MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001869	TC	3	6	1278	1283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_001869	AT	3	6	1760	1765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001869	CG	3	6	3732	3737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_001869	AC	3	6	9121	9126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_001869	AG	3	6	13105	13110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001869	TG	3	6	13395	13400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001869	CG	3	6	13571	13576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_001869	AC	3	6	14010	14015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_001869	CA	4	8	14075	14082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_001869	TC	3	6	22288	22293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_001869	AC	3	6	22791	22796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_001869	GC	3	6	30514	30519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_001869	GT	3	6	32088	32093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001869	TC	3	6	32174	32179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_001869	CG	3	6	32527	32532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_001869	TG	3	6	35592	35597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001869	GT	3	6	35802	35807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001869	GC	3	6	35875	35880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_001869	AC	3	6	35937	35942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_001869	CT	3	6	35974	35979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_001869	TG	3	6	38535	38540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001869	AT	3	6	38574	38579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001869	AT	3	6	38611	38616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001869	GA	3	6	38883	38888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001869	CA	3	6	39713	39718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_001869	GA	3	6	39730	39735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001869	GA	3	6	40937	40942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001869	TG	3	6	41092	41097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001869	TC	3	6	41098	41103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_001869	AT	3	6	41577	41582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001869	CT	3	6	52492	52497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_001869	TG	3	6	54447	54452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001869	TA	3	6	57635	57640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001869	TC	3	6	58053	58058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_001869	TC	3	6	60018	60023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_001869	CT	4	8	60203	60210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_001869	GT	3	6	61537	61542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001869	TC	3	6	63284	63289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_001869	TC	3	6	64700	64705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_001869	AT	3	6	64787	64792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001869	AG	3	6	68728	68733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001869	AG	3	6	70085	70090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001869	AG	3	6	71739	71744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001869	TC	3	6	80010	80015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_001869	TC	3	6	80045	80050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_001869	CT	3	6	80183	80188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_001869	GA	3	6	80677	80682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001869	GT	3	6	81116	81121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001869	GT	3	6	82026	82031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001869	CG	3	6	82465	82470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_001869	CA	3	6	82641	82646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_001869	CT	3	6	82931	82936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_001869	AG	3	6	86631	86636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001869	AT	3	6	86737	86742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001869	CG	3	6	88710	88715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_001869	GA	3	6	91987	91992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001869	CT	3	6	96927	96932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_001869	GA	3	6	97654	97659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001869	CT	3	6	101406	101411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_001869	GT	3	6	101486	101491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001869	TC	3	6	101572	101577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_001869	CG	3	6	101925	101930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_001869	TG	3	6	102909	102914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001869	TC	3	6	103297	103302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_001869	GT	3	6	105615	105620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001869	TC	3	6	105701	105706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_001869	CG	3	6	106054	106059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_001869	CA	3	6	112673	112678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_001869	AG	3	6	114303	114308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001869	AT	3	6	115048	115053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001869	AT	3	6	115590	115595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001869	GA	3	6	115599	115604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001869	TG	3	6	115690	115695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001869	CT	3	6	115764	115769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_001869	GT	3	6	116739	116744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001869	GT	3	6	116762	116767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001869	CT	3	6	116998	117003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_001869	CA	3	6	117078	117083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_001869	TC	3	6	123951	123956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_001869	AC	3	6	123986	123991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_001869	AT	3	6	124134	124139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001869	CT	3	6	127050	127055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_001869	AC	3	6	127425	127430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_001869	GT	4	8	127545	127552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001869	GT	3	6	131412	131417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001869	TA	4	8	135732	135739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001869	TA	4	8	140831	140838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001869	CT	3	6	141727	141732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_001869	CG	3	6	143422	143427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_001869	GA	3	6	143775	143780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001869	AC	3	6	143861	143866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_001869	AC	3	6	145151	145156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_001869	GC	4	8	148082	148089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_001869	AT	3	6	148794	148799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001869	GT	3	6	150921	150926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001869	TC	3	6	151007	151012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_001869	CG	3	6	151360	151365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_001869	TC	3	6	152767	152772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_001869	CT	3	6	154656	154661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_001869	TA	3	6	158596	158601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001869	AG	3	6	158683	158688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001869	GA	3	6	160100	160105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001869	AC	3	6	161847	161852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_001869	AG	4	8	163179	163186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001869	GA	3	6	163366	163371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001869	GA	3	6	165331	165336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001869	AT	3	6	165748	165753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001869	CA	3	6	168937	168942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_001869	AG	3	6	170892	170897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001869	AT	3	6	181807	181812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001869	GA	3	6	182286	182291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001869	CA	3	6	182292	182297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_001869	TC	3	6	182447	182452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_001869	TC	3	6	183654	183659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_001869	TG	3	6	183671	183676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001869	TC	3	6	184501	184506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_001869	TA	3	6	184758	184763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001869	AT	3	6	184773	184778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001869	AT	3	6	184810	184815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001869	AC	3	6	184848	184853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_001869	AG	3	6	187410	187415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001869	GT	3	6	187447	187452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001869	GC	3	6	187509	187514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_001869	AC	3	6	187582	187587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_001869	CA	3	6	187792	187797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_001869	CG	3	6	190857	190862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_001869	GA	3	6	191210	191215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.