MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001869	GTG	2	6	37	42	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001869	ACC	2	6	71	76	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_001869	CGA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_001869	AAC	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_001869	TTC	2	6	1238	1243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_001869	CGT	2	6	3749	3754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_001869	TTC	2	6	3820	3825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_001869	ACT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_001869	TCC	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_001869	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001869	TCG	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_001869	CAT	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_001869	TGG	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001869	GAA	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001869	CTT	2	6	9026	9031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_001869	TCA	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_001869	TCC	2	6	12464	12469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_001869	GAC	2	6	12528	12533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_001869	CGT	2	6	12563	12568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_001869	GAT	2	6	12585	12590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001869	CGG	2	6	12714	12719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_001869	TGT	2	6	12723	12728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001869	TGG	2	6	12731	12736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001869	CGA	2	6	12755	12760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_001869	GGC	3	9	12784	12792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_001869	GCC	2	6	12794	12799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_001869	GTC	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_001869	TGA	2	6	12936	12941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001869	CGG	2	6	12980	12985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_001869	AAC	2	6	13031	13036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_001869	CAC	2	6	13042	13047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_001869	CAG	2	6	13054	13059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_001869	GTC	2	6	13085	13090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_001869	GCG	2	6	13190	13195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_001869	TCG	2	6	13220	13225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_001869	AGC	2	6	13406	13411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_001869	CTG	2	6	13508	13513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_001869	TTC	2	6	13562	13567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_001869	GTT	2	6	13604	13609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001869	GTA	2	6	13660	13665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001869	CTG	2	6	13699	13704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_001869	CGA	2	6	13869	13874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_001869	AAG	2	6	13963	13968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001869	CGT	2	6	14093	14098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_001869	TCG	2	6	14176	14181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_001869	GCG	2	6	14229	14234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_001869	CTC	2	6	14292	14297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_001869	CCT	2	6	15655	15660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_001869	CGA	2	6	15710	15715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_001869	TAG	2	6	22322	22327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001869	TTC	2	6	22336	22341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_001869	AAG	2	6	22357	22362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001869	ACG	2	6	26182	26187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_001869	CCT	2	6	26521	26526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_001869	ATC	2	6	26534	26539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_001869	AGT	2	6	29442	29447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001869	CCA	2	6	29550	29555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_001869	CTG	2	6	29582	29587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_001869	CGT	2	6	29771	29776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_001869	CTC	2	6	29823	29828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_001869	CAT	2	6	29896	29901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_001869	ATG	2	6	30013	30018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001869	GAG	2	6	31907	31912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001869	GCC	2	6	31968	31973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_001869	CAA	2	6	32188	32193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_001869	TCG	2	6	32229	32234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_001869	CCG	2	6	32241	32246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_001869	ATC	2	6	32313	32318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_001869	CTT	2	6	32366	32371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_001869	TCG	2	6	32382	32387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_001869	CTA	2	6	32437	32442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_001869	TGA	2	6	32446	32451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001869	GAC	2	6	32453	32458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_001869	ACC	2	6	32495	32500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_001869	GAA	2	6	32536	32541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001869	CAG	2	6	32590	32595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_001869	ATC	2	6	32729	32734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_001869	CAG	2	6	32753	32758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_001869	ACG	2	6	32877	32882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_001869	CGC	2	6	32908	32913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_001869	ACT	2	6	32955	32960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_001869	CGA	2	6	33012	33017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_001869	ACG	2	6	33020	33025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_001869	CTG	2	6	33044	33049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_001869	CGT	2	6	33052	33057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_001869	CTG	2	6	33065	33070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_001869	CGC	2	6	33114	33119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_001869	TGG	3	9	33140	33148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001869	CCA	2	6	33230	33235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_001869	GAC	2	6	33236	33241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_001869	CGG	2	6	33303	33308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_001869	GCC	2	6	33315	33320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_001869	CGA	2	6	33365	33370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_001869	CAC	2	6	33373	33378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_001869	GCT	2	6	34373	34378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_001869	AGT	2	6	34444	34449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001869	CCG	2	6	34521	34526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_001869	GCG	2	6	35520	35525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_001869	ACG	2	6	35541	35546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_001869	TGG	2	6	35709	35714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001869	CTG	2	6	35752	35757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_001869	TCG	2	6	35766	35771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_001869	GTT	2	6	35828	35833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001869	TGA	2	6	35860	35865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001869	GCT	2	6	35957	35962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_001869	TGG	2	6	38237	38242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001869	GAG	2	6	38314	38319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001869	GTC	2	6	38320	38325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_001869	TCG	2	6	38375	38380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_001869	CAT	2	6	38398	38403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_001869	CGG	2	6	38475	38480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_001869	GTG	2	6	38495	38500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001869	TGC	2	6	38567	38572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_001869	AAT	2	6	38607	38612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001869	GAG	2	6	38644	38649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001869	CTA	2	6	38653	38658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_001869	CAA	2	6	38726	38731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_001869	AGG	2	6	38749	38754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001869	GCG	3	9	38755	38763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_001869	AAG	2	6	38764	38769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001869	ATG	2	6	38809	38814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001869	CAA	2	6	38855	38860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_001869	CAT	2	6	38905	38910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_001869	CAC	2	6	38911	38916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_001869	GCA	2	6	38942	38947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_001869	AGT	2	6	39092	39097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001869	CGG	2	6	39254	39259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_001869	GCG	2	6	39295	39300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_001869	GCT	2	6	39346	39351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_001869	CAC	2	6	39394	39399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_001869	CTA	2	6	39599	39604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_001869	CGA	2	6	39644	39649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_001869	TCG	2	6	39652	39657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_001869	TCG	2	6	39667	39672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_001869	TCG	2	6	39743	39748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_001869	AAC	2	6	39757	39762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_001869	CAA	2	6	39831	39836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_001869	TCG	2	6	40449	40454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_001869	CGG	2	6	40473	40478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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