	0 %	50 %	25 %	10803579
69	NC_001869	TTCC	2	8	31943	31950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_001869	TTAG	2	8	32062	32069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001869	TGCT	2	8	32076	32083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_001869	AGCA	2	8	32103	32110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_001869	GTAC	2	8	32856	32863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_001869	ACGG	2	8	32868	32875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_001869	GGCG	2	8	33125	33132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_001869	CACC	2	8	33258	33265	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_001869	CTCC	2	8	33502	33509	0 %	25 %	0 %	75 %	10803580
78	NC_001869	CTGC	2	8	33604	33611	0 %	25 %	25 %	50 %	10803580
79	NC_001869	AGCA	2	8	34906	34913	50 %	0 %	25 %	25 %	10803581
80	NC_001869	CGCC	2	8	35046	35053	0 %	0 %	25 %	75 %	10803581
81	NC_001869	TGGA	2	8	35101	35108	25 %	25 %	50 %	0 %	10803581
82	NC_001869	CGTG	2	8	35274	35281	0 %	25 %	50 %	25 %	10803581
83	NC_001869	TCGC	2	8	35676	35683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_001869	AGGG	2	8	36762	36769	25 %	0 %	75 %	0 %	10803582
85	NC_001869	TCGA	2	8	37087	37094	25 %	25 %	25 %	25 %	10803583
86	NC_001869	TGCC	2	8	37240	37247	0 %	25 %	25 %	50 %	10803583
87	NC_001869	CGAA	2	8	37643	37650	50 %	0 %	25 %	25 %	10803583
88	NC_001869	CACG	2	8	37707	37714	25 %	0 %	25 %	50 %	10803583
89	NC_001869	CGAC	2	8	37877	37884	25 %	0 %	25 %	50 %	10803584
90	NC_001869	AGTG	2	8	38344	38351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001869	TTGA	2	8	38483	38490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001869	ACTT	2	8	38619	38626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_001869	GTAC	2	8	38951	38958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_001869	ATCA	2	8	39615	39622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_001869	CGGC	2	8	39623	39630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_001869	TCAC	2	8	39821	39828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_001869	TGCT	2	8	39927	39934	0 %	50 %	25 %	25 %	10803585
98	NC_001869	TTCG	2	8	40790	40797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_001869	GGGC	2	8	41528	41535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_001869	ACGT	2	8	42677	42684	25 %	25 %	25 %	25 %	10803586
101	NC_001869	CGGC	2	8	43033	43040	0 %	0 %	50 %	50 %	10803586
102	NC_001869	ACCC	2	8	43263	43270	25 %	0 %	0 %	75 %	10803586
103	NC_001869	CGAG	2	8	43500	43507	25 %	0 %	50 %	25 %	10803586
104	NC_001869	ACTG	2	8	43585	43592	25 %	25 %	25 %	25 %	10803586
105	NC_001869	TGAC	2	8	43699	43706	25 %	25 %	25 %	25 %	10803586
106	NC_001869	CGGA	2	8	43839	43846	25 %	0 %	50 %	25 %	10803587
107	NC_001869	GCCG	2	8	44133	44140	0 %	0 %	50 %	50 %	10803587
108	NC_001869	GACC	2	8	44704	44711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_001869	GACG	2	8	45355	45362	25 %	0 %	50 %	25 %	10803588
110	NC_001869	AGTC	2	8	45500	45507	25 %	25 %	25 %	25 %	10803589
111	NC_001869	GTCT	2	8	45651	45658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_001869	TGCG	2	8	46360	46367	0 %	25 %	50 %	25 %	10803590
113	NC_001869	ACCG	2	8	46371	46378	25 %	0 %	25 %	50 %	10803590
114	NC_001869	CGCC	2	8	46691	46698	0 %	0 %	25 %	75 %	10803590
115	NC_001869	CGGC	2	8	46944	46951	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
116	NC_001869	GCCA	2	8	47046	47053	25 %	0 %	25 %	50 %	10803590
117	NC_001869	CGGG	2	8	48804	48811	0 %	0 %	75 %	25 %	10803594
118	NC_001869	CGAG	2	8	49377	49384	25 %	0 %	50 %	25 %	10803595
119	NC_001869	CCGT	2	8	49391	49398	0 %	25 %	25 %	50 %	10803595
120	NC_001869	CGAG	2	8	49724	49731	25 %	0 %	50 %	25 %	10803595
121	NC_001869	ACTG	2	8	50197	50204	25 %	25 %	25 %	25 %	10803596
122	NC_001869	GACG	2	8	50341	50348	25 %	0 %	50 %	25 %	10803596
123	NC_001869	ACGC	2	8	50561	50568	25 %	0 %	25 %	50 %	10803596
124	NC_001869	TCGT	2	8	51341	51348	0 %	50 %	25 %	25 %	10803597
125	NC_001869	GGCC	2	8	51877	51884	0 %	0 %	50 %	50 %	10803597
126	NC_001869	TGGA	2	8	52373	52380	25 %	25 %	50 %	0 %	10803597
127	NC_001869	ACCG	2	8	52683	52690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_001869	CAGA	2	8	54564	54571	50 %	0 %	25 %	25 %	10803601
129	NC_001869	TGCG	2	8	55399	55406	0 %	25 %	50 %	25 %	10803602
130	NC_001869	GCAG	2	8	55688	55695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_001869	CCGA	2	8	55706	55713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_001869	GCCG	2	8	56298	56305	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
133	NC_001869	CGCC	2	8	56658	56665	0 %	0 %	25 %	75 %	10803603
134	NC_001869	CGTC	2	8	56676	56683	0 %	25 %	25 %	50 %	10803603
135	NC_001869	CAGC	2	8	57387	57394	25 %	0 %	25 %	50 %	10803605
136	NC_001869	CGCT	2	8	57473	57480	0 %	25 %	25 %	50 %	10803605
137	NC_001869	GTTT	2	8	57534	57541	0 %	75 %	25 %	0 %	10803605
138	NC_001869	AATG	2	8	57928	57935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001869	CTGG	2	8	57979	57986	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_001869	TGTC	2	8	58018	58025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_001869	TTCA	2	8	58389	58396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_001869	TTAG	2	8	58511	58518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001869	GGAA	2	8	58563	58570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001869	GGGT	2	8	58817	58824	0 %	25 %	75 %	0 %	10803606
145	NC_001869	GCAA	2	8	59296	59303	50 %	0 %	25 %	25 %	10803606
146	NC_001869	CGCT	2	8	59854	59861	0 %	25 %	25 %	50 %	10803606
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