MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 2472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001869	TGA	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803548
2	NC_001869	TCG	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803548
3	NC_001869	GAC	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803548
4	NC_001869	TCT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803548
5	NC_001869	GAA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803548
6	NC_001869	CTC	2	6	504	509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803548
7	NC_001869	TTC	2	6	567	572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803548
8	NC_001869	TCG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803548
9	NC_001869	GTC	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803548
10	NC_001869	GGC	2	6	793	798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803548
11	NC_001869	GAT	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803549
12	NC_001869	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803549
13	NC_001869	CTT	2	6	1122	1127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803549
14	NC_001869	GTC	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803549
15	NC_001869	TGA	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803550
16	NC_001869	GTC	2	6	1382	1387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803550
17	NC_001869	GTT	2	6	1422	1427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803550
18	NC_001869	GAG	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803550
19	NC_001869	ATA	2	6	1527	1532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10803550
20	NC_001869	CGA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803550
21	NC_001869	CGC	2	6	1635	1640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803550
22	NC_001869	TGC	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803550
23	NC_001869	ATG	2	6	1740	1745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803550
24	NC_001869	CAG	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803551
25	NC_001869	GGT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803551
26	NC_001869	CGC	2	6	2146	2151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803551
27	NC_001869	CTG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803551
28	NC_001869	CGG	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803551
29	NC_001869	TCG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803551
30	NC_001869	TCC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803551
31	NC_001869	GCG	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803551
32	NC_001869	TCC	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803551
33	NC_001869	GCG	2	6	2348	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803551
34	NC_001869	CGT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803551
35	NC_001869	TGA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803551
36	NC_001869	GCT	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803551
37	NC_001869	GAC	2	6	2571	2576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803551
38	NC_001869	CGT	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803551
39	NC_001869	CAT	2	6	2649	2654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803551
40	NC_001869	GAG	2	6	2694	2699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803551
41	NC_001869	AAC	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803551
42	NC_001869	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803551
43	NC_001869	CGA	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803551
44	NC_001869	TGA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803551
45	NC_001869	GAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803551
46	NC_001869	ACT	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803551
47	NC_001869	CGT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803552
48	NC_001869	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803552
49	NC_001869	GGA	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803552
50	NC_001869	ACG	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803552
51	NC_001869	CGG	2	6	3356	3361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803552
52	NC_001869	CGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803552
53	NC_001869	GTC	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803552
54	NC_001869	GCT	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803552
55	NC_001869	TTC	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803552
56	NC_001869	GGA	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803552
57	NC_001869	TCG	2	6	3586	3591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803552
58	NC_001869	TTG	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803552
59	NC_001869	CCA	2	6	3698	3703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803552
60	NC_001869	TCG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803553
61	NC_001869	CTG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803553
62	NC_001869	TAC	2	6	4317	4322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803553
63	NC_001869	TGG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803553
64	NC_001869	CGA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803553
65	NC_001869	CAG	2	6	4440	4445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803553
66	NC_001869	TAA	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10803553
67	NC_001869	CTA	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803553
68	NC_001869	AGA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803554
69	NC_001869	ATT	2	6	4994	4999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10803555
70	NC_001869	GAC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803555
71	NC_001869	GTC	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803555
72	NC_001869	GTC	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803555
73	NC_001869	CTC	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803555
74	NC_001869	ACC	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803555
75	NC_001869	ATG	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803555
76	NC_001869	GAT	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803556
77	NC_001869	ACA	2	6	5573	5578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803556
78	NC_001869	TGG	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803556
79	NC_001869	GGT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803556
80	NC_001869	TCT	2	6	5639	5644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803556
81	NC_001869	AAG	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803556
82	NC_001869	CGC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803556
83	NC_001869	TTG	2	6	5814	5819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803556
84	NC_001869	CAA	2	6	5857	5862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803556
85	NC_001869	GTC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803556
86	NC_001869	CTG	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803556
87	NC_001869	GTT	2	6	6035	6040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803556
88	NC_001869	TAC	2	6	6175	6180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803556
89	NC_001869	TCT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803556
90	NC_001869	TAC	2	6	6406	6411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803556
91	NC_001869	TCA	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803556
92	NC_001869	TGG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803556
93	NC_001869	TTC	2	6	6502	6507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803556
94	NC_001869	GGA	2	6	6530	6535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803556
95	NC_001869	TGT	2	6	6772	6777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803556
96	NC_001869	TTG	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803556
97	NC_001869	CGG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803556
98	NC_001869	TCT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803556
99	NC_001869	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803556
100	NC_001869	AGT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803556
101	NC_001869	GAG	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803556
102	NC_001869	TCC	2	6	7289	7294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803556
103	NC_001869	TAG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803556
104	NC_001869	TAT	2	6	7408	7413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10803556
105	NC_001869	TCG	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803556
106	NC_001869	GTA	2	6	7458	7463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803556
107	NC_001869	CAT	2	6	7521	7526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803556
108	NC_001869	TAG	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803556
109	NC_001869	GCG	2	6	7706	7711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803556
110	NC_001869	TTG	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803556
111	NC_001869	TTC	2	6	7834	7839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803556
112	NC_001869	CTT	2	6	7878	7883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803557
113	NC_001869	GCA	2	6	7901	7906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803557
114	NC_001869	TCG	2	6	8054	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803557
115	NC_001869	TTC	2	6	8078	8083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803557
116	NC_001869	TCT	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803557
117	NC_001869	GGC	2	6	8164	8169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803557
118	NC_001869	TTC	2	6	8258	8263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803557
119	NC_001869	TTC	3	9	8311	8319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803557
120	NC_001869	CCA	2	6	8402	8407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803557
121	NC_001869	AGA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803557
122	NC_001869	GTT	2	6	8533	8538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803557
123	NC_001869	TCA	2	6	8582	8587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803557
124	NC_001869	TGC	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803558
125	NC_001869	TCG	2	6	9248	9253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803558
126	NC_001869	CAG	2	6	9262	9267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803558
127	NC_001869	TAT	2	6	9295	9300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10803558
128	NC_001869	CAA	3	9	9417	9425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803558
129	NC_001869	AGG	2	6	9446	9451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803558
130	NC_001869	CTG	2	6	9463	9468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803558
131	NC_001869	CTT	2	6	9519	9524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803558
132	NC_001869	ACT	2	6	9530	9535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803558
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258	NC_001869	ACG	2	6	18872	18877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803567
259	NC_001869	TCG	2	6	18881	18886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803567
260	NC_001869	TCC	2	6	18895	18900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803567
261	NC_001869	CGT	2	6	18928	18933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803567
262	NC_001869	TCG	2	6	18986	18991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803567
263	NC_001869	GAC	2	6	18995	19000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803567
264	NC_001869	CGT	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803567
265	NC_001869	CTC	2	6	19096	19101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803567
266	NC_001869	CGA	2	6	19122	19127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803567
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282	NC_001869	CGA	2	6	19610	19615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803569
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288	NC_001869	CCT	2	6	19907	19912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803569
289	NC_001869	GTT	2	6	19920	19925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803569
290	NC_001869	GAC	2	6	19980	19985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803569
291	NC_001869	GAT	2	6	20070	20075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803569
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298	NC_001869	TCA	2	6	20540	20545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803570
299	NC_001869	GGC	2	6	20546	20551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803570
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301	NC_001869	GTC	2	6	20662	20667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803570
302	NC_001869	GAT	2	6	20766	20771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803571
303	NC_001869	TGA	2	6	20852	20857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803571
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379	NC_001869	TCC	2	6	26927	26932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803577
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500	NC_001869	AAC	2	6	37573	37578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803583

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